New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 285874 = | 77 (0.770) | 3 (0.030) | 3/414 | NT | 4.1% | coding (480/1383 nt) | yagG | CP4‑6 prophage, putative sugar transporter |
? | NC_000913 | 285896 = | 68 (0.710) | coding (502/1383 nt) | yagG | CP4‑6 prophage, putative sugar transporter |
CTGCGTGCTGACCTTCTACACGCCGGACTTCTCCGCA‑CAGGGCAAGATCATCTACGCCTG‑CGTGACCTACATTCTCCTGACCCTGGTCTACACCTTCGTTAACGTGCCGTAC‑TGCGCCATGCCGGGCGTCATCACCGCCGACCCGAAAGAGCGTCACGCCCTGCAGTCCTGGCGCTTCTTCCTGGCGGCGGCGGGCTCGCTCGCTATCAGCGGCATCG‑CGCTGCCGCTGGTGAGCATCATCGGCAAAGGGGACGAGCAGGTGGGCTACTTCGGCGCCATGTGCGTGCTGGGGCTGAGCGGCGTGGTGCTGCTCTACGTCTGCTTCTTCACGACCAAAGAGCGCTACACCTTTGAGGTGCAGCCGGGCTCGTCGGTGGCGAAAGACCTTAAGCTGCTGCTGGGCAACAGCCAGTGGCGCATCATGTGCGCGTTCAAGATGATGGCGACCTGCTCCAACGTGGT > NC_000913/285667‑286128 | cagCGTGCAGGCCTTCTACACGCGGGCCTTCTCCGCG‑CAGGGCAAGATCATCTACGCCTG‑CGTGACCTACATTCTCCGGCCCCTGGTCTACACCTTCTTCAACGTGCCGTAC‑TGCGCCATGCCGGGCGTCATCACCGCCGACCCGAAAGAGCGTCACGCCCTGCAGTCCTGGCGCTTCTTCCTGGCGGCGGCGGGCTCGCTCGCTATCAGCGGCATCG‑CGCTGCCGCTGGTGAGcatca < 2:186773/237‑1 (MQ=255) ttgaacgcgcacatgatgcgccactggctgttgcccagcagcagcttaaggtctttcgccaccgacgagcccggctgcacctcaaaggtgtagcgctctttggtcgtgaagaagcagacgtagagcagcaccacgccgctcagccccagcacgcacatggcgccgaagtagcccacctgctcgtcccctttgccgatgatgctcacCAGCGGCAGCG‑CGATGCCGCTGGTGAGcatcat > 1:528909‑M1/207‑239 (MQ=255) cggACCTGCTCCCCGCC‑GACTTGCCCGCAGCGGGGCACTATCATCACCGCCTG‑CGGGACGTCGTTCCTCCTGTCCAGGGTCTACGCCTCGGTTAA‑GTGGCGGACTTGCGCCATGCCGGCGGCCAGCACCGCCGACCCGAAAGAGCGTCACGCCCTGCAGTCCTGGCGCTTGTTCCTGGCGGCGGCGGGCTCGCTCGCTATCAGCGGCAGCG‑CGCTGCCGCTGGTGAGCATCATCGGCaa < 2:4667/237‑1 (MQ=255) cTTCTACACGCCGGACTTCTCCGCA‑CAGGGCAAGATCATCTACGCCTG‑CGTGACCTCCATTCTCCTGACCCTGGTCTACACCTTCGTTAACGTGCCGTAC‑TGCGCCATGCCGGGCGTCATCACCGCCGACCCGAAAGAGCGTCACGCCCTGCAGTCCTGGCGCTTCTTCCTGGCGGCGGCGGGCTCGCTCGCTATCAGCGGCATCG‑CGCTGCCGCTGGTGAGCATCATCGGCAAAgggg < 1:148506/239‑1 (MQ=255) cGCCGGACTTCTCCGCA‑CAGGGCAAGATCATCTACGCCTG‑CGTGACCTACATTCTCCTGACCCTGGTCTACACCTTCGTTAACGTGCCGTAC‑TGCGCCATGCCGGGCGTCATCACCGCCGACCCGAAAGAGCGTCACGCCCTGCAGTCCTGGCGCTTCTTCCTGGCGGCGGCGGGCTCGCTCGCTATCAGCGGCATCG‑CGCTGCCGCTGGTGAGCATCCTCGGCCAAGGGGACGAGCAg > 2:1055273/1‑239 (MQ=255) cgccgccGCA‑CGGTGCAAAATGATC‑GCGCCTGCCGGGACCTCCAGCCCCCTGACCCTGGTCTACCCCTTCGTTACGGGGCCGTGC‑TGCGCCAGGCCGGCCGTCGCCACCGCCGACCCGAAAGAGCGTCACGCCCTGCAGTCCTGGCGCTTCTCCCTGGCGGCGGCGGGCTCGCTCGCTATCAGCGGCATCG‑CGCTGCCGCTGGTGAGCATCATCGGCAAAGGGGACGAGCAGGTGGGc < 2:549028/233‑1 (MQ=255) cGCA‑CAGGGCAAGATCATCTACGCCTG‑CGTGACCTACATTCTCCTGACCCTGGTCTACACCTTCGTTAACGTGCCGTAC‑TGCGCCATGCCGGGCGTCATCACCGCCGACCCGAAAGAGCGTCACGCCCTGCAGTCCTGGCGCTTCTTCCTGGCGGCGGCGGGCTCGCTCGCTATCAGCGGCCTCG‑CGCTGCCGCTGGTGGGCATCATCGGCAAAGGGGACGAGCAGGGGGGCTACTCCg > 2:181287/1‑239 (MQ=255) cGCA‑CAGGGCAAGATCATCTACGCCTG‑CGTGACCTACATTCTCCTGACCCTGGTCTACACCTTCGTTAACGTGCCGTAC‑TGCGCCATGCCGGGCGTCATCACCGCCGACCCGAAAGAGCGTCACGCCCTGCAGTCCTGGCGCTTCTTCCTGGCGGCGGCGGGCTCGCTCGCTATCAGCGGCATCG‑CGCTGCCGCTGGTGAGCATCATCGGCAAAGGGGACGAGCAGGTGGGCTACTTCg > 1:970666/1‑239 (MQ=255) cGCA‑CAGGGCAAGATCATCTACGCCTG‑CGTGACCTACATTCTCCTGACCCTGGTCTACACCTTCGTTAACGTGCCGTAC‑TGCGCCATGCCGGGCGTCATCACCGCCGACCCGAAAGAGCGTCACGCCCTGCAGTCCTGGCGCTTCTTCCTGGCGGCGGCGGGCTCGCTCGCTATCAGCGGCATCG‑CGCTGCCGCTGGGGGGCATCATCGGCAAAGGGGACGAGCAGGTGGGCTACTTCg > 2:214724/1‑239 (MQ=255) ggCAAGATCATCTACGCCTG‑CGTGACCTACATTCTCCTGACCCTGGTCTACACCTTCGTTAACGTGCCGTAC‑TGCGCCATGCCGGGCGTCATCACCGCCGACCCGAAAGAGCGTCACGCCCTGCAGTCCTGGCGCTTCTTCCTGGCGGCGGCGGGCTCGCTCGCTATCAGCGGCATCG‑CGCTGCCGCTGGTGAGCCTCCTCGGCAAAGGGGACGGGCAGGTGGGCTACTTCCgccc > 2:530169/1‑234 (MQ=255) 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gACCTACATTCTCCTGCCCCTGGTCTACCCCTTCGTTAACGTGCCGTAC‑TGCGCCATGCCGGGCGTCATCACCGCCGACCCGAAAGAGCGTCACGCCCTGCAGTCCTGGCGCTTCTTCCTGGCGGCGGCGGGCTCGCTCGCTATCAGCGGCATCG‑CGCTGCCGCTGGTGAGCATCATCGGCAAAGGGGACGAGCAGGTGGGCTACTTCGGCGCCATGTGCGTGCTGGGGCTGAgcggcg < 1:999967/239‑1 (MQ=255) atcTACATTCGCCCGACCCGGGCGTCGACCTTCGTGAACGTGCCGTTC‑TGCGCGTTCCCGGCCGCCATCGCCGCCGACCCGAAAGAGCGTCACGCCCTGCAGTCCTGGCGCGTCTGCCGGGCGGCGGCGGGCTCGCGCGCTATCAGCGGCCGCG‑CGCTGCCGCTGGTGAGCATCATCGGCAAAGGGGACGAGCAGGTGGGCTACTTCGGCGCCATGTGCGTGCTGGGGCTGAgcggcg < 2:80499/236‑1 (MQ=255) cTACATTCTCCTGACCCTGGTCTACACCTTCGTTAACGTGCCGTAC‑TGCGCCATGCCGGGCGTCATCACCGCCGACCCGAAAGAGCGTCACGCCCTGCAGTCCTGGCGCTTCTTCCTGGCGGCGGCGGGCTCGCTCGCTATCAGCGGCATCG‑CGCTGCCGCTGGGGAGCATCATCGGCAAAGGGGACGAGCAGGTGGGCTACTTCGGCGCCATGTGCGCGCTGGGGCGGGGCGGCgtgg > 2:497428/1‑239 (MQ=255) 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cgcCATGCCGGGCGTCATCACCGCCGACCCGAAAGAGCGTCACGCCCTGCAGTCCTGGCGCTTCTTCCTGGCGGCGGCGGGCGCGCTCGCTATCAGCGGCCTCG‑CGCTGCCGCTGGTGAGCATCATCGGCACAGGGGACGAGCAGGTGGGCTACTTCGGCGCCATGTGCGTGCTGGGGCTGAGCGGCGTGGTGCTGCTCTACGTCTGCTTCTTCACGACCAAAGAGCGCTACACCTTTg > 2:1117396/1‑239 (MQ=255) cgcCATGCCGGGCGTCATCACCGCCGACCCGAAAGAGCGTCACGCCCTGCAGTCCTGGCGCTTCTTCCTGGCGGCGGCGGGCCCGCTCGCTATCAGCGGCATCG‑CCCTGCCGCTGGCGAGCATCATTGGCAAAGGGGAGGAGCAGGTGGGCCACTTCGGCGCCCCGTCCGCGAGGGGGCTGAGCGGCGAGGTGCTCCTCTACGCCTGCTTTTTCACGACCAACGCGTCCTACACCCTTg > 2:893744/1‑239 (MQ=255) cgcCATGCCGGGCGGCATCACCGCCGACCCGAAAGAGCGTCACGCCCGGCAGTCCGGGCGCTTCTTCCTGGCGGCGGCGGGCTCGCTCGCTATCAGCGGCATCG‑CGCTGCCGCTGGTGAGCAGCATCCGCAACGGGCACGAGCAGGTGGGCTACTTCGGCGCCATGTGCGTGCTGTGTCTGAGCGGCGTGGTGCTGCAGTCCGTCGGCTTCTTCACGCCGAAAGAGCGCTCAAACTTTg > 2:1142426/1‑239 (MQ=255) accacgccgctcagccccagcacgcacatggcgccgaagtagcccacctgctcgtcccctttgccgatgatgctcacCAGCGGCAGCG‑CGATGCCGCTGGTGAGCATCATCGGCAAAGGGGACGAGCAGGTggg > 2:961643‑M1/78‑134 (MQ=255) accacgccgctcagccccagcacgcacatggcgccgaagtagcccacctgctcgtcccctttgccgatgatgctcacCAGCGGCAGCG‑CGATGCCGCTGGTGAGCATCATCGGCAAAGGGGACGAGCAGGTggg < 1:961643‑M1/57‑1 (MQ=255) ccGCAAGGGCGTCACGCGCTGCAGTCCTGGCGCTTCTTCCTGGCGGCGGCGGGCTCGCTCGCTATCCGCGTCATCG‑CGCTGCCGCTGGTGAGCATCCTCGGCAAAGGGGACGAGCAGGTGGGTTACTTCCGCGCCATGGGCGTGCTGGGGCTGAGCGGCGTGGTGCCGCTCTTGGTCTGCTTCTCCACGGCCAAAGAGCGCTACACCTTTGAGACGCAGCCGTGCTCGCAGgcggcgca > 2:494304/1‑237 (MQ=255) ccGAAAGAGCGTCACGCCCTGCAGTCCTGGCGCTTCTTCCTGGCGGCGGCGGGCTCGCTCGCTATCAGCGGCATCG‑CGCTGCCGCTGGTGAGCATCATCGGCAAAGGGGACGAGCAGGTGGGCTACTTCGGCGCCATGTGCGTGCTGGGGCTGAGCGGCGTGGTGCTGCTCTACGTCTGCTTCTTCACGACCAAAGAGCGCTACACCTTTGAGGTGCAGCCGGGCTCGTCGGTGGCGaa < 1:119911/239‑1 (MQ=255) cGAAAGAGCGTCACGCCCTGCAGTCCTGGCGCTTCTTCCTGGCGGCGGCGGGCTCGCTCGCTATCAGCGGCATCG‑CGCTGCCGCTGGTGAGCATCATCGGCAAAGGGGACGAGCAGGTGGGCTACTTCGGCGCCATGTGCGTGCTGGGGCTGAGCGGCGTGGTGCTGCTCTACGTCTGCTTCTTCACGACCAAAGAGCGCTACACCTTTGAGGTGCAGCCGGGCTCGTCGGTGGCGaaa < 2:1038646/239‑1 (MQ=255) tgtcgcacgtccctcAGGCCGGGCGCTTCCTCCCGGCGTCGGCGGGCTCGCTCGCTATCGGGGGCATCG‑CGCTGCCGCTGGTGAGGATCATCGGCAAAGGGGACGAGCAGTTGGGCTACTTCGGCGCCATGTGCGTGCTGGGGCTGAGCGGCGTGGTGCTGCTCTACGTCTGGTTCTTCACGACCAAAGAGCGCTACACCTTTGAGGTGCAGCCGGGCTCGTCGGTGGCGAAAGACCt < 2:246011/224‑1 (MQ=255) cGTCACGCCCTGCAGTCCTGGCGCTTCTTCCTGGCGGAGGCGGGCTCGCTCGCTATCAGCGGCATCG‑CGCTGCCGCTGGTGAGCATCATCGGCAAAGGGGACGCGCCGGTGGGCTACCTCGGCGCCATGTGCGTGCTGGGGCTGAGCGGCGTGGTGTTGCTCTACGTCTGCTTCTTCACGACCAAAGTGCGCTACACCTTTGAGGTTCCGCCGGGCGCGTCGGTGGCGCACGACCTTaa > 2:601581/1‑239 (MQ=255) gTCACGCCCTGCAGTCCTGGCGCTTCTTCCTGGCGGCGGCGGGCTCGCTCGCTATCAGCGGCATCG‑CGCTGCCGCTGGTGAGCATCATCGGCAAAGGGGACGAGCAGGTGGGCTACTTCGGCGCCATGTGCGTGCTGGGGCTGAGCGGCGTGGTGCTGCTCTACGTCTGCTTCTTCACGACCAAAGAGCGCTACACCTTTGAGGTGCAGCCGGGCTCGTCGGTGGCGaa > 1:705002/1‑229 (MQ=255) 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tcttcCTGGCGGCGGCGGGCTCGCTCGCTATCAGCGGCATCG‑CGCTGCCGCTGGTGAGCATCATCGGCAAAGGGGACGAGCAGGTGGGCTACTTCGGCGCCATGTGCGTGCTGGGGCTGAGCGGCGTGGTGCTGCTCTACGTCTGCTTCTTCACGACCAAAGAGCGCTACACCTTTGAGGTGCAGCCGGGCTCGTCGGTGGCGAAAGACCTTAAGCTGCTGCTGGGCAACAGCCAGTg > 1:441709/1‑238 (MQ=255) tcttcCTGGCGGCGGCGGGCTCGCTCGCTATCAGCGGCATCG‑CGCTGCCGCTGGTGAGCATCATCGGCAAAGGGGACGAGCAGGTGGGCTACTTCGGCGCCATGTGCGTGCTGGGGCTGAGCGGCGTGGTGCTGCTCTACGTCTGCTTCTTCACGACCAAAGAGCGCTACACCTTTGAGGTGCAGCCGGACTCGTCGGTGGCGAAAGACCTTAAGCTGCTGCTGGGCAACAGCCAGTg > 1:1006111/1‑238 (MQ=255) gggcggGCTAGATGGTGATCAGCGGCAGCG‑CGCTGCCGGTGGGGAGCAGGACCGGAAGAGGGGGCGGGCAGGTGGGTTGCTTCGGGGCCATGTGCGTGCTGGGGCTGAGCGACGTGGTGCTGGTCTGCGTCTGCTTCTTCACGACCAAAGAGCGCTACACCTTTGAGGTGCGGGCGGGCTCGTCGGTGGCGAAAGCCCTTAAGCTGCTGCTGGGCAACAGCCAGTGGCGCATCAtgtg < 2:940167/237‑1 (MQ=255) atgatgctcaccagcggcatcgcgctgccgctgGTGAGCATCATCGGCAAAGGGGACGAGCAGGTGGGCTACTTCGGCGCCATGTGCGTGCTGGGGCTGAGCGGCGTGGTGCTGCTCTACGTCTGCTTCTTCACGACCAAAGAGCGCTACACCTTTGAGGTGCAGCCGGGCTCGTCGGTGGCGAAAGACCTTAAGCTGCTGCTGGGCAACAGCCAGTGGCGCATCATGTGCGCGTTCaa > 1:528909‑M2/34‑239 (MQ=255) gcCGGCAGCG‑ACCTGCCGCCGGTGAGGATCATCGGCTAAGGGGACGAGCAGGTGGGCTACTTCGGCGAAATGTGCTTGCGGGGGCTGAGCGGCGTGGTGCTGCTCTACGTCTGCTTCTTCACGACCAAAGAGCGCTTCCCCTTTGAGGTGCAGCCGGGCTCGTCGGTGGCGAAAGACCTTAAGCTGCTGCTGGGCAACAGCCAGTGGCGCATCATGTGCGCGTTCAAGATGATGGCGAc > 2:902129‑M1/3‑239 (MQ=255) cgcTGCCGCTGGTGAGCATCATCGGCAAAGGGGACGAGCAGGTGGGCTACTTCGGCGCCATGTGCGTGCTGGGGCTGAGCGGCGTGGTGCTGCTCTACGTCTGCTTCTTCACGACCAAAGAGCGCTACACCTTTGAGGTGCAGCCGGGCTCGTCGGTGGCGAAAGACCTTAAGCTGCTGCTGGGCAACAGCCAGTGGCGCATCAtgtg < 1:197719/208‑1 (MQ=255) cgcTGCCGCTGGTGAGCATCATCGGCAAAGGGGACGAGCAGGTGGGCTACTTCGGCGCCATGTGCGTGCTGGGGCTGAGCGGCGTGGTGCTGCTCTACGTCTGCTTCTTCACGACCAAAGAGCGCTACACCTTTGAGGTGCAGCCGGGCTCGTCGGTGGCGAAAGACCTTAAGCTGCTGCTGGGCAACAGCCAGTGGCGCATCAtgtg > 2:197719/1‑208 (MQ=255) cTGCCGCTGGTGAGCATCATCGGCAAAGGGGACGAGCAGGTGGGCTACTTCGGCGCCATGTGCGTGCTGGGGCTGAGCGGCGTGGTGCTGCTCTACGTCTGCTTCTTCACGACCAAAGAGCGCTACACCTTTGAGGTGCAGCCGGGCTCGTCGGTGGCGAAAGACCTTAAGCTGCTGCTGGGCAACAGCCAGTGGCGCATCATGTGCGCGTTCAAgatg < 2:1068595/219‑1 (MQ=255) cTGCCGCTGGTGAGCATCATCGGCAAAGGGGACGAGCAGGTGGGCTACTTCGGCGCCATGTGCGTGCTGGGGCTGAGCGGCGTGGTGCTGCTCTACGTCTGCTTCTTCACGACCAAAGAGCGCTACACCTTTGAGGTGCAGCCGGGCTCGTCGGTGGCGAAAGACCTTAAGCTGCTGCTGGGCAACAGCCAGTGGCGCATCATGTGCGCGTTCAAgatg > 1:1068595/1‑219 (MQ=255) ccgctgGTGAGCATCATCGGCAAAGGGGACGAGCAGGTGGGCTACTTCGGCGCCATGTGCGTGCTGGGGCTGAGCGGCGTGGTGCTGCTCTACGTCTGCTTCTTCACGACCAAAGAGCGCTACACCTTTGAGGTGCAGCCGGGCTCGTCGGTGGCGAAAGACCTTAAGCTGCTGCTGGGCAACAGCCAGTGGCGCATCATGTGCGCGTTCAAGATGATGGCGAACTGCGCCAAcgtggc > 2:345553‑M2/7‑238 (MQ=255) | CTGCGTGCTGACCTTCTACACGCCGGACTTCTCCGCA‑CAGGGCAAGATCATCTACGCCTG‑CGTGACCTACATTCTCCTGACCCTGGTCTACACCTTCGTTAACGTGCCGTAC‑TGCGCCATGCCGGGCGTCATCACCGCCGACCCGAAAGAGCGTCACGCCCTGCAGTCCTGGCGCTTCTTCCTGGCGGCGGCGGGCTCGCTCGCTATCAGCGGCATCG‑CGCTGCCGCTGGTGAGCATCATCGGCAAAGGGGACGAGCAGGTGGGCTACTTCGGCGCCATGTGCGTGCTGGGGCTGAGCGGCGTGGTGCTGCTCTACGTCTGCTTCTTCACGACCAAAGAGCGCTACACCTTTGAGGTGCAGCCGGGCTCGTCGGTGGCGAAAGACCTTAAGCTGCTGCTGGGCAACAGCCAGTGGCGCATCATGTGCGCGTTCAAGATGATGGCGACCTGCTCCAACGTGGT > NC_000913/285667‑286128 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |