New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 2882232 = | 92 (0.990) | 3 (0.040) | 3/394 | NT | 3.6% | coding (404/483 nt) | casB | CRISP RNA (crRNA) containing Cascade antiviral complex protein |
? | NC_000913 | 2882250 = | 77 (0.910) | coding (386/483 nt) | casB | CRISP RNA (crRNA) containing Cascade antiviral complex protein |
TTTGACTTGAAATTCTTACTCGTCTTTTGCCGCCGAAAATAGCGTCTTTCTGCATGTTCATATCGTCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCT‑AAAG‑CTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGCTCCGATTTTTTGTCCTGATGTCGGATGACATTCTTTCCTGCG‑CT‑CAGGCAAAACACCATGCGCAAAAGAGCCTGCTGGTGACGTGGGTTTTC > NC_000913/2882014‑2882488 | tttGACTTGAAATTTTTACTCGGCTTTTGCCGACGAAAATAGCGTCTTTCTGCATTTTCATAGCGTCGCGGTTCAGACATGAATGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTc < 2:239259/238‑1 (MQ=255) 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tagttttttttTGTATTTTCATTTCGTCTCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGATAGATCAGAACCTGAATATTGATAAATGTAGACATGGAAAGGTTTCCTTACGCATTTGTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTgg < 2:360669/232‑1 (MQ=255) tagctgttttCTTCATGTTCATATCGTCGGGGTTAAGGACTGAAGGGCTGTGAGAAACCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTgg < 2:938275/232‑1 (MQ=255) tAGCGTCTTTCTGCATGTTCATATCGTCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTgg < 1:152743/239‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |