Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,712,473 | 0 | A | G | 6.1% | 380.9 / 2.1 | 146 | L154P (CTC→CCC) | yhjY | autotransporter beta‑domain protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (71/56); new base G (9/4); total (85/61) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.96e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
TTAAAATCTGGCGCTAACCCCCATCGTATACAGATAGTCGCTATTATTAGTGGTATTTTCTGCCTGAGTTAGCGCGGCATAGGCGGCAATATTTTGATTGAGCAACATATCAGCGCCTACGGTGACATCCAGCCAGTTGCCGTTCTGGTTTGTCGCCGTCATCCGGCTCAGGCCTGATTGCGCCTTCCAGATATTCTCGCCAAATTGCTGGTTATAGCTGATTTGCGCCCA‑GGGTCGGAGATCGC‑CAAGCCGGGAGTCAACACGCCAGCCTAAGGTACTCACGCTGGCATGCCATAACGGATCGGTCAGCGTGGTAGTACTGTCGCCAAACTCGTTATACATCGAGGTGGTTGTGCCATCGTAATGTAATGCCGCGACCGGGCCGGTTGTAACCTGTTCATATAAAGGAAAATTCCAGCCCATACTCATACTGCTGGTCACATCCACAGGGGTTTCTTCCGCCAGATT > NC_000913/3712235‑3712702 | ttAAAATCTGGGCTTAACCCCCATCGTATACAGATAGTTGCTATTATTTGTGGTATTTTCTGCCTGAGTTAGCGGGGCATAGGCGGCAATATTTTGATTGAGCAACATATCAGCGCCTACGGTGACATCCAGCCAGTTGCCGTTCTGGTTTGTCGCCGTCATCCGGCTCAGGCCTGATTGCGCCTTCCAGATATTCTCGCCAAATTGCTGGTTATAGCTGATTTGCGCCCA‑GGGTCGga < 2:300881/239‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |