| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4267879 = | 163 (1.430) | 3 (0.030) | 3/418 | NT | 1.9% | coding (767/1194 nt) | tyrB | tyrosine aminotransferase, tyrosine‑repressible, PLP‑dependent |
| ? | NC_000913 | 4267978 = | 157 (1.430) | coding (866/1194 nt) | tyrB | tyrosine aminotransferase, tyrosine‑repressible, PLP‑dependent | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
CTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCATTGCCAGCGCTGGATTACCCGCTCTGGTGAGCAATTCGTTCTCGAAAATTTTCTCCCTTTACGGCGAGCGCGTCGGCGGACTTTCTGTTATGTGTGAAGATGCCGAAGCCGCTGGCCGCGTACTGGGGCAATTGAAAGCAACAGTTCGCCGCAACTACTCCAGCCCGCCGAATTTTGGTGCGCAGGTGGTGGCTGCAGTGCTGAATGACGAGGCATTGAAAGCCAGCTGGCTGGCGGAAGTAGAAGAGATGCGTACTCGCATTCTGGCAATGCGTCAGGAATTGGTGAAGGTATTAAGCACAGAG > NC_000913/4267644‑4268111 | ctgcATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCATTGCCAGCGCTGGATTACCCGCTCTGGTGAGCAATTCGTTCTCGAAAATTTTCTCCCTTTACGGCGAGCGCGTcg > 1:939952/1‑238 (MQ=255)ctgcATCCATGTTGCCACAAACCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGCGGATGCCTACGCTATTCGCGCCATTGCCAGCGCTGGATTACCCGCTCTGGTGAGCAATTCGTTCTCGAAACTTTTCTCCCTTTACGGCGCGCGGGCcgg > 2:575630/1‑239 (MQ=255)ccaaattcttcacgtagtcggtcaacctgagcggcacttaaaccggtataactgaacatgccgcgctgattaagcagataatcgaaattgcgttctggcatctctgtgcttaataccttcaccaattcctgacgcattgccagaatgcgagtacgcatctcttctacttccgccagccagctggctttcaatgcctcgtcattcagcactgcagccaccacctgcgcaccaaaatTcgg > 1:430666‑M1/236‑239 (MQ=255)ccaaattcttcacgtagtcggtcaacctgagcggcacttaaaccggtataactgaacatgccgcgctgattaagcagataatcgaaattgcgttctggcatctctgtgcttaataccttcaccaattcctgacgcattgccagaatgcgagtacgcatctcttctacttccgccagccagctggctttcaatgcctcgtcattcagcactgcagccaccacctgcgcaccaaaatTcgg > 2:105084‑M1/236‑239 (MQ=255) tgcATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCATTGCCAGCGCTGGATTACCCGCTCTGGTGAGCAATTCGTTCTCGAAAATTTTCTCCCTTTACGGCGAGCGCGTcggc < 2:872046/239‑1 (MQ=255) gcATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCCACGCTATTCGCGCCATTGCCAGCGCTGGATTACCCGCTCTGGCGAGCAATTCGTTCTCGAAAATTTTCTCCCTTTACGGCGAGCGCGTcggcg > 2:337123/1‑239 (MQ=255) aaattcttcacgtagtcggtcaacctgagcggcacttaaaccggtataactgaacatgccgcgctgattaagcagataatcgaaattgcgttctggcatctctgtgcttaataccttcaccaattcctgacgcattgccagaatgcgagtacgcatctcttctacttccgccagccagctggctttcaatgcctcgtcattcagcactgcagccaccacctgcgcaccaaaatTcggcg > 2:710272‑M1/234‑239 (MQ=255) aattcttcacgtagtcggtcaacctgagcggcacttaaaccggtataactgaacatgccgcgctgattaagcagataatcgaaattgcgttctggcatctctgtgcttaataccttcaccaattcctgacgcattgccagaatgcgagtacgcatctcttctacttccgccagccagctggctttcaatgcctcgtcattcagcactgcagccaccacctgcgcaccaaaatTcggcgg < 2:345747‑M1/7‑1 (MQ=255) tCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCATTGCCAGCGCTGGATTACCCGCTCTGGTGAGCAATTCGTTCTCGAAAATTTTCTCCCTTTACGGCGAGCGCGTcggcgg > 1:1225534/1‑237 (MQ=255) tCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCATTGCCAGCGCTGGATTACCCGCTCTGGTGAGCAATTCGTTCTCGAAAATTTTCTCCCTTTACGGCGAGCGCGTcggcgg > 2:291790/1‑237 (MQ=255) tCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCATTGCCAGCGCTGGATTACCCGCTCTGGTGAGCAATTCGTTCTCGAAAATTTTCTCCCTTTACGGCGAGCGCGTCGGCGGAc < 2:782909/239‑1 (MQ=255) tCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCATTGCCAGCGCTGGATTACCCGCTCTGGTGAGCAATTCGTTCTCGAAAATTTTCTCCCTTTACGGCGAGCGCGTCGGCGGAc < 2:575543/239‑1 (MQ=255) aTGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCATTGCCAGCGCTGGATTACCCGCTCTGGTGAGCAATTCGTTCTCGAAAATTTTCTCCCTTTACGGCGAGCGCGTCGGCGGACttt < 1:12825/239‑1 (MQ=255) 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aGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCATTGCCAGCGCTGGATTACCCGCTCTGGTGAGCAATTCGTTCTCGAAAATTTTCTCCCTTTACGGCGAGCGCGTCGGCGGACTTTCTGTTATGTGTGAAGATGCCGAAGCCGCTGGCCGCGTACTg > 2:891491/1‑239 (MQ=255) aGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCATTGCCAGCGCTGGATTACCCGCTCTGGTGAGCAATTCGTTCTCGAAAATTTTCTCCCTTTACGGCGAGCGCGTCGGCGGACTTTCTGTTATGTGTGAAGATGCCGAAGCCGCTGGCCGCGTACTg > 1:26281/1‑239 (MQ=255) tGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGCAGAGGATGCCTCCGCTATTCGCGCCATTGCCAGCGCTGGATTACCCGCTCTGGTGAGCAATTCGTTCTCGCAAATTTTCTCCCTTTACGGCGAGCGCGTCGCCGGCCTTTCTGTTATGTGTGAAGCTGCCGAAGCCGCTGACCGCGTACTggg > 2:258929/1‑239 (MQ=255) 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(MQ=255) tGCCAGCGCTGGATTACCCGCTCTGGTGAGCAATTCGTTCTCGAAAATTTTCTCCCTTTACGGCGAGCGCGTCGGCGGACTTTCTGTTATGTGTGAAGATGCCGAAGCCGCTGGCCGCGTACTGGGGCAATTGAAAGCAACAGTTCGCCGCAACTACTCCAGCCCGCCGAATTTTGGTGCGCAGGTGGTGGCTGCAGTGCTGAATGACGAGGCATTGAAAGCCAGCTGGCTGGCGGAAg > 1:820955/1‑239 (MQ=255) ggATTACCCGCTCTGGTGAGCAATTCGTTCTCGAAAATTTTCTCCCTTTACGGCGAGCGCGTCGGCGGACTTTCTGTTATGTGTGAAGATGCCGAAGCCGCTGGCCGCGTACTGGGGCAATTGAAAGCAACAGTTCGCCGCAACTACTCCAGCCCGCCGAATTTTGGTGCGCAGGTGGTGGCTGCAGTGCTGAATGACGAGGCATTGAAAGCCAGCTGGCTGGCGGAAGTAGAAGAGAt < 2:184800/239‑1 (MQ=255) gccagctggctttcaatgcctcgtcattcagcactgcagccaccacctgcgcaccaaaatTCGGCGGACTTTCTGTTATGTGTGAAGATGCCGAAGCCGCTGGCCGCGTACTGGGGCAATTGAAAGCAACAGTTCGCCGCCACTACTCCAGCCCGCCGAATTTTGGTGCGCAGGTGGTGGCTGCAGTGCTGAATGACGAGGCATTGAGAGCCAGCTGGGTGGCGGAAGGAGaagagagg < 2:134316‑M1/179‑3 (MQ=255) gATTACCCGCTCTGGTGAGCAATTCGTTCTCGAAAATTTTCTCCCTTTACGGCGAGCGCGTCGGCGGACTTTCTGTTATGTGTGAAGATGCCGAAGCCGCTGGCCGCGTACTGGGGCAATTGAAAGCAACAGTTCGCCGCAACTACTCCAGCCCGCCGAATTTTGGTGCGCAGGTGGTGGCTGCAGTGCTGAATGACGAGGCATTGAAAGCCAGCTGGCTGGCGGAAGTAGAAGAGAt > 2:1130815/1‑238 (MQ=255) aTTACCCGCTCTGGTGAGCAATTCGTTCTCGAAAATTTTCTCCCTTTACGGCGAGCGCGTCGGCGGACTTTCTGTTATGTGTGAAGATGCCGAAGCCGCTGGCCGCGTACTGGGGCAATTGAAAGCAACAGTTCGCCGCAACTACTCCAGCCCGCCGAATTTTGGTGCGCAGGTGGTGGCTGCAGTGCTGAATGACGAGGCATTGAAAGCCAGCTGGCTGGCGGAAGTAGAAGAGATg < 1:343893/238‑1 (MQ=255) ttACCCGCTCTGGTGAGCAATTCGTTCTCGAAAATTTTCTCCCTTTACGGCGAGCGCGTCGGCGGACTTTCTGTTATGTGTGAAGATGCCGAAGCCGCTGGCCGCGTACTGGGGCAATTGAAAGCAACAGTTCGCCGCAACTACTCCAGCCCGCCGAATTTTGGTGCGCAGGTGGTGGCTGCAGTGCTGAATGACGAGGCATTGAAAGCCAGCTGGCTGGCGGAAGTAGAAGAGATGCg < 1:599998/239‑1 (MQ=255) 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ctGGTGAGCAATTCGTTCTCGAAAATTTTCTCCCTTTACGGCGAGCGCGTCGGCGGACTTTCTGTTATGTGTGAAGATGCCGAAGCCGCTGGCCGCGTACTGGGGCCATTGAAAGCAACAGTTCGCCGCCACTACTCCAGCCCGCCGCATTTTGGTGCGCAGGTGGTGGCTGCCGTGCAGAATGACGAGGCATTGAAAGCCAGCTGGCTGGCGGACGTAGAAGAGATGCGtcgccgcat > 2:862841/1‑231 (MQ=255) ctGGTGAGCAATTCGTTCTCGAAAATTTTCTCCCTTTACGGCGAGCGCGTCGGCGGACTTTCTGTTATGTGTGAAGATGCCGAAGCCGCTGGCCGCGTACTGGGGCAATTGAAAGCAACAGTTCGCCGCAACTACTCCAGCCCGCCGAATTTTGGTGCGCAGGTGGTGGCTGCAGTGCTGAATGACGAGGCATTGAAAGCCAgctgg < 1:377885/207‑1 (MQ=255) aaTTCGTTCGCGAAAATTTTCTCCCTTTGCGGCGAGCGCGTCGGCGGACTTTCTGTTATGTGTGAAGAGGCCGAAGCCGCTGGCCGCGTACTGGGGCAATTGAAAGCAACAGTTCGCCGCAACTACTCCAGCCCGCCGAATTTTGGTGCGCAGGTGGTGGCTGCAGTGCTGAATGACGAGGCATTGAAAGCCAGCTGGCTGGCGGAAGTAGAAGAGATGCGTACTCGCATTCTGGCaa < 1:601257/238‑1 (MQ=255) 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ctcGAAAATTTTCTCCCTTTACGGCGAGCGCGTCGGCGGACTTTCTGTTATGTGTGAAGATGCCGAAGCCGCTGGCCGCGTACTGGGGCAATTGAAAGCAACAGTTCGCCGCAACTACTCCAGCCCGCCGAATTTTGGTGCGCAGGTGGTGGCTGCAGTGCTGAATGACGAGGCATTGAAAGCCAGCTGGCTGGCGGAAGTAGAAGAGATGCGTACTCGCATTCTGGCAATGCGTCAgg < 1:123774/239‑1 (MQ=255) cGAAAATTTTCTCCCTTTACGGCGAGCGCGTCGGCGGACTTTCTGTTATGTGTGAAGATGTCGAAGCCGCTGGCCGCGTACTGGGGCAATTGAAAGCAACAGTTCGCCGCAACTACTCCAGCCCGCCGAATTTTGGTGCGCAGGTGGTGGCTGCAGTGCTGAATGACGAGGCATTGAAAGCCAGCTGGCTGGCGGAAGTAGAAGAGATGCGTACTCGCATTCTGGCAATGCGTCAGGaa < 2:861460/239‑1 (MQ=255) tttCTCCCTTTACGGCGAGCGCGTCGGCGGACTTTCTGTTATGTGTGAAGATGCCGAAGCCGCTGGCCGCGTACTGGGGCAATTGAAAGCAACAGTTCGCCGCAACTACTCCAGCCCGCCGAATTTTGGTGCGCAGGTGGTGGCTGCAGTGCTGAATGACGAGGCATTGAGAGCCAGCTGGCTGGCGGAAGTAGAAGAGATGCGTACTCGCATTCTGGCAATGCGTCAGGAATTGGTGa < 2:952472/239‑1 (MQ=255) 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CTGCATCCATGTTGCCACAACCCAACGGGTGCCGATCTCACTAATGATCAGTGGGATGCGGTGATTGAAATTCTCAAAGCCCGCGAGCTTATTCCATTCCTCGATATTGCCTATCAAGGATTTGGTGCCGGTATGGAAGAGGATGCCTACGCTATTCGCGCCATTGCCAGCGCTGGATTACCCGCTCTGGTGAGCAATTCGTTCTCGAAAATTTTCTCCCTTTACGGCGAGCGCGTCGGCGGACTTTCTGTTATGTGTGAAGATGCCGAAGCCGCTGGCCGCGTACTGGGGCAATTGAAAGCAACAGTTCGCCGCAACTACTCCAGCCCGCCGAATTTTGGTGCGCAGGTGGTGGCTGCAGTGCTGAATGACGAGGCATTGAAAGCCAGCTGGCTGGCGGAAGTAGAAGAGATGCGTACTCGCATTCTGGCAATGCGTCAGGAATTGGTGAAGGTATTAAGCACAGAG > NC_000913/4267644‑4268111 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |