| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,436,119 | 0 | T | C | 3.1% | 533.0 / 2.2 | 149 | R305R (CGT→CGC) | rsmB | 16S rRNA m(5)C967 methyltransferase, SAM‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (70/73); new base C (3/3); total (73/76) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
TGGGTTACCGTTCAGGATGCATCAGCACAAGGTTGCATGACCTGGCTTGCGCCACAAAACGGTGAACACATTTTGGATCTTTGTGCCGCCCCCGGCGGTAAAACAACGCATATCCTTGAGGTGGCACCAGAAGCGCAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGTATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTACCCTTCTCAATGGTGTGGCGAGCAACAGTTTGATCGCATTTTATTAGATGCGCCTTGTTCAGCAACCGGTGTGATTCGTCGCCATCCAGATATTAAATGGTTACGTCGCGATCGCGATAT‑CCCGGAACTCGCGCAATTGCAGTCTGAAATTCTCGACGCCATTTGGCCGCATTTAAAAACCGGTGGAACTCTGGTCTATGCCACCTGTTCGGTGTTACCGGAAGAGAATAGCCTGC > NC_000913/3435883‑3436357 | tGGGTTACCGTTCAGGATGCATCAGCACAAGGTTGCATGACCTGGCTTGCGCCACAAAACGGTGAACACATTTTGGATCTTTGTGCCGCCCCCGGCGGTAAAACAACGCATATCCTTGAGGTGGCACCAGAAGCGCAGGTTGTTGCGGTTGATATCGACGAACAGCGCCTCTCTCGGGTTTACGACAATTTAAAACGCCTTGGTATGAAGGCGACCGTGAAACAAGGTGATGGCCGTTa < 2:1234906/239‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |