Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,394,335 | T→G | 14.4% | V90G (GTC→GGC) | nnr → | bifunctional NAD(P)H‑hydrate repair enzyme, C‑terminal domain ADP‑dependent (S)‑NAD(P)H‑hydrate dehydratase and N‑terminal domain NAD(P)H‑hydrate epimerase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,394,335 | 0 | T | G | 14.4% | 323.2 / 3.3 | 128 | V90G (GTC→GGC) | nnr | bifunctional NAD(P)H‑hydrate repair enzyme, C‑terminal domain ADP‑dependent (S)‑NAD(P)H‑hydrate dehydratase and N‑terminal domain NAD(P)H‑hydrate epimerase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (45/59); new base G (22/2); total (67/61) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.63e-06 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
AGTATACCACACACCGTCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTGATA > NC_000913/4394100‑4394571 | attaggcaccccacgtacTGGCACCCCGACGATACCCGCCGCGGAGAACGGGGGGCGGCAGGTGTGGTGGGGCGCCCACTCTATGCGGTGAGGATCCCCGCGGGGGGGGCCGCTTTCCAGGTGTGTCGGTCGGCGTACCCTGGCGGCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCa < 2:432052/221‑1 (MQ=255) acaccccccctgtgtgtcggCCGTCGATACCCGCGGCGTAGAGGGGGGGGCGGCGGTGGGGCGGGGGCTCACATTCTAGGGGCTGATGCTGCGCGCTGGCGAGGCCTCATTCGGGGGGGGGCGTGCGGCTTAGCCTGACGCCCGCCGCTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACgttg‑t < 2:184896/220‑1 (MQ=255) cacacCGTCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCCGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGCCGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGCGGTTG‑CCT‑CCCTGTTC‑CGCGACTGGCCACAACCGTCGGCCTTGAGGGCCCCGTG‑TTgg > 2:446529/1‑238 (MQ=255) cacacCGTCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGGGACTGGCCAAAGCGGGCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTgg > 1:254567/1‑238 (MQ=255) cacacCGTCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGGCGCGCGACTGGCCAAAGCGGGCGGCATTGAGGTCACgttggcccc > 1:1204689/1‑234 (MQ=255) cacCGTCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGATGGGCGGTCATGGCAATAAAGGCGGC‑GGTG‑GCC‑TCGCGGTCCCCCGCCTGGGCAAACCGGGTGGCCTTGTGGTCCCGTTG‑TTgggc > 2:411577/1‑236 (MQ=255) acCGTCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GGTG‑GGC‑ACCGGGGCGCGCGGGTGGCCAAAGCCGGCGGGCGTGAGGTCCCGTTGTTTGGccc > 2:1043820/1‑239 (MQ=255) acCGTCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCa > 1:608545/1‑239 (MQ=255) acCGTCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑CATG‑GCT‑TCGTGGTCGGGCGACTGGCCAAAGAGGTCGGGCTTGAGGGGACGTTT‑TTTGCCCa > 1:1020222/1‑239 (MQ=255) tCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGTACTCCAGGTGTGTCGCGCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGTCGGCGCTGTGGGGTCGTGGTAATAACGGGGGC‑GGTGCGCT‑‑CGGGGGCGCGCGCGCGCCGAACGCGGGCGGCAGTGAGGGCGCGTCG‑TTCGccgcggca > 2:785060/1‑233 (MQ=255) tCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑GCGTGGTGGCGCGACTGGCCACAGCGGTCCGGCTTGAGGTGACGTTC‑TTGGCCCAGgag > 1:153561/1‑239 (MQ=255) tCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCAC‑GGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGgaga > 1:905879/1‑239 (MQ=255) cTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCCTGGTAATAACGGCGGC‑GCTG‑GCT‑TCGTGGTGGCGCGGCGGGCCACAGCCGTCGGCCTTGAGGGCCAGTTG‑TTGGACCCggggg > 2:625176/1‑236 (MQ=255) cgacgaTATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGCTGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCAGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCAGGGGAATAACGGCGGG‑GGTG‑GGT‑CTGTGGGCGCGGGACCGGCCAAAACAGACGGGGTTTGGGGCCCGTTG‑TTgggcacaggcggcgaacaa > 2:253026/1‑221 (MQ=255) cgacgaTATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCC‑ACGGGGGCGCGCGACGTGCCAAAGCGGGCGGCAGTGAGGTCACGGTG‑GTGGGCCCGGGGAGTGACcaa > 2:713422/1‑238 (MQ=255) ccgcGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GCTG‑GCTCACG‑GGTCGCGGGACTCGGCAACGCGGGCGGGCGTGGGGTCACCGTG‑TTTGCACCGGCCAGCGACAAACCGCTGGCGGGag > 2:411713/1‑239 (MQ=255) aaCGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGGCGGCCTTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCcgc > 1:527373/1‑238 (MQ=255) gcAGCTGTGCGGGGCCTCACCCTTTATGAGCTGATGCTCCGCGCCGGCGAGGCCGCATTCCGGGTGTGTCGTTCGGCTTACCCTGCCGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCAcg‑cg < 1:1077939/238‑1 (MQ=255) ttgtgtgggggCTCACCCTCTTGGAGCTGATGCTCCGCGCTGGCGGGGCCGCTTTCCGGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACCCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGc < 1:396215/231‑1 (MQ=255) gtgctggggcccccccctgttGAGGTGATGCTTGGCGCTGGCGGGGCCGCTTTCCAGGTGGGTCGTCCGGCGTAGCCTGGCGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑g < 2:1134000/219‑1 (MQ=255) gtgCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GAAG‑GCT‑ACGTGGGTGCGCGACCGGCCGAAGCGGTCGGGCTTGAGGGCGCGTTG‑TTGGCCCCGGGGAGGGGCAAAACGTTGGCGGACGAGGCCGCGGTGGCGCG‑CGACGCCT‑g > 2:88504/1‑239 (MQ=255) gCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCC‑ACGTGGTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCCGGCGAGCGACAAACCCTTGCCGGAAGAGGCCGGCCTGGCAcg‑cggaagccgggtaaac > 2:1007482/1‑224 (MQ=255) gCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑CGTG‑GCC‑ACGGGGGCGCGCGACTGGCCAAAACGGGCGGCGGTGAGGTGCCGGTG‑GTGGCCCAGGAGGGCGGCAAACCGCTTCCGGAAGAAGGCGCGCttggccgggaggcacgggtaaga > 2:391257/1‑216 (MQ=255) caccCTTTATGAGCTGAGGCTCCGCGCTGGCGAGGCCGCATCCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGCCGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCgg < 1:598516/239‑1 (MQ=255) cacaCTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GGTG‑GCC‑ACGTGGGCGCGCGACTGGCCAAAGAGGTCGGCCTTGAGGGCACCTTG‑TTGGCCCCGGAGAGCGACCAACCCTTGCCGGAAGAGGCAGCGCTGGCACC‑GCCAGGAT‑GGTTAAACGCgg > 2:1225164/1‑239 (MQ=255) cacaCTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GCTG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCCAAGCGGTCGGCATTGGGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCCCG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCgg > 1:912017/1‑239 (MQ=255) tctAGGAGCTGATGCTGCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCGGGTGTGTCGTCCGGCGTACCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGc < 1:60599/239‑1 (MQ=255) tGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTTCTGTGCGGTCATGGGAATAACGGCGGC‑GGTG‑GCT‑ACGTGGGCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGCGGTCACGTTG‑TTGGGCCAGGGGAGGGACCAACCGGTGCCGGGAAAGGGCGCGCTGGCCCG‑CGCAGCCTAGGTTaacgacgggggcggga > 2:716527/1‑225 (MQ=255) tGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGGGGTCACGGTG‑TTTGCCCCGGGGAGGGACAAAACGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGGAGCAC‑GGGTAAACGCGGGGGGGgaga > 2:499989/1‑239 (MQ=255) cTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GGTG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGGCCAAACGGTCGGCATTGAGGTCCCGTTG‑TTTGGCCCGGGGAGCGACCAACCGTTGCCGGGAGAGGCCCCGCCGGCGCG‑CGACGGAT‑GGTTACACGCGGGGGGGGAGCTc > 2:1064456/1‑237 (MQ=255) cTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGGATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGGTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGGTAAACGCGGGGGGCGGGATCCa > 1:71242/1‑239 (MQ=255) gATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGGAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGCGGGCGCGCGAATCGCCGAAGCGGGCGGGGTTGCGGGCACGGTT‑GTGGCCCCCGGGCGCGACAAAACCGTGCCGGGAGAGGCCCGGCTGGCCCGCCGAGGCAC‑GGCTAAGCCCggggggggggagcaag > 2:201918/1‑229 (MQ=255) tGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGGGCGACTGGCCCAAGCGGACGGCAGTGAGGGGACGTTG‑TTGGCCCCGGAGAGCGGCAAACCGTTGGCGGGAGAGGGCGGCCTGGCCAG‑CGAAGCAT‑GGGTAAAAGCgggggggggggtacgagat > 2:807325/1‑226 (MQ=255) tGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑CAGG‑GGT‑CCGTGGTCGTGCGCCTGGACAAAGCGGGCGGCATTGGGGTCACGTTG‑TTTGCCCAGGGCGGAGCCAAACCGCTGCCCGAAAAGGCCGCGCGTGCACG‑CGACACAT‑GGGTAAAGGCCGGGGGGGCGGTCCATGc > 2:815048/1‑238 (MQ=255) tGCTTCGCGCGGGCGGGGCCGCATTCCGGGTGTGGCGTTCGGCGTCCCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGc < 1:961784/238‑1 (MQ=255) ggttCGCGCTGGCGGGGCCGCCTTCCGGGTGTGCCGGTCGGCGTACCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCtt < 1:237365/237‑1 (MQ=255) ccGCATTCCGGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGcc < 1:821762/238‑1 (MQ=255) ttccgggggtggccGTTCGGCGTATCCGGCCGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAAt < 2:670893/226‑1 (MQ=255) aTTCCAGGTGTGTGGTCCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGa < 1:680635/237‑1 (MQ=255) ggggtggtccGTTCGGGGTACCCGGGCGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGt < 1:432838/230‑1 (MQ=255) cggttgtgtCGTTCGGCGTACCCGCGCGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGt < 1:1035170/235‑1 (MQ=255) gtgcggtggggCGTACCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGAt < 2:527373/229‑1 (MQ=255) gggcggtgcGGCGTCTCGTGGCGCCCGCCACGGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑GTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGag < 1:469369/230‑2 (MQ=255) tgtCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACCGGCCAAAGCGGTCGGCCTTGAGGGCACGTTG‑TTGGCCCCGGAGAGCGACAAACCCTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGGTAAACGCGGGTGGGGGGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGGCTCggggga > 2:162341/1‑232 (MQ=255) tgtCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACCTGGGCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCCGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCCGGCACC‑CGAAGCCT‑GGTTTAAAGCGGGGGGGGGGATCCATGCTTCGCATATTTT‑CTGGCGCCAATCGGTGGATc > 2:680635/1‑238 (MQ=255) tCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GGTG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCCAAGCGGTCGGCCTTGAGGGCACGTTG‑TTGGCCCCGGGGGGCGACAAACAGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCCGGCAAG‑CGAAGCCT‑GGTTAAACGCGGGGGGAGGGATCCCAGGTCTGACTATTGT‑CGTGCCCGCACTGGGAGATCTgg > 2:1063677/1‑238 (MQ=255) tCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GGTG‑GCT‑ACGGGGGCGCGCGACTGGCCCAAGCGGTCGGCCTTTAGGGCACGGTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGGAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGGGGGGGGAGCCCTGGCTCGGATATTGTCCTGGCCCGAA‑CGGGAGATCTgg > 2:973000/1‑238 (MQ=255) tCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGGGCGACTGGGCAAAGCGGTCGGGCTTGGGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGGGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCGGCGCTGGCGCG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACACGGGTGGCGCGATCCACGCTCCGAGTATTGT‑CTGGCCCGAATCGGGAggacgga > 2:1078789/1‑233 (MQ=255) tCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCC‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGGCACGGTG‑TTGGCCCCGGGGAGCGGCAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCCCTGGCCAG‑CGAAGCAC‑GGTTAAAAGCGGGGGGCGGGGTGCCTGCTTCGAATATTGT‑CTGGGCCCaacagggaagtcttg > 2:724916/1‑226 (MQ=255) tCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCC‑ACGGGGGCGCGCGGCTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGGCACGGTG‑TTTGCCCCGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAAGCCGCGCCGGCCCG‑CGGAGGCT‑GGGTGAAAGCGGGGGGCGAGGTGCCTGCTTCGAATTATGT‑CTGGCCCGacaccgcagggctgg > 2:479331/1‑225 (MQ=255) cgggCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGAttg < 1:713422/236‑1 (MQ=255) gtctCCTCACCCCCGCCCCTGGCTGTTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATg < 2:816237/236‑1 (MQ=255) gTATCCTGCCGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATg < 1:773892/239‑1 (MQ=255) ttCCGGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATgcg < 1:164106/238‑1 (MQ=255) gccgcccgccACTGGCTGGTTGTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTGGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCgctgct < 1:499647/237‑1 (MQ=255) gACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCgctgct < 1:415968/239‑1 (MQ=255) accaccgccCCTGGGTGGTGCTGGGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCgctgct < 2:564675/234‑1 (MQ=255) cgcccgccACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAACGGGCGGGATTGAGGGCACGTTG‑TTGGCCCCGGGGGGGGGACAACCGTTTCCGGGAGAGGCCGCGCTGGCCAG‑CCACGCAG‑GGGTAAACCCGGGGGGGGGGATCCATGCTTCGCATCTTTT‑TTGGCCCGAAACCGTAGGTcctgttttttgttgcctgcctc > 2:50730/1‑218 (MQ=255) ccgccCCTGGCTGGTGCTGGGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGGCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTa < 1:1011271/239‑1 (MQ=255) ccgccACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTa < 1:1054807/239‑1 (MQ=255) cgccACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGG‑GATG‑GCC‑ACGGGGTCGCCCGACTGGCCAAAGAGGTCGGCATTGAGGGGACGTTG‑GTGGCCCAGGAGGGAGAAAAAACGTTGCGGGAAGGGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAC‑GGTTAAACGCGGGGGGCGAGAGACAGGGCTCGCGTATTGG‑CTGGGCCGCATCGGGGGATCTGAGTGTTGGTGTGATGCTCGCTa > 2:255730/1‑238 (MQ=255) gctggTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGa < 1:400405/209‑1 (MQ=255) tGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCCAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTTGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGGAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGGAT‑GGTTAAAAGCGGGGGGCGAGATCCCTGCTTCCACTATTGT‑CTTGCCCCAATCGGGGGGTCTGATTGTTGTTGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCgggca > 2:1089704/1‑236 (MQ=255) tgtgCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAgcg < 1:162341/239‑1 (MQ=255) tgCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGGAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGGTAAACGCGGGTGGCGAGATCCCTGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGGAGGTCTGATTGTTTATGCGCTGCTCGGGACCCGTTTTGGGCAAgcgc > 2:889670/1‑238 (MQ=255) tgCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGGGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATAGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGGTTGCGGCAAgcgc > 1:206877/1‑238 (MQ=255) tgCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGGTGCCGGAAGAGGGCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGGGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGTTTGTTGATGCGCTGCCTGGTACCGGTTTGCGGCAAgcgc > 2:938325/1‑238 (MQ=255) tgCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GAGG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGGCGGCATTGGGGGCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGCCAAAACGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGGAGCAT‑GGTTAAACGCGGGGGGCGAGGTCCCTGCTTCGGATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGGTCTGATTGTTGATGAGCTGCTCGGTACCGGCTTGTGGCAAgggc > 2:895339/1‑238 (MQ=255) tCATGGTAATAACGGCGGC‑GGTG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGGCGGCATTTAGGTCACGTTG‑TTGGGCCAGGGGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGGCCG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGCGGCGGGATCCATGCTTTGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGGTCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGGACCGGTGTGCTGCCAGCCCCCcccg > 2:346761/1‑239 (MQ=255) tCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCcgcg > 1:337906/1‑239 (MQ=255) cATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGa < 1:88504/239‑1 (MQ=255) cATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGa < 2:608545/239‑1 (MQ=255) cATGGTAATAACGGCGGC‑GAGG‑GCT‑ACGTGGCCGCGCGAGTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGa < 2:55853/239‑1 (MQ=255) gTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGGCTGGGCAAAGCGGTCGGCATTGGGGTCCCGTTG‑TTGGCCCCGGAGAGCGGCCAACCGTTGCCGGAAGAGGGCGCGCTGGGCCG‑CGGAGCCT‑GGTTAAACGCGGGGGGCGTGATCCCTGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCCCTGCTCGGTTACCGTTTTCGGCAAGCGGCCCGCGagt > 2:209474/1‑235 (MQ=255) cggcggC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGcc < 1:479331/239‑1 (MQ=255) cggcggC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGcc < 1:446529/239‑1 (MQ=255) cggc‑gATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCCAAGCGGGCGGCCTTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGGAGAGGCCCCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGGGGCGAGATCCATGCTTCGCATATTGT‑CTTGGCCGAATCGGGCGATCTGATTGTTTATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCCAGCGCCCCGGGAATCCATTAGCCCGt > 2:347548/1‑239 (MQ=255) cggc‑gATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCAcg > 1:981456/1‑108 (MQ=255) cggc‑gATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGt > 1:871615/1‑239 (MQ=255) ggc‑gATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt > 1:852001/1‑239 (MQ=255) cT‑ACGTGGTCGCGCGATGGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TGGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCGTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGAc < 2:1046104/238‑1 (MQ=255) cT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGAc < 1:889670/238‑1 (MQ=255) ggTCGCGCGGCTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCt < 1:411577/238‑1 (MQ=255) ggTCGCGCGACAGGCCGAGGCGGGCGGCATTGAGGTCGCGGTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTGGCCGGAAAGGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTGCCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTATCCAGTTAATCGACCACGCt < 2:153561/238‑1 (MQ=255) cgcgcgACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAAt > 1:557999/1‑238 (MQ=255) cgcgcgACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAAt > 1:329558/1‑238 (MQ=255) gcgcgACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAAtt > 1:218400/1‑238 (MQ=255) gcgcgACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTc < 2:1112045/239‑1 (MQ=255) gcgcgACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTc < 1:346761/239‑1 (MQ=255) gcgcgACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTc < 2:852001/239‑1 (MQ=255) aaaGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGcc < 1:1064456/239‑1 (MQ=255) aGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGCTTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCCCGAATCCATTAGCCAGTTAGTCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGa > 2:702008/1‑239 (MQ=255) aGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGa > 1:620981/1‑239 (MQ=255) tCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGt < 1:798893/201‑1 (MQ=255) tCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTCATTCCCATCCTGCGCCGATtgtg > 2:52978/1‑239 (MQ=255) tCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATtgtg > 1:74273/1‑239 (MQ=255) cGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTgg < 1:733291/239‑1 (MQ=255) ggCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGc < 1:1007482/239‑1 (MQ=255) gCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGc < 2:905879/238‑1 (MQ=255) ggTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGATGgta > 2:406901/1‑239 (MQ=255) | AGTATACCACACACCGTCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTGTGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGCGACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCAT‑GGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTGGCGGTTGATA > NC_000913/4394100‑4394571 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |