| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,536,225 | T→A | 18.2% | intergenic (+193/+390) | yjhR → / ← nanS | pseudogene, helicase family, putative frameshift suppressor/9‑O‑acetyl N‑acetylneuraminic acid esterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,536,225 | 0 | T | A | 18.2% | 111.6 / 2.6 | 44 | intergenic (+193/+390) | yjhR/nanS | pseudogene, helicase family, putative frameshift suppressor/9‑O‑acetyl N‑acetylneuraminic acid esterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (7/28); new base A (6/2); total (14/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.51e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGC‑AATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATT‑AAGCATATCATCAT‑CGTCTATTT‑GCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGT‑GGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATGTCTATTAAGGCATCCGGCTAATCTGTAAGCAATAACA > NC_000913/4535999‑4536450 | aaTATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGC‑AATAATATAATAATGGcc < 1:182233/239‑1 (MQ=255) atatGGTAGGCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGC‑AATAATATAATAATGGCCTaa < 1:856422/239‑1 (MQ=255) tAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGGTTTTTTGGATTAAAGAAAAATGAAAGC‑‑ataatattatttttttctttttat > 2:186957/1‑223 (MQ=255) tCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGCGGGGAGCTTTT‑GGGATGAAAA‑AAAAAGCCAAC‑AATAACATTATAAATGCCTTATTTCttttt > 1:255984/1‑237 (MQ=255) tCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTTTTGATGAAAA‑AAAAAACAAGA‑CATAAAAtaataaatttttcttttacatct > 2:883889/1‑222 (MQ=255) cTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGC‑AATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGaa < 2:402605/239‑1 (MQ=255) tGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGTTGGTTTTATTGATTAAAG‑AAAAAGAAAGCAAATATAAAAATAATGGGCAAtttttttttac > 2:1089127/1‑236 (MQ=255) gATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTTTTGTTGAAAA‑AAAAAGCAACC‑AATAATATAAAAATAGCCTAATttttttttacta > 2:683162/1‑233 (MQ=255) cAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGGTTTTTTTAATGTAAA‑AAAAATCAAGG‑AAAAAAATAAAAATAGCCTAATTTTTTTTTAcattat > 2:76516/1‑239 (MQ=255) aaCGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGC‑AATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCAtt < 1:683162/239‑1 (MQ=255) cGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGC‑AATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGaa < 1:455772/230‑1 (MQ=255) cgcAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGGTAAGGCGGCTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGC‑AATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATG‑AAg < 2:1232949/237‑1 (MQ=255) cAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGC‑AATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATT‑AAGCa < 1:76516/239‑1 (MQ=255) tttAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGC‑AATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATT‑AAGCatat < 1:836220/238‑1 (MQ=255) aaaTGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTTGTTATTTAAA‑AAAATATAAGA‑AATAATATAATAATTGGCTAATTTTTTTTTACATCATT‑aaacccgtttct > 2:455772/1‑229 (MQ=255) gaGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGC‑AATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATT‑AAGCATATCATCAT‑CGTCTAt < 1:254868/239‑1 (MQ=255) aCAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGC‑AATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATT‑AAGCATATCATCAT‑CGTCTATTT‑GCCAGAATCCGt < 1:1096828/239‑1 (MQ=255) aGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGGTTTTTTGGATTAAAG‑AAAAATAAAAA‑AATAATATAAAAAAAGCCTAATTTTTTTTAACAACATT‑AAAAATATCATTAT‑CATCTATTT‑TCCATAATcactc > 2:294508/1‑234 (MQ=255) tagtaAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGGGCTTTTTGGAATGAAAA‑AAAAAACAAGC‑AATAAAATAATAAAAGCCTAAATTTTTTTTACAACATT‑AAAAATATCATAAT‑ATTCTATTT‑TCCAGAATCCCTCGACTta > 1:435029/1‑239 (MQ=255) gggCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGCCGGTTTTAGGAATAAAAG‑AAAATAGAAGC‑AATTATAAAATAATTACCCTCTTTCTTTTAACATCATTCAAACA‑ATTATCCT‑AGTCTATTT‑TCTCGAATCCCTCCACTTCTAAttt > 1:1101114/1‑236 (MQ=255) gCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGTCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGC‑AATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATT‑AAGCATATCATCAT‑CGTCTATTT‑GCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGc < 1:989394/237‑1 (MQ=255) ttttACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTGTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGC‑AATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATT‑AAGCATATCATCAT‑CGTCTATTT‑GCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACg < 1:172538/239‑1 (MQ=255) tttACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGC‑AATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATT‑AAGCATATCATCAT‑CGTCTATTT‑GCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACgg < 2:781996/239‑1 (MQ=255) tGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGGTTTTTTGAATGAAAA‑AAAAAGCAAAA‑AATAATATAATAATAGCCTAATTTTTTTTAAAATAATT‑AAAAAAATTATCATACTTCT‑TTT‑TCTCGAATACGTCGACCTTTAATCACCACAACGGCATATCac > 1:1085575/1‑238 (MQ=255) tAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGC‑AATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATT‑AAGCATATCATCAT‑CGTCTATTT‑GCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGa < 1:294508/238‑1 (MQ=255) gACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGC‑AATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATT‑AAGCATATCATCAT‑CGTCTATTT‑GCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGtgc < 1:738449/238‑1 (MQ=255) tttATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGC‑AATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATT‑AAGCATATCATCAT‑CGTCTATTT‑GCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCtg < 2:67344/239‑1 (MQ=255) gATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGC‑AATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATT‑AAGCATATCATCAT‑CGTCTATTT‑GCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGT‑GGCCCAAAACGTTCCAGTaaa < 1:622054/239‑1 (MQ=255) gATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTGTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGC‑AATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATT‑AAGCATATCATCAT‑CGTCTATTT‑GCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGT‑GGCCCAAAACGTTCCAGTaaa < 1:362747/239‑1 (MQ=255) aTTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTTTGAATTAAAA‑AAAATGCAAGC‑AATAAAATAAAAATGGGCTAATTTTTTTTTAAATCATT‑AAGAATATTATCAA‑CCTCTATTT‑TCCCGAATCCCTCGACTTTTAATAGCCCAAACAGCATATCAAGCAGGGGCTTGGACCGCTGTGGGCCCAAAAAG‑TCCAGTaaaaaatgtaggtggt > 2:794093/1‑226 (MQ=255) aTCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTTTGTATGAAAA‑AAAAAACAAAG‑GATAAAATAAAAAATGCCTTATTTTTTTTTACATCATT‑TATCAAATTATCAT‑CTTCTATTT‑TTTAGAATCCCTCCACTTATAAACTCCCAAAAGGCCTTTTAGGACGGGGCGTCGGACCCCTT‑GGGCCCAAACGCTCCCACAAACTGTTTAGACGTTCGTTGAttttc > 2:435695/1‑236 (MQ=255) aaTTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGC‑AATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATT‑AAGCATATCATCAT‑CGTCTATTT‑GCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGT‑GGCCCa < 1:1079794/196‑1 (MQ=255) ttCCTTTGAATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGC‑AATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATT‑AAGCATATCATCAT‑CGTCTATTT‑GCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGT‑GGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTTCCGAGCCAt < 1:794093/239‑1 (MQ=255) gCAAAAGGCTCCTGGGATTAAGGGC‑GTGGGTTTTTAGGAATAAAAA‑AAAATGAAAGA‑AATAATATAATAATGGCCTATTTTCTTTGAACATCATT‑AAGCATATCATCAT‑CGTCTATTT‑GCCAGAATCCGTCGATTTAAAATCGCCAGAACGGCATAGCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGG‑GGCCAAAAACGTCCAAATAAACGGTGTAGATGTTCGGAGATTTCCGAGCCATAATCGaa < 2:980358/239‑1 (MQ=255) gcgcCTGGGATTAATGGC‑GGGTGTTTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGC‑AATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATT‑AAGCATATCATCAT‑CGTCTATTT‑GCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGT‑GGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGgcgc < 1:570398/239‑1 (MQ=255) cgcTTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAG‑AAAATTCAAGC‑AATAATATAATAATGGCTTAATTTCTTTGAACATCATT‑AAGCATATCATCAT‑CGTCTATTT‑GCCAAAATCCGTCAACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGAGGGTGCTGCGAACGCTGT‑GGCCAAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGgcg < 1:302346/237‑1 (MQ=255) gcCTGGAATTAATGGA‑GGTTGTTTTAAGAAATAAAAG‑AAAAGCCAAGA‑AATAAAATAATAAGGGCTTAATTTCTTTGAACATCATT‑AAGCATATCAACAT‑CGTCATTTT‑GCCAGAATCCGTCGCCTTAAAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGT‑GGCCAAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGTTTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCgg < 2:1101114/239‑1 (MQ=255) gtGGGATAAATGGA‑GGGTGCTTTTAGGAATAAAAA‑AAAATGCAAGA‑AAAAATAAAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATT‑AAGCATATCATCAT‑CGTCTATTT‑GCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCGGGACGGTGCTGCGAACGCTGT‑GGCCAAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGAt < 1:854941/238‑1 (MQ=255) tGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGTAGAAAAT‑AAAATGCAAGC‑AATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAAAATCATT‑AAGCATATCATCAT‑CGTCTATTT‑GCCAGAATCCGTCGATTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCTAACGCTGT‑GGCCAAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATg < 1:240801/239‑1 (MQ=255) agaaaaa‑aaaaAGAAAGC‑AATAAAAAAAAAAGGGCCTAATTTCTTTAAACATCATA‑AAGCATACCATCAT‑CGTCAATTT‑GCAAGAATCCGTCGACTTAAAATCGCAAGAACGGCATATCAGGAGGGTGCTGCGAACGCTGT‑GGCCAAAAACGTTCCAGAAAACTGTGTAGATTTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATGTCTATTAAGGCATCCGGCTAATCTGTa < 2:333381/236‑1 (MQ=255) tGAAAG‑AAAATGCAAGC‑AATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATT‑AAGCATATCATCAT‑CGTCTATTT‑GCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGT‑GGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATGTCTATTAAGGCATCCGGCTAATCTGTaa > 2:203225/1‑239 (MQ=255) gtcagatgtgtataagaaacaaatataataATGGCCTAATTTCTTTGACCATCATT‑AAGCATATCATCAG‑CGTTTATTT‑GCCAGAATCCGGCGATTTATAATCGCAAGAACGTAATATGAGGAAGGTGCGGCAAACGCTGT‑GGCCAAAAACGTTCAAGAAAACTGGGAAGATGTTCGAAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATGTCTATTAAGGCATCCGGCTAATCTGTa < 2:556863/218‑1 (MQ=255) aaag‑aaaagaCAAGC‑AATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTAAACATCATT‑AAGCAAACCATCAT‑CGTCTTTTG‑GCCAGAATCGGTCGCTTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGT‑GGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTGGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATGTCTATTAAGGCATCCGGCTAATCTGTAAGc < 1:110066/239‑1 (MQ=255) aaaa‑aaaaTGCAAGA‑AATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATT‑AAGCATATCACCAT‑CGTCTATTT‑GCAATAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGCCATAGCAGGACGGTGCTGGGAACGCTGT‑GGCCAAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTCCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATGTCTATTAAGGCATCCGGCTAATCTGTAAGc < 2:91214/239‑1 (MQ=255) aag‑aaaATGCAAGC‑AATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATT‑AAGCATATCATCAT‑CGTCTATTT‑GCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGT‑GGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATGTCTATTAAGGCATCCGGCTAATCTGTAAGCa > 1:333381/1‑239 (MQ=255) aTGCAAGC‑AATAATATAATAATGCCCTAATTTCTTTGAACATCATT‑AATCATATCATCAT‑CGTCTATTT‑GCCTGAGTCCGTCGACTTATAACCGCCAGAACGGCATATCAGGTCGGTGCTGCGAACGCTGT‑GGCCCAAAACGTTCAAGTAAACTGTGTATATGTTCTTAGATTCCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATGTCTATTAAGGCATCCGGCTAATCTGTAAGCAATaaca < 1:439210/239‑1 (MQ=255) aaagagaaagtaataaaataATGGCTTAATTTTTTTGAACATCATT‑AAGCATACAATCAT‑‑GTTTATTTGGCAAGACTCCGGCGACTTATAACCGCCAGAACGGCATATCAGGAGGGTGCTGCGAACGCTGT‑GGCCCAAAACGTCCCAGTAACCTTTGTAGATGTTGGTAGATTCCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATGTCTATTAAGGCATCCGGCTAATCTGTAAGCAATaaca < 2:193256/229‑1 (MQ=255) atataataATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATT‑AAGCATATCATCAT‑CGTCTATTT‑GCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGT‑GGCCCAAAACGTTCCAGTaaa > 2:79067/1‑140 (MQ=255) atataataATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATT‑AAGCATATCATCAT‑CGTCTATTT‑GCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGT‑GGCCCAAAACGTTCCAGTaaa < 1:79067/140‑1 (MQ=255) | AATATATGGTAGTCTGGATCAACGTCAGCTTTAAATGTGATGAGCCGTTCATGATACAGGAGTAGTAAAGGGCATATTTTACCAATGTTAAGGCGACTTTCCGTTTTATTGCGAGTCGCCTTTCCTGATTATAAATCTTATTGTTTACCTAATCATTTTCCTTTGCATAATGCGCCTGGGATTAATGGC‑GGGTGCTTTTAGGAATGAAAG‑AAAATGCAAGC‑AATAATATAATAATGGCCTAATTTCTTTGAACATCATT‑AAGCATATCATCAT‑CGTCTATTT‑GCCAGAATCCGTCGACTTATAATCGCCAGAACGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGT‑GGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGATGTTCGTAGATTTCCGAGCCATAATCGAAAAGGCGCGGATGTCTATTAAGGCATCCGGCTAATCTGTAAGCAATAACA > NC_000913/4535999‑4536450 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |