Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 635,136 | 0 | C | T | 11.5% | 224.7 / 3.2 | 78 | E81K (GAA→AAA) | ybdM | Spo0J family protein, ParB‑like nuclease domain |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (26/42); new base T (7/3); total (33/45) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.63e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GGTGATTTGATGGCGTCCACGAGCGCGATTATGACGAATAGTCGCGGCGATGCGTTGATTACGCGTACCTTCCAGACAGGTCACCGGCAAATAACCTTTTAAGCGTAATTTTAATGATGATGAGCCTTTACCAATTTCATGGCGGTGAAAAC‑CATCCACGATTTCCATGGCATTTTTATCCGTATGTGTG‑ACC‑A‑CAATGGGTTGGGTAAAACCATCTATTTCAA‑TGGATTTTTGCAGCAGTTTTTTTTCGGGTGGTGCCACGTTGTTTGGGTTGTAATC‑ATTAGGCATAAG‑TTGGCT‑G‑TTTTTAACCCACAGAACGCAATCCACTGGCTCTTCACGAAAGGGGCTAACCTGATGGATCGCCATGCGGATTTCATTAATCGCTTTGATGCGATCATCTTCCGGCAAGCTGGCGAGAAATTGCGTTAAATCCTGCGTTAATCGTTGTTGCATAGTATCCCCC > NC_000913/634915‑635374 | ggTGATTTGAAGGCGTCCACGAGCGCGATTATGGCGAATAGTCGCGGCGATGCGTTGATTACGCGTACCTTCCAGACAGGTCACCGGCAAATATCCTTTTAAGCGTAATTTTAATGATGATGATCCTTTACCAATTTCATGGCGGTGAAAAC‑CATCCACGATTTCCATGGCATTTTTATCCGTATGTGTG‑ACC‑A‑CAATGGGTTGGGTAAAACCATCTATTTCAA‑TGGATTTTTgcagc < 1:600512/238‑1 (MQ=255) 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cgggATTAAGAACAATAGTCGCGGGTATGGGTTGATTACGCGTACCTTCCAGACAGGTCACCGGCAAATAACCTTTTAAGGGTAATTTTAATGATGATGGGCCTTTACCAATTTCATGGCGGTGAAAAC‑CATCCACGATTTCCATGGCATTTTTATCCGTATGTGTG‑ACC‑A‑CAATGGGTTGGGTAAAACCATCTATTTCAA‑TGGATTTTTGCAGCAGTTTTTTTTCGGGTGGTGCCa < 1:1061632/234‑1 (MQ=255) gcgATTATGACGAATAGGCGCGGCGATGCGTTGATTACGCGTACCTTCCAGACAGGTCACCGGCAAATAACCTTTTAAGCGTAATTTTAATGATGATGAGCCTTTACCAATTTCATGGCGGTGAAAAC‑CATCCACGATTTCCATGGCATTTTTATCCGTATGTGTG‑ACC‑A‑CAATGGGTTGGGTAAAACCATCTATTTCAA‑TGGATTTTTGCAGCAGTTTTTTTTCGGGTGGTGCCACg < 1:368577/238‑1 (MQ=255) cgATTATGACGAATAGTCGCGGCGATGCGTTGATTACGCGTACCTTCCAGACAGGTCACCGGCAAATAACCTTTTAAGCGTAATTTTAATGATGATGAGCCTTTACCAATTTCATGGCGGTGGAAACACAT‑CACGAGTTCCATGTGACTTTTTTTCTCAT‑TGTGTACC‑C‑CAAAGTGTTGGGGGAAACCCCCTCTTTTTA‑TGTGGTTTTTCAGCAGTTTTTTTTTGGGGGGGGGCCCgtt > 2:350974/1‑239 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |