| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 100,875 | Δ1 bp | 4.0% | coding (111/1476 nt) | murC → | UDP‑N‑acetylmuramate:L‑alanine ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 100,874 | 0 | A | . | 4.0% | 346.7 / 3.3 | 100 | coding (110/1476 nt) | murC | UDP‑N‑acetylmuramate:L‑alanine ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (48/47); new base . (2/2); total (51/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
GCCCGCGCTGCATCCATTCCGGATGCCACCGAGCGAGTGGCAAATGAAGTGAGCCGGGTTGCCCGGGCGTAATTGTAGCGATGCCTTTTGCATCGTATGAATTTAAGAAGTTAATGGCGTAAAGAATGAATACACAACAATTGGCAAAACTGCGTTCCATCGTGCCCGAAATGCGTCGCGTTCGGCACATACATTTTGTCGGCATTGGTGGTGCCGGTATGGGCGGTATTGCCGAAGTTCTGGCCAATGAAGGTTATCAGATCAGTGGTTCCGATTTAGCGCCAAATCCGGTCACGCAGCAGTTAATGAATCTGGGTGCGACGATTTATTTCAACCATCGCCCGGAAAACGTACGTGATGCCAGCGTGGTCGTTGTTTCCAGCGCGATTTCTGCCGATAACCCGGAAATTGTCGCCGCTCATGAAGCGCGTATTCCGGTGATCCGTCGTGCCGAAATGCTGGCTGAGTTAAT > NC_000913/100640‑101111 | gcCCGCGCTGCATGCATTCCGGATGTCACCGAGCGAGTGTCACATTAAGTGAGCCGGGTTCCCCGGGCGTAATTGTAGCGATGCCTTTTGCATCGTATGAATTTAATAAGTTAATGGCGTAAAGAATGAATACACAACAATTGGCAAAACTGCGTTCGATCGTGCCCGAAATGCGTCGCGTTCGGCACATACATTGTGTCGTCATTGGTGGTGCCGGTATGGGCGGTATTGCCGAAGtt < 2:827863/239‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |