| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,196,305 | C→T | R395C (CGT→TGT) | icd → | isocitrate dehydrogenase, e14 prophage attachment site, tellurite reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,196,305 | 0 | C | T | 97.6% | 228.9 / NA | 85 | R395C (CGT→TGT) | icd | isocitrate dehydrogenase, e14 prophage attachment site, tellurite reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); major base T (49/32); minor base A (2/0); total (52/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.20e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
AGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTT > NC_000913/1196165‑1196444 | aGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGGGCAATCACCGCGAGAACCGTAACCTATGACTTCGAgtgt > 1:217312/1‑143 (MQ=255)aGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAgtgt < 1:400726/143‑1 (MQ=255) ggACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTc < 2:541445/143‑1 (MQ=255) ggACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTc > 1:178219/1‑143 (MQ=255) gACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCGACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCt > 1:604732/1‑143 (MQ=255) gACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCt > 1:239830/1‑143 (MQ=255) cAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAGGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTga < 1:532403/143‑1 (MQ=255) cAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGCGTGTCTga > 1:918742/1‑143 (MQ=255) cAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTga < 1:1116239/143‑1 (MQ=255) cAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTga < 1:662384/143‑1 (MQ=255) cAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTga < 1:476677/143‑1 (MQ=255) aaaGTAAATCCTGGCTCTATCATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCCACGCAAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTgat < 1:1200909/143‑1 (MQ=255) aGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTgatgg > 1:719247/1‑143 (MQ=255) gTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGCGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCCATCACTCCGACCGTCCgctgga > 2:80211/1‑143 (MQ=25) gTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTgatgga > 1:987429/1‑143 (MQ=255) tCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGgcg > 1:395277/1‑143 (MQ=255) ccTGGCTCTATTATTCGCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGgcgc < 1:196965/143‑1 (MQ=255) tGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGGCATCAACGCGGAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTa > 1:1188170/1‑143 (MQ=255) tctATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTACCCTATGACTTCGAGTATCTGATGGATGGCGCTAAAct > 2:614047/1‑143 (MQ=255) tctATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTACGACTTCGAGAGTCTGATGGAGGGCGCTAAAct > 2:466557/1‑143 (MQ=255) ctATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAATGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAGAACCGTAACCTATAACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAActg < 1:172707/143‑1 (MQ=255) attattCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAActgct > 2:127941/1‑143 (MQ=255) attattCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAActgct > 1:284288/1‑143 (MQ=255) ttattCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAActgctg < 1:987228/143‑1 (MQ=255) ttattCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAActgatg > 1:696315/1‑143 (MQ=255) ctctcCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATg > 1:57509/1‑143 (MQ=255) ctcCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTCAACTGCTGAAATGtt > 1:185260/1‑143 (MQ=255) ctcCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCCAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGtt > 2:330467/1‑143 (MQ=255) gCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAAACTTAAATAGCGTTTGGCTGATGGATGACGCTAAACTGCTGAAATATTCaga > 2:711644/1‑143 (MQ=18) tGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGACGGCGCAAACACCGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGt > 1:857554/1‑143 (MQ=255) agaTGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAGAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGttt > 1:759887/1‑143 (MQ=255) agaTGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGttt > 1:95073/1‑143 (MQ=255) atgatgCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTgg > 1:812153/1‑143 (MQ=255) tgatgCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGt < 1:484921/143‑1 (MQ=255) gatgCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGGTTGGTg > 2:367903/1‑143 (MQ=255) gatgCTGCGCCACATGGGTAGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCCGAAATGTTCAGCGTTTGGTg > 2:1130227/1‑143 (MQ=255) acgctgcGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGACTTACTTAATGGTTAAAGGTATGGGAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGa < 1:810241/141‑1 (MQ=18) gctgcGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACGTCGAGAGTCTGATCGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAcg > 2:1038026/1‑143 (MQ=255) tgcGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGCGTTTGGTGAcgcg > 2:333725/1‑143 (MQ=255) gcgcCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGCCGGGTCGAGACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGa > 2:526139/1‑143 (MQ=18) aTGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGACGGTGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGCTTGGTGACGCGATCATCGa > 2:772194/1‑143 (MQ=255) tGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGaa < 1:888016/143‑1 (MQ=255) ttGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCACTCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGGGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGCTTGGTGACGCGAGCATCGCGAACa > 2:834309/1‑143 (MQ=18) ttgACCGAAGCCGCTGGCTTAATTGGTAAAGGGATGGCAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACAt < 2:407163/141‑1 (MQ=18) aCCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTa > 2:936865/1‑143 (MQ=255) ccGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTaa > 2:278186/1‑143 (MQ=255) aGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGcc < 1:125557/143‑1 (MQ=255) tGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGtt > 2:1151778/1‑143 (MQ=255) tGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGtt > 2:126613/1‑143 (MQ=255) ttAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACCTGTAATGCCGTCGCTTGtt > 1:262490/1‑143 (MQ=255) ttAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTACTGCCGTAGTTTGtt > 1:947917/1‑143 (MQ=255) ttAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGtt > 1:458123/1‑143 (MQ=255) aaTTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAACTGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTaa > 1:1187311/1‑143 (MQ=255) aaTTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGACAACAGTTAATGACGTAGTTTGTTac > 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gTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGAGGGCGCTCCACAAACAAAATGTTCAGAGTTTGGAGACCCGATCACCGAAAACATGTAATGCCGTCGCTTGTTACATTTATTAACg > 2:1044614/1‑143 (MQ=18) gtgAAGGCGCAATCAACGCGTAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGa < 2:696315/141‑1 (MQ=255) gAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGc < 2:178219/143‑1 (MQ=255) gAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGGTTGTTAAATTTATTAACGGGGGc > 2:545414/1‑143 (MQ=255) cAATCAGCGCGAGAACCGTCACCTTTGACTTGGGGGGTCAGAAGAATGGCGCTAAACTGCTGAAGTGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGc < 2:526213/143‑1 (MQ=25) aaTCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGGGCGTAACGcg > 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aaagCCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACGGCGGAAATGTTCAGAGTTTGGCGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCGCCCGTTGttt < 2:633637/143‑1 (MQ=25) aaaCCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGtttt > 1:296785/1‑143 (MQ=255) aaCCGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCAGTTGttttt > 1:994766/1‑143 (MQ=255) aCCGTATCCTATGACTTCGAGTGTTTGATTGATGGCGCTAAACGGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAGATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGtttttt < 1:569965/143‑1 (MQ=25) aCCGTAACCGATGACTTCGAGTGTGTGATGGCTGTCTCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATAGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTACCGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGtttttt < 1:755676/143‑1 (MQ=25) ccGTAACCTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTg > 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cTATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCAATAAACAGCTGAAATGTTCAGAGTTTCGTGACGCGATCATCGAACACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAATTTTATTCACGGGAGAGTACAGCCCACGTTGCTTTTTGATAGgct > 2:325940/1‑143 (MQ=21) tATGACTTCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGAGGCGTAGCGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGgctg > 1:39002/1‑143 (MQ=255) cggACTTGGGGTGTCTGGTGGATGGCGCTAAACTGCGTAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAAGGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCCCCCGTTGTTTTTTGTTAGgctgc < 2:1187311/141‑1 (MQ=37) gcTTCGAGTGGCTGATGGATGGCGCGAAACTGCTGAAAATTTTTGAGTTTTGTGAAGAGAGCATGAAGAGCATGTAATGCCGTAGTTTGTTAATTTTATTATCGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTaa < 1:747028/142‑1 (MQ=255) ttCGAGTGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACg > 1:725425/1‑143 (MQ=255) gAGTGTCTGATGGATGGCGCTATACGGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGtt < 1:969301/143‑1 (MQ=255) | AGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAGCGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTT > NC_000913/1196165‑1196444 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |