| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,184,542 | C→A | P1100Q (CCG→CAG) | rpoB → | RNA polymerase, beta subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,184,542 | 0 | C | A | 97.2% | 207.8 / NA | 74 | P1100Q (CCG→CAG) | rpoB | RNA polymerase, beta subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/2); new base A (34/36); total (34/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.95e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
TCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCCGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGC > NC_000913/4184402‑4184682 | tCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGc > 2:470470/1‑143 (MQ=255) ggTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGCAAACCGCACGCCGGTAG‑CCATCGTACTGAACCAGCACGGCg > 1:595790/1‑143 (MQ=255) ggTTAAACGCCGTATCCAGCCAGGAGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAAAGCAACCCTTTCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCAGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCg > 1:938080/1‑143 (MQ=255) tAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTAc > 1:9301/1‑143 (MQ=255) aCGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGt > 1:131308/1‑143 (MQ=255) ccgtaccagtccTGGTGAAAAGATGGCAGGACGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACAACACACTCTTTCAGTTGGGCGTACCGtctc < 1:706837/133‑1 (MQ=255) ccGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGtctc > 2:576751/1‑143 (MQ=255) cGTAGCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCg < 2:376254/143‑1 (MQ=255) tagccAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGAGATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTa < 1:331687/140‑1 (MQ=255) aactagcgtcgagACAAGATGGCAGCTGGTCACGGTAACAATGGTGTACTTTCTAAGATCAACCCGATAGAAGATATGCCTCACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTAt < 1:797356/131‑1 (MQ=255) tCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATg < 2:1044239/143‑1 (MQ=255) aGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACACCGTACTGAACCAGCGGGGCGTACCGTCTCGTATGAAc > 1:536742/1‑143 (MQ=255) cTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCGGATCGAAGATATGGCTTAAGATGAAAACGGTACGGCGGTAG‑ACAGCGTACTGAAGCAGGTGGGCGTAACGTCGCGTAttagaatg > 2:92328/1‑136 (MQ=255) cTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACAGCGTACTGAACCAGGTGGGCGTACCGTCTGGTATGAACAtt > 2:92329/1‑142 (MQ=255) tGGTGACTATATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGTGTGTAATTTCTAAGATCATCCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCg < 1:387283/143‑1 (MQ=255) tGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGGTGACCCCGATCGAAGATATGCCTTACGAAGAAAACGGTACGCCGGTAC‑ACACCGGACTGGACCAGGTGGGCGTGCCGTCTCGCATGAACAACg > 1:933357/1‑143 (MQ=255) gTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGCGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGt > 1:997656/1‑143 (MQ=255) tGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTc < 2:755969/143‑1 (MQ=255) ggACAAGATGGGAGGTCGTTATGGGAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGGACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTc < 2:605831/142‑1 (MQ=255) aGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATc < 1:474876/143‑1 (MQ=255) aGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATc < 2:1001914/143‑1 (MQ=255) aTGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACAGTAGTCCGGACGAACCTC‑TCTTGAACCAGCTGGGCGTAACGGCTCGTAGGAACATAggggcgatccc > 1:243290/1‑134 (MQ=255) tGGCAGGTCGTCACGGTATCAAGGGTGTAAGTTCTAAGATCCACCCGATCGACGGTTAACCATGGCTTTTAAACGGTATGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTc < 2:844923/143‑1 (MQ=255) tGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTc < 2:9301/143‑1 (MQ=255) ggCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCg > 1:1153457/1‑143 (MQ=255) gggTCGTCACGGTAACTACGGTGTAATTTCTCAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACTGTACGCCGGTAG‑ACAGCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGaaa < 1:57033/142‑1 (MQ=255) ggTCGTCACGGGAACAAGGTTGGAGTTTTTAAGAGCAGCCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGGCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAAc < 1:973697/143‑1 (MQ=255) gtcgtcAGGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCTGTCGAAGATATGCCTTACGAAGGCACAATAACACCTTTAG‑GAATATTCGCTCAGTGGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAAcc < 2:1154405/143‑1 (MQ=255) cgtcACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCa < 1:159950/143‑1 (MQ=255) gtcACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGCACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCAc > 1:1098282/1‑143 (MQ=255) aaCAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTAt < 1:804091/143‑1 (MQ=255) aaCAAGGGTGTAATTTCCACCATCAACCCGATGGAAGATATGCCTTACGATTAAAACGGCACGCCGGTAC‑ACATCGTACTGACCCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTAt < 2:94098/143‑1 (MQ=255) aaCAAGGCCGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTAt < 2:500191/143‑1 (MQ=255) aCAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATACTCGAAACCGACCTTGGTATg > 1:922168/1‑143 (MQ=255) aCAAGGGTGTAATTACTAAGAGCCACCCGATCGCTGTTAAAATGAGCTACGAAAACGGTACGCCGGTAG‑CCATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATg < 2:259190/143‑1 (MQ=255) cAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACGCGATCGAAGATATGCCTTCCGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAGACCCACCTGGGTATgg > 2:1041590/1‑143 (MQ=255) aaGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTAGGTCTGGc > 1:799643/1‑143 (MQ=255) ggagtACTTTCTAATACCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAACACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGATCCCGCTGGTCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATTCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGc < 1:172240/140‑1 (MQ=255) tgtAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGa > 1:410846/1‑143 (MQ=255) gtAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGaa > 2:12259/1‑143 (MQ=255) tAATTTCTTATATCATCCCGATCTATGATATGCCTTACGACGAATACGTTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTTGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGaaa < 1:622452/143‑1 (MQ=255) tAATTTCCAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCACCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGaaa < 2:809448/143‑1 (MQ=255) tAATCTCTAAGATCACCCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGaaa < 2:823168/143‑1 (MQ=255) aaTTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAg < 2:660268/143‑1 (MQ=255) aaTTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGAATGGCTGCGAAAg > 1:847546/1‑143 (MQ=255) aaGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACATGGGTGTGCCTGGCAAAGGGATCgg > 2:493567/1‑143 (MQ=255) gATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCCCCTGGGTGTGGCTGCGAAAGGTCTCGGCg > 1:537834/1‑143 (MQ=255) cccAACCCCATCGAAGAGATGCATTACCATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACGCGCTGGGCATACCGTCTCGTATGCACATCGGTAAGATCCTCGCCCCCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGa < 1:494901/141‑1 (MQ=255) aTCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGa > 2:901295/1‑143 (MQ=255) caccccGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACa < 2:733699/140‑1 (MQ=255) aCCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAg < 2:1065600/143‑1 (MQ=255) aCCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGCGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAg < 1:870772/143‑1 (MQ=255) cccGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGa < 1:384199/143‑1 (MQ=255) ccGATCGAAGATATGCCTTGCGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGAt < 1:913973/143‑1 (MQ=255) tctaaGATTTGCCTTACGATGAATATGGTATGTTGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGTGTACCGTCTCGTATGAACATTGGTCAGATCCTCTAAACCCACCTGGGTATGGCTGTGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAAc < 1:52220/140‑1 (MQ=255) tCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAAc < 2:1056878/143‑1 (MQ=255) gagatGCCTGACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTAGGAACAGCGGTCAGAGCCTCGAAACCCACCTGGGGATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCAt < 1:457155/140‑1 (MQ=255) ctcccGATGACACCGGCCCGCCGGCAG‑ACATCGTACTGCCCCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCATATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGaaa < 2:9673/139‑1 (MQ=255) cTTACGATGAACACGGTACGCCGGTAG‑CCACCCTACCGCAGCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGaaa < 1:621456/143‑1 (MQ=255) cTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGaaa > 2:1125577/1‑143 (MQ=255) cTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGaaa > 2:1107160/1‑143 (MQ=255) ttACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCAGCGCCCACATCAACGcagtggtgggac > 1:393596/1‑132 (MQ=255) tACGATGAAAACGGTACTCCGGTAG‑ACAGCGTACTGAACCAGCGGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAAca < 1:632714/143‑1 (MQ=255) cGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGCTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGAGACAGGTGTCGGCGACGAGATCGAGGCCCGGCTGAAAcacc > 1:923043/1‑141 (MQ=255) gATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAAcagca > 1:390272/1‑143 (MQ=255) aTGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAAcagcag > 2:337416/1‑143 (MQ=255) aaaaCGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGCAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAAACgcagcac > 1:852426/1‑142 (MQ=255) aaaCGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGCACATCGGTCAGATCCCCGGAACCCCCCCGGGTATGGCTGCGACAGGTATCGGCGGCAAGATCGAGGCCATGCAGACACACGAGCaag > 1:452209/1‑143 (MQ=255) caCGTCGGTAG‑ACAGCGTACTGTACCAGCTGGGCGCACCGTCTCGTATGAACAGCGGTCAGACCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTcg < 2:680949/142‑1 (MQ=255) ccGGTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACATGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGAGCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGACGCGaa > 2:455521/1‑143 (MQ=255) gTAG‑ACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCGTGCAGAAACAGCAGCACGGACACGCGAAACt > 1:877330/1‑143 (MQ=255) g‑ACCTCGTACTGAACCAGCTTGGCGTACCGCCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTgcg < 1:350641/143‑1 (MQ=255) tCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAGGACGCGAGACGGCGCGaa > 1:642543/1‑143 (MQ=255) tCGTACTCAACTGGCTGGGCCTACCGTCTCTTCTGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGaa < 1:1117010/143‑1 (MQ=255) cccGCCGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAgc < 2:297585/143‑1 (MQ=255) | TCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAG‑ACATCGTACTGAACCCGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGC > NC_000913/4184402‑4184682 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |