Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 3,206,485 | C→A | 19.9% | Q9K (CAG→AAG) | ttdA → | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,206,485 | 0 | C | A | 19.9% | 206.5 / 13.0 | 114 | Q9K (CAG→AAG) | ttdA | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/57); new base A (19/5); total (49/65) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.36e-04 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |