Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 1,238,523:1 | +G | 3.3% | coding (953/1299 nt) | dadA → | D‑amino acid dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,238,521 | 1 | . | G | 3.3% | 520.6 / 10.8 | 122 | coding (951/1299 nt) | dadA | D‑amino acid dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (68/50); new base G (2/2); total (70/52) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.46e-01 |
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
AGTGTGGCGATGAAGTGATTAAGGCCGATGCGTATGTGATGGCGTTTGGTTCTTACTCGACGGCGATGCTCAAAGGCATTGTTGATATTCCGGTGTATCCGCTGAAAGGCTACTCGCTGACCATTCCAATTGCGCAGGAAGATGGTGCGCCGGTATCCACCATTCTTGATGAAACCTACAAAATCGCCATTACCCGTTTCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTT‑GGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAACGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTGGACTGGTCTGCGCCCGATGACGCCAGACGGCACGCCGGTTGTCGGGCGTACACGCTTTAAAAATCTGTGGCTGAATACCGGTCACGGCACGCTCGGCTGGACGATGGCTTGCGGTTCCGGTCAGTTGTTAAGC > NC_000913/1238283‑1238755 | aGTGTGGCGATGAAGTGATTAAGGCCGATGCGTATGTGATGGCGTTTGGTTCTTACGCGACGGCGATGCTCAAAGGCATTGGTGATATTCCGGTGTATCCGCTGAAAGGCTACTCGCTGACCATTCCAATTGCGCAGGAAGATGGTGCGCCGGTATCCACCATTCTTGATGAAACCTACAAAATCGCCATTACCCGTTTCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGAttgtt < 2:1280050/239‑1 (MQ=255) ggCGATGAAGTGATTAAGGCCGATGCGTATGTGATGGCGTTTGGTTCTTACTCGACGGCGATGCTCAAAGGCATTGTTGATATTCCGGTGTATCCGCTGAAAGGCTACTCGCTGACCATTCCAATTGCGCAGGAAGATGGTGCGCCGGTATCCACCATTCTTGATGAAACCTACAAAATCGCCATTACCCGTTTCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTT‑GGttt > 1:6286/1‑239 (MQ=255) aaGTGATTAAGGCCGATGCGTATGTGATGGCGTTTGGTTCTTACTCGACGGCGATGCTCAAAGGCATTGTTGATATTCCGGTGTATCCGCTGAAAGGCTACTCGCTGACCATTCCAATTGCGCAGGAAGATGGTGCGCCGGTATCCACCATTCTTGATGAAACCTACAAAATCGCCATTACCCGTTTCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTT‑GGTTTTAATAcc > 2:24971/1‑239 (MQ=255) gTGATTAAGGCCGATGCGTATGTGATGGCGTTTGGTTCTTACTCGACGGCGATGCTCAAAGGCATTGTTGATATTCCGGTGTATCCGCTGAAAGGCTACTCGCTGACCCTTCCAATTGCGCAGGAAGATGGTGCGCCGGTATCCACCATTCTTGATGAAACCTACAACATCGCCATTACCCGTTTCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGCGATTGTT‑GGTTTTAATACCGa > 2:308110/1‑239 (MQ=255) 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aTGCGTATGTGATGGCGTTTGGTTCTTACTCGACGGCGATGCTCAAAGGCATTGTTGATATTCCGGCGTATCCGCTGAAAGGCTACTCGCTGACCATTCCAATTGCGCAGGAAGATGGTGCGCCGGTATCCACCATTCTTGATGAAACCTACAAAATCGCCATTACCCGTTTCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTT‑GGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAAcc > 1:248383/1‑238 (MQ=255) gCGTATGTGATGGCGTTTGGTTCTTACTCGACGGCGATGCTCAAAGGCATTGTTGATATTCCGGTGTATCCGCTGAAAGGCTACTCGCTGACCATTCCAATTGCGCAGGAAGATGGTGCGCCGGTATCCACCATTCTTGATGAAACCTACAAAATCGCCATTACCCGTTTCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTT‑GGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACcgcg < 2:1365811/239‑1 (MQ=255) tATGTGATGGCGTTTGGTTCTTACTCGACGGCGATGCTCAAAGGCATTGTTGATATTCCGGTGTATCCGCTGAAAGGCTACTCGCTGACCATTCCAATTGCGCAGGAAGATGGTGCGCCGGTATCCACCATTCTTGATGAAACCTACAAAATCGCCATTACCCGTTTCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTT‑GGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGcgtcg > 1:1123088/1‑239 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |