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| * | NC_000913 | 4,571,097 | 0 | A | G | 14.7% | 162.3 / 2.0 | 73 | L160P (CTC→CCC) | yjiR | putative DNA‑binding transcriptional regulator/putative aminotransferase |
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ccGCTGGTGATGATGATGTCATCGGCGGTGACCACCGAGCCGCTGTC‑GAGCATCAGGCGGGCAATCTGCTCTCGCAATACTCGCTGACCGGCTAACAAGTCATAACCGAGAACGGTTTGCAG‑ATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAG‑C‑GGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACG‑G‑AACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTCCAGCa < 1:474660/238‑1 (MQ=255) cGCTGGTGATGATGATGTCAGCGGCGGTGACCCCCGAGCCGCTGTC‑GAGCATCAGGCGGGCAATCTGCTCTCGCAATACTCGCTGACCGGCTAACAAGTCATAACCGAGAACGGTTTGCAG‑ATTATGCTGCACCCCCCGGCTTAGCTCCCGCCACAG‑C‑GGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACG‑G‑AACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTCCAGc < 1:67149/236‑1 (MQ=255) gTGATGATAATGTCATCGGCGGTGACCCCCGAGCCGCTGTC‑GAGCATCAGGCGGGCAATCTGCTCTCGCAATACTCGCTGACCGGCTAACAAGTCATAACCGAGAACGGTTTGCAG‑ATTATGCTGCCCCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAG‑C‑GGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACG‑G‑AACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTCCAGCATATCCa < 2:795671/238‑1 (MQ=255) tgatgagaaTGTCATCGGCGGTGACCCCCGGCCCGCTGTC‑GAGCATCAGGCGGGCAATCTGCTCTCGCAATACTCGCTGACCGGCTAACAAGTCATAACCGAGAACGGTTTGCAG‑ATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAG‑C‑GGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACG‑G‑AACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTCCAGCATATCCAg < 2:805923/238‑1 (MQ=255) atgatgatgTCCTCGGCGGTGACCCCCGAGCCGTTGTC‑GGGCATCAGGCGGGCAATCTGCTCGCGCAATACTCGCTGACCGGCTAACAAGTCATAACCGAGAACGTTTTGCAG‑ATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAG‑C‑GGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACG‑G‑AACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTCCAGCATATCCAGCa < 1:303067/238‑1 (MQ=255) tgatgTAATCGGCGGTGACCCCCGAGCCGCTGTC‑GAGCATAAGGCGGGCAATCTGCTCTCGCAATACTCGCTGACCGGCTAACAAGTCATAACCGAGAACGGTTTGCAG‑ATTATGCTGCCCCCCCCGGCTTAGCTCCCGCCACAG‑C‑GGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACG‑G‑AACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTCCAGCATATCCAGCACCTGa < 2:1100266/239‑1 (MQ=255) gcttCGGCGGTGACCTCCGAGCCGTGGTG‑GAGCAACAGGCGGGCAATCTGCTCTCGCAATACTCGCTAACCGGCTAACAAGTCACAACCGAAAACGGTTTGCAG‑ATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAG‑C‑GGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACG‑G‑AACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTCCAGCATATCCAGCACCTGATCCCa < 1:412499/236‑1 (MQ=255) ccacgggcggTGCCCACGGACCCGCGGCC‑GACCACCAGGCGGGAAATCTGCTCCCGCAATCCGCGCTGACCGGCTAAAAAGTCATACCCGAGAACGGTTTGCAG‑ATTATGCTGCACCCCCCGGCTTAGCTCCCGCCACAG‑C‑GGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACG‑G‑AACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTCCAGCATATCCAGCACCTGATccc < 2:1198226/233‑1 (MQ=255) cagcggcggTGACCCCCGAGCCGCTGTC‑GAGCATCAGGCGGGCAATCTGCTCTCGCAATACTCGCTGACCGGCTAACAAGTCATAACCGAGAACGGTTTGCAG‑ATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAG‑C‑GGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACG‑G‑AACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTCCAGCATATCCAGCACCTGATCCCAc < 1:760871/236‑1 (MQ=255) cATCGGCGTTGCCCCCCGAGCCGCTGTC‑GAGCATCAGGCGGGCAATCTGCTCTCGCAATACTCGCTGACCGGCTAACAAGTCATAACCGAGAACGGTTTGCAG‑ATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAG‑C‑GGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACG‑G‑AACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTCCAGCATATCCAGCACCTGATCCCa < 1:109078/238‑1 (MQ=255) tCGGCGGTGACCACCCAGCCCCTGTC‑GAGCATCAGGCGGGCAATCTGCTCTCCCAATACTCGCTGACCGGCTAACAAATCATAAACCAGAACGGGTTGCCG‑ATTATGCTGCACCACCCGGCTTTGCTCCCCCCACAG‑C‑GGTTTCCGGCTCGGGGCCTCGACATCCCGTGTGCGTTTTCTTTACG‑G‑AACAATAGAACAGCCCCTATGCGCCCCCCGCATATCCACCACCTGATCCCCCtc > 2:976393/1‑238 (MQ=255) ggcggTGACCCCCGAGCCGCTGTC‑GAGCATCAGGCGGGCAATCTGCTCTCGCAATACTCGCTGACCGGCTAACAAGTCATAACCGAGAACGGTTTGCAG‑ATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAG‑C‑GGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACG‑G‑AACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTCCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTgg < 1:340887/238‑1 (MQ=255) 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cGAGCCGCTGTC‑GAGCATCAGGCGGGCAATCTGCTCTCGCAATACTCGCTGACCGGCTAACAAGTCATAACCGAGAACGGTTTGCAG‑ATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAG‑C‑GGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACG‑G‑AACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTCCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCg > 2:1061488/1‑239 (MQ=255) | TGTTCCAGCGCCAGTTCCAGCGCTTCAACGCTGATGCCAGTTTCTGGATCGGTTGGGATTTCAATCACTTTCACGCCCATGCCGCGCAGCATCTGCATCGAACCGTAATAACAGGGGGATTCGACCGCGACAATATCGCCCGGTTTACACACTGCCATTAACGCCAGCGACATCGAGTTATGGCAGCCGCTGGTGATGATGATGTCATCGGCGGTGACCACCGAGCCGCTGTC‑GAGCATCAGGCGGGCAATCTGCTCTCGCAATACTCGCTGACCGGCTAACAAGTCATAACCGAGAACGGTTTGCAG‑ATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAG‑C‑GGTTTCAGGCTGGGCGCTTCGACATCCGGTGTGCTTTTGCTTAACG‑G‑AACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTCCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCG > NC_000913/4570863‑4571322 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |