Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,206,469 | C→G | 18.3% | S3R (AGC→AGG) | ttdA → | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,206,469 | 0 | C | G | 18.3% | 219.4 / 17.6 | 115 | S3R (AGC→AGG) | ttdA | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/53); new base G (15/5); total (48/67) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.61e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
CTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGT > NC_000913/3206233‑3206702 | cTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCg < 1:81087/238‑1 (MQ=255) tAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGa < 1:460665/238‑1 (MQ=255) tAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGa < 2:1153003/238‑1 (MQ=255) tAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGa < 2:206757/238‑1 (MQ=255) cAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGtaat < 2:363801/238‑1 (MQ=255) aGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAGACAAAAACAAAAA‑ATTGG‑GTTGTCATTGTGTGGGGAAGgaataa > 1:522800/1‑239 (MQ=255) ttCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AAc < 2:864547/239‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAgg < 1:75802/236‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAgg < 2:1186004/236‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAgg < 1:220231/236‑1 (MQ=255) cGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTg < 2:118861/239‑1 (MQ=255) cGTTAATTATCCGCAGTTGGGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGAGAATTTTTTCAGGCAAAAACAAAAA‑CTTGA‑GGTGGCATTGTGTGGGAAAGGAATAAGC‑AAAAggacggg > 1:975497/1‑234 (MQ=255) ttAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAA‑ATGTA‑GTTTGCCTGGTGAGGGGAAGTAATAAAC‑AACAGGGAGGGaa > 1:459149/1‑239 (MQ=255) ttAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAAAACAATACAAAAA‑CATGA‑GTTGCCCTGATGAGCGGAAAGAACAAGC‑cacaagaaaggaa > 1:194187/1‑230 (MQ=255) tAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGaa < 2:142378/238‑1 (MQ=255) tAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGaa < 1:986923/238‑1 (MQ=255) aaTTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CGGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATa < 1:390139/239‑1 (MQ=255) tgtgATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAgaga < 2:297507/238‑1 (MQ=255) tgATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGGGAATTTTTTCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAATAATAAAC‑AAAAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑g > 1:487376/1‑239 (MQ=255) aGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGAGAATTTTTTCAGAAAAAAACAAAAA‑ATGGA‑GTTGCTATGAGTAGGGAAAATAATAAGA‑AAAAAGCAGAGGATAAAG‑TGACaaaagtttgtggt > 2:1060584/1‑227 (MQ=255) cgcAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCCCATAAATACAAAAA‑ATGGA‑GTTGGCATGATGTGGGGAAGATATAAAC‑AACAAGCCGGGGATAAAT‑TTATACAGATT‑TTTGCT‑aa > 1:43561/1‑239 (MQ=255) tATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAAACAAAAACAAAAA‑AAAGA‑GGTGTCATGATGAGAGGAAAGAATAAAC‑AAAAGGAAAGGGATAAAA‑TGACAGAGAAT‑GGTGCT‑acaatttt > 1:433037/1‑231 (MQ=255) tATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGa < 1:1149144/184‑1 (MQ=255) tCGAAAAACATTGCCATTCCCGGCTCTGGCGAAATTTTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACAAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATAAAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGGGGGGGTAAATTTTTCCAGAAAAATAAAAAAA‑CGGGA‑GTTGCCATGATGAGCAAAATTAAAAAGC‑AACAGGCAGTAAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCa < 2:277728/239‑1 (MQ=255) gCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAAATTTTTCACAAAAAAAAAAAAA‑ACAGG‑GTTTCTAAGGAGAGCGGAAGAAATAAAC‑AAAAGACAACGAATAAAG‑TGATAAAGAAT‑GTCGCG‑aaatattcacagctt > 2:506847/1‑226 (MQ=255) aaaaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAA‑CATGA‑GTTGGCATGATGAGCGGAAGAAAAAAAA‑AAAAAGCAAGGAAAAAAA‑TGACAGAGAAT‑GTTGCT‑AAATTTACCCCCATGAt > 1:987055/1‑239 (MQ=255) aaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAAATTTTTCAGAAAAAAAAAAAAA‑ATAGA‑GTTTGCATGATGAGGGAGAGAAATAAAA‑CAAACGCAGAGAAAAAGTATAACA‑AGATT‑GTCACC‑AACTTTATCGCCCTAAttt > 2:1130141/1‑239 (MQ=255) aaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑‑AGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTTCAACAAATACAAAAA‑ATGGA‑GGTGTCAAGATGAGGGGAAGTAATAAGA‑AACAAGCAGTGAATAAAT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGAtt > 1:1217691/1‑237 (MQ=255) cATCGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATCCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCAGGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGGGGCGGTAAATTTTTCCAGACAAATAAAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AATTTTACCGCCATGATTTCt < 1:970075/239‑1 (MQ=255) tGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTTAATTTTTTCTGACAAATAAAAAAA‑ATTGA‑GTTGCCCCGTTGAGCGAAAGGAATAAGA‑AACAGGCACTGAATAAAA‑TGACAAAGATT‑TTCGCT‑ACCTTTACCCCCATGCTTTCTTCCCGGATTccct > 1:73837/1‑237 (MQ=255) tGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTTAGACAAAAAAAAAAA‑ATGGAGGTTGCCTTG‑TGGGGGGAAGGAAAAAAA‑AAAAGGCAATGAATAAGT‑TGATAAAGAGT‑TTCGCT‑TAATTTACCGCCATGATTTTTACACGacaggctc > 2:624652/1‑232 (MQ=255) tGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAg < 1:590123/187‑1 (MQ=255) ctttGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTAATTCACGACCTGTTAATTACATATTCACGGTGACAAAAAATAAAAAACCAC‑ATTTTAAGTGG‑‑AGTTTGTGGCGGTAAATTTTTCCAAAAAAATAAAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGAGAAAGTAATAACC‑AACAGGCAGTAAATAAGT‑TGACAGAGATG‑GCCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCtgatg < 2:1217691/236‑1 (MQ=255) ctctGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAGAAAAAAACAAAAA‑ATGGA‑GTTGCCATGATGAGGGGAAGAAATAAAA‑AAAAAGCAAGGAAAAAAA‑AGAGAGAGAAT‑GGCGCG‑AAAATTACAGCGATGAATTTTACCCGaaagacagag > 2:1183843/1‑231 (MQ=255) tctGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCAAAAGAAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAATT‑TGACAGAGATT‑GTCGTT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCtgatg < 1:826841/239‑1 (MQ=255) tGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGGAAATTTCCCGTAAAATACAAAAA‑ATTGT‑GGTGGTCAGATGAGGAAAAGAAATAAAC‑AAAAGGCAGTGAATTAGA‑TGACAGAAAAT‑GTCCCT‑AACTTTTTCGCCCTGCTTTCTTACCGTATACCttattaa > 1:800471/1‑236 (MQ=255) gcgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGTAATTTTTCAGACAAATAAAAAAA‑CTGGA‑GTGGCCATGATGAGGGGAAGTAATAAGA‑AACAGGAAGAGCATAAAA‑TGATAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCCAGAATTCTACCCTAATGCCtgatggagt > 1:408108/1‑235 (MQ=255) gcgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAAAAAAAAAAAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCCATATGGGCGGAAGGAATAAAA‑AACAAGAAAGGAAAAAAG‑TTAAAAAAATT‑GTTGGTAAACTTTCCGCCCAGGATTTTTACCCGATTGccgatagagg > 1:581942/1‑231 (MQ=255) gcgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAAATTTTTCAGACAAATACAAAAA‑ATGGG‑GGTGTCATGATGAGCTGAAAAAATAAAC‑AAAAAGCAGAGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGGT‑AACTTTACACCCCTGATTTTTACCCCAATGCCTGATGACgg > 1:713440/1‑238 (MQ=255) gcgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGAGGATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAA‑ATGGA‑GTTGGCATGTTGAGCGAAAGTAATAAAC‑AACCAGCAGGGAATAAAT‑TGACAGAGAAT‑GTCGCT‑AAATTTAACGCCCTGATTTCTAACCGAATGCCtgattgagt > 1:102849/1‑234 (MQ=255) cgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTTTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATAAAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGGGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTAc < 1:572396/205‑1 (MQ=255) cacAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATACACGAACTTTTAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGGGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CGGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACgt < 2:863678/236‑1 (MQ=255) cacAAAATTCATTCTTATTTTGGCGTTAATTCACGAACTGTTAATTACATAGTCAGGGGGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑AAGTTGGGGGGGGTGAATTTTTCCACAAAAATACAAAAT‑CTGGT‑GTTCAGAAAGAGACGGAAAAAAACAAGC‑AACAGGTGGAGAATAAGA‑AGAAAAAGATT‑GTGGCA‑ATATTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACgt < 2:796575/236‑1 (MQ=255) caaaaTATCCATGCTTATTTCGACTTTGATGCAGCAATTGTAAATGACATTTTCACAGTGAAAAAAAAAATAAAACCAC‑ATTGAGAGTGG‑TAGTTGTGGGCGGTAAATTTTTCAAAACAAAAAAAAAAA‑AAGGA‑TTTGCGATGATGATAAAAAGAAATAAGA‑AACAGGCGGTAAATAATT‑GGACAGGGTTT‑GTCCCA‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACgt < 2:680323/235‑1 (MQ=255) gcAATATTCATTCTTATTTTCGCTTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTAAATTTTTCCAGAAAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCAAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTAAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACgtg < 1:292805/238‑1 (MQ=255) aaaaTATTAATTCTTATTTTGGCGTTGATTCACGATTTGTTAATTACAGATCCAGGGTGGAAAAAAATAAAAAACAAC‑ATTTTGAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTCCCAGACAAATACAAAAA‑CAGGA‑GTTGCTATGAGGAGCGAAATAAATAAGC‑ACCGGGAAGAGAATAAGT‑TGACAGATATT‑GTCGTT‑AACTTTCCCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACgtg < 1:904719/236‑1 (MQ=255) tatttattTTTTTTTTCGCATTAATTCACTAAATTTTAATAACATATACAGGGTGGAAAAAAATAAAAATCCAG‑ATTATAGATGG‑GTTTTGGGGGGAGTGATTTTTTGCAGAGAAATAAAAATA‑GGGGG‑GTTGCGTAGAGGAGTAAAAGTAATAAGA‑AACGGGGTGTAGATAGGT‑AGAAAAGAATT‑GTCGGT‑AGCTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 2:880155/239‑1 (MQ=255) tatTCATTTTTAGTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTAAATTACATATTCGCGGGGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGT‑TGGTTTGGGGCGGTAAATTTTCCCAGACAAAAACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATAATGGGGGAAAATAATAAGA‑AACGGGCAGTAAATAAGT‑TGACAGAGTTT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 1:1115247/239‑1 (MQ=255) aattcattcTTATTTTCGCGTGGATTCATGAACTGTTAAGTACAGATTCACGGGGGCAAAAAATATAAACCCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTAAATTTTTCCAGACAAAGACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCTTGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑ACCAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGTT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 1:911028/238‑1 (MQ=255) attcattcTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAgg < 1:872637/162‑1 (MQ=255) ttATTTTCGCGTTGATTCACGAACTTTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGAAAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaa < 1:939662/239‑1 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAA‑ATGGA‑GTTGTTATTATTAGCGGAAATAAAAAAC‑AAAAAGGAGTGAAAAAAT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AAAATTACACACATCATTTTTAAACGAATGCCTGATGACATGTGGGGTAAAACaaaa > 2:461981/1‑239 (MQ=255) ttttCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAAATTTTTTCGACAAAAACAAAAA‑ATGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGGAATAAAC‑AAAAGGCAATGAATAAAT‑TGACAGAGAAT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTTTTCCCGAAAGCCTGATGACGAGGTGGGtaaaataaaaaa > 1:1095181/1‑237 (MQ=255) ttttCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAAATTTTTCAGACAAATAAAAAAA‑ATGGA‑GGTGCCCTGATGAGCGGGAGTAATAAGC‑AACACGCAGTGAATAAAG‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTTTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaaaa > 1:866702/1‑237 (MQ=255) gcgTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAAATTTTTCAGACAAAAACAAAAA‑ATGGA‑GTTGTCATGATGAGCGAAAGTAATAAAC‑AAAAGGCAGAGAATAAGA‑TGACAGAGAGT‑GTTGCT‑AAATTTAACGCCATGATTTTTACCCCAATGCCTGATGACGTGGGGGGTAAACTAAAAAAGCTaa > 1:307624/1‑239 (MQ=255) gTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAAACAAAAACAAAAA‑ATGGA‑GTTTGCATGATGAGGGGAAGTAATAAAC‑AAAAGGCAGGGAAAAAGA‑TGACAGAGATT‑GTCGGC‑AAATTTTCCGCCCTGAATTTTACCCCAAAACCTTGTGTCGTGGGGGGTAAACTTAAACAACTAAAg > 2:939662/1‑239 (MQ=255) cGAACTTTAAATAACATATTCGCGGTGGAAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TATTTTGTGGCGGTAAATTTTTCCAGAAAAATAAAAAAA‑CGGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGaa < 2:307624/239‑1 (MQ=255) ttttATTTAAATATGCACGTTAGCAAAAAATATAAACCCAC‑A‑TTTTGGTGGTTAGTTTGTGGGGGTAATTTTTTCCAGAAAAATACAAAAC‑CTGGT‑GTTGCCATGATGAGCAAAAGTAAAAAGC‑AAGAGACAGTAAATAAGT‑TGACAGGAATT‑GTCGCT‑ATCTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAAcgtc < 2:54715/237‑1 (MQ=255) tGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAAACAAATAAAAAAA‑AATGA‑GGTTCCATGATGTGCGAAAGAAAAAAAC‑AACAAGCAGTGAAAAAGT‑TGGCAAAGATT‑TTCGCT‑AACTTTATCCCCATGATTTTTACCCGAAAGCCTGATGTAGTGGTGGGTAAAAAAAAACAGCTAAAAAAT‑GCCGcaaact > 2:70247/1‑235 (MQ=255) ttAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGGGAAATTTTTCAAACAAATAAAAAAA‑CTGGA‑GTTTGCCTGGTGGGCGACAGTAATAAGC‑AACAGGCAATGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCC‑CACTTTAACACCACTAATTTTACCCGAACACCTGATTTCGTGGTGGGTAAACTAAAAAAGCCCACAGAT‑GCCGAAAcgccc > 2:113577/1‑235 (MQ=255) aaTTACATATTCAGGGTGACAAAAAATAAAAAACCAA‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGGGGTGAATTTTTCCAGAAAAATACAAAAA‑CGGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAAAAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGtcgtcg < 2:522800/239‑1 (MQ=255) aaTTACATATGCACGGTGGCAAAAAATAAAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TATTTTGGGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTGGCCATGATGAGCAAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGtcgtcg < 1:1006830/239‑1 (MQ=255) caaattagcGGTGGAAAAAAATATAAAACCAA‑ATTTTTAGTGG‑TTGTTTGTGGGGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATAATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTAAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAGAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATggg < 2:599583/231‑1 (MQ=255) aatatTCACGGGGGAAAAAAATATAAAACAAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGAAAAAAAAAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATggg < 2:480813/238‑1 (MQ=255) atatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGGGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCAAAAGTAATAAGC‑AACGGGCAGTGAATAGTT‑TGACAGAAATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 1:799563/196‑1 (MQ=255) atatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGGGAATTTTTCCAGAAAAATATAAAAA‑ATGAA‑GTTGCCAAGAAGAGAGAAAAAAATAAAA‑CACAAGCAAAGAATAAGA‑TGACAGAGAAT‑GTTTGT‑CAATTTTCAGCCAATGTATTTAACCGCAAGACCGATTAACTGGTGGGTGAACAAAAACAACTAAAAGGA‑GCCGAAAcgaccgcgtatggg > 1:1199158/1‑227 (MQ=255) tatTCAGGGTGGAAAAAAATATAAAACACA‑ATTTTTAGGGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATAAAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCAAAAGTAAAAAGC‑AACAGGCATTGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGAT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:425040/239‑1 (MQ=255) tatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTAATGGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:1130141/239‑1 (MQ=255) tatTCACGGGGGAAAAAAATAAAAACCCAC‑ATTTTTAGTGG‑TATTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGAAAAAAACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCAAAAGTAATAAGC‑AACAGGAAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:532241/239‑1 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCCGACAAAAACAAAAA‑CTGGG‑GTTTCCCTGATGAGCGAAAGTAATAAAC‑AACAGGAAGAGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTAACGCCCTGATTTTTACCCCAATGCCTGATGACGGGGGGGATAAACTAAAAAAAATAAAGGATGGCCGAAA‑ATCGTCGGTggggga > 1:262041/1‑237 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAAACAAAAACAAAAA‑ATGGA‑GTTGGCCTGATGTGGGAAATGAATAAAA‑AACAAGCAGTGAAAAAGA‑TGACAGAGAGT‑TTCGCT‑AACTTTTACGCCCTGATTTCTACCCGAATTCCTGATGACGGGGGGGGTTAAATAAAACAGATAAAAGAA‑GCCGCAACGTCCTCGCTgggggc > 2:1006830/1‑237 (MQ=255) caggTGGAAAAAAATAAAAAACCAA‑ATTGTTATTGT‑TGGTTGGTGGCGGTAAATTTTTCAAAAAAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTCCAATGATGAGCGAAAGAAAAAAGC‑AACAGGCGGTGAATAAGT‑GGAAAGAGATT‑TCCGTT‑AATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAAtt < 2:1095181/237‑1 (MQ=255) tgggCAAAAAATATAAACCCAC‑ATTTTTAGGGG‑TAGTTTGTGGCGGAGAATTTTTCAAGAAAAATAAAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTAAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 2:190656/236‑1 (MQ=255) tGGCAAAAATAATAAAACCAC‑ATTTTTATTGT‑TAGTTTGTGGCGGTAAATTTTTCCAGACAAATAAAAAAA‑CGGGA‑GTTGCCTTGATGAGCAAAATAAATAAGC‑AACAGGCAGTAAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATc < 1:1036074/238‑1 (MQ=255) gCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAGACAAATAAAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGGAAGGAATAAAC‑AACAAGCAGGGAAAAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTAACGCCAAGATTTTTAACCGAATGCCTGATGACGTGGGGGGTAAAATAAAAAAGCTAAAGGAT‑GCCGAAAACTCGGCGATGGGGGAAAATATCTa > 1:608616/1‑238 (MQ=255) gCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAAAAAAAAAAAAAAA‑ATGGG‑GGTGGCATGGTGAGCGGAAGGAAAAAAA‑AAAAGGCAGGGAATAAAA‑TGAAAAAGAAT‑GTTGCT‑AACATTAACCCCACGGTTTTTTCCCCAAATCCCGATGGCGCGGGGGGTAAAATCAAAAAACCAAAAAAT‑GCCGAAAAGAGGTCGCGGGGGGGAAATATCTa > 2:1048868/1‑238 (MQ=255) aaaaaaTAAAACCAC‑ATTTGTAGGGG‑TAGTTTGTGGCGTTAAATTTTTCCAGAAAAATACAAAAA‑CGGGA‑GTTGCCATGATGACGAAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGTTT‑GTCGCT‑AATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATa < 1:555187/239‑1 (MQ=255) aaTATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTAAATTTTTCCAGAAAAATAAAAAAA‑CTGGA‑GTGGCCATGATGAGCAAAAGTAATAAGC‑AACAGGCGGTAAATAAGT‑TGAAAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 1:1183843/239‑1 (MQ=255) aaaaaaaaACACAATTTTTAGTGG‑TATTTTGTGGGGTTAAATTTTTCAAAAAAAATAAAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGAGGAGCAAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑GGACAGAGATG‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 2:262041/235‑1 (MQ=255) taAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAGACAAATACAAAAA‑AAGGG‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAAC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCCTGATTTCTTCCCGAATGCCTGATGAc > 1:478258/1‑166 (MQ=255) aCCAC‑ATTTGTAGTGG‑TATTTTGTGGGGGTG‑ATTTTTCCAAGAAAAAACAAAAACCAGGA‑GTTGCCATGTTGAGAGAAAGTAATAAGA‑ACCAGGCGGTAAATAAGT‑TGCCAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGa < 2:148612/239‑1 (MQ=255) cac‑aTTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAgg < 2:725546/92‑1 (MQ=255) ac‑aTTTTAAGTGG‑TAGTTTGGGGCGGAAAAGTTGTCAAGAAAAATAAAAAAA‑CGGGA‑GGTGCAATGATGAGC‑AAAGAAAAAAACAAAGAGGTAGAAAAGAAGG‑TGACCAGGATA‑GTCGCT‑AACTTAACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGGCGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCAGACGATGTTCGacaa < 2:73837/239‑1 (MQ=255) g‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCCGACAAATACAAAAA‑ATGGA‑GTTTCCCTGATTAGCGGAAGTAATAAAC‑AACAAGCAGTGAATAAGT‑TGGCAGAGATT‑TTCGCT‑AACTTTACCGCCCTGATTTTTTCCCCAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAAAAACTAAAGGAT‑GCCGCAACGTCGTCGATGGGGGAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCcaaaaac > 1:76032/1‑237 (MQ=255) tgGGGGTAAATTTATCAAGAAAAAAAAAAAAA‑CGGGG‑GATGCAATGATGAGAAAAAGTAATAAGC‑AAAAGGCAGTGAATAAGT‑TAGAGGGGATT‑GCCGTA‑AACTTGACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGAc < 2:339576/238‑1 (MQ=255) acaaGACAAATAAAAAAA‑CTGGT‑GTTGCCATTATGAGCAAAAGTAATAAGC‑ACCAGGCGGTGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctgcc < 1:1231645/236‑1 (MQ=255) gACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctgcatggc > 2:939611/1‑237 (MQ=255) aagatgtatataagagaaagcccAGGATGAGAAAAAGAAATAAGA‑AACAGGCAGAGAATAAGT‑TGAGAGAGATT‑GTCGCT‑ACTTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCa < 2:702435/217‑1 (MQ=255) aaaaaaaaacggggggTTCCCATGAGGAGAAAAATAAAAAAGC‑AAACGGCAGTAAATAAGT‑AGAAGGAGATT‑GGCGCA‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGa < 2:246034/224‑1 (MQ=255) aaaaa‑CTGGG‑GTTGCCAGGATGAGAGAAAGTAAAAACA‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGTT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCg < 1:70247/239‑1 (MQ=255) aaaa‑CTGGA‑GGTGCAAGGAGGGGAAAAAGAAATAAGC‑AACAGGTAGATAATAAGT‑GGCAGGAGTTT‑TTGGTT‑AATTTTCCCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgg < 2:800471/239‑1 (MQ=255) aaa‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCggg > 2:528162/1‑239 (MQ=255) aa‑CGGGA‑GTTGCCATGAGGAGCGAAAGTAATAAAC‑AACAGGCAGTGAAGAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgggg < 2:43561/239‑1 (MQ=255) ggA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGAt > 2:1225605/1‑239 (MQ=255) gA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGCTGTTCGACAACATGCAAAAAGGGATTGACCTGCATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGAtt > 2:1206132/1‑239 (MQ=255) gA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGAtt > 1:967787/1‑239 (MQ=255) ccttaaacaGCAAAAGTAA‑AAGCAAACGGGCAGTTAAAAGTT‑TGAC‑GAGTTTGGTCGTA‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGttc < 2:408108/231‑1 (MQ=255) ccATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGt > 2:1042344/1‑237 (MQ=255) atgaGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACATGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGCT‑GCCGAAACGTCGTCGATGCGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACCACATTCAAAAAGCGATTGACTTACACCGTCCACCCTGTAAGGACACCGGGCAGTTAATGTTCTTCGt > 2:926692/1‑239 (MQ=255) cGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCggg > 1:702435/1‑217 (MQ=255) | CTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATT‑GTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGT > NC_000913/3206233‑3206702 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |