| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2643098 | 128 (0.990) | 5 (0.040) | 5/400 | NT | 3.8% | intergenic (‑256/+29) | rodZ/rlmN | MreB assembly cytoskeletal protein/dual specificity 23S rRNA m(2)A2503, tRNA m(2)A37 methyltransferase, SAM‑dependent |
| ? | NC_000913 | = 2643108 | 136 (1.130) | intergenic (‑266/+19) | rodZ/rlmN | MreB assembly cytoskeletal protein/dual specificity 23S rRNA m(2)A2503, tRNA m(2)A37 methyltransferase, SAM‑dependent | |||||
TACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGAAACATCCGTTAAGTTAACCGTTATCATACAGTATAAGACCGTCTGTGTGCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2642853‑2643098‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cattacgccacggtTACTTTATGT‑ACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATATTAACGGTGCGTTTTTGCTGACTTTAAGGCAGTATGTAACGATGCAACAGTAAGTTAGCCTTAGTGAATGTGGGCTTTGTCACGAGCACACAGACGGTCTTATACTGTATGATAACGGTTAACTTAACGGATGTTTCGCGGTGTGGGTGAGCATGATGGTTCACCGGCA < NC_000913/2643108‑2642875 TACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGAAACATCCGTTAAGTTAACCGTTATCATACAGTATAAGACCGTCTGTGTGCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTA < 1:79513/237‑1 TTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGAAACATCCGTTAAGTTAACCGTTATCATACAGTATAAGACCGTCTGTGTGCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACTCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCAC < 2:832224/238‑1 TTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGAAACATCCGTTAAGTTAACCGTTATCATACAGTATAAGACCGTCTGTGTGCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCAC < 1:587444/238‑1 TTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGAAACATCCGTTAAGTTAACCGTTATCATACAGTATAAGACCGTCTGTGTGCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCAC < 2:542993/238‑1 TTAAATGAGAAGTGAGATGCCGGTGACCCATCATGCACCCCCACACCGCGAAACATCCGTTAAGTTAACCGTTATCATACAGTATAAGACCGTCTGTGTGCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCAC < 1:734775/238‑1 TAAGACCGTCTGTGTGCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACG < 1:1149512/150‑1 TAAGACCGTCTGTGTGCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACG > 2:1149512/1‑150 GACCGTCTGTGTGCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATATTAACGGTGCGTTTTTGCT > 2:920460/1‑238 TCTGTGTGCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTC > 2:853684/1‑210 TCTGTGTGCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTC < 1:853684/210‑1 GCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATATTAACGGTGCGTTTTTGCTGACTTTAAGGCA < 1:920460/238‑1 CTAACTTACTGTTGCATCGGTACATACTGGCTTAAAGTAAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAAGACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG‑TACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATATTAACGGTGCGTTTTTGCTGACTTTAAGGCAGTATGTAACGATGCAACAGTAAGTTAGC < 2:1115256/237‑1 GACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCAC < 1:312388/48‑1 GACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCAC > 2:312388/1‑48 ATTACGCCACGGTTACTTTATGT‑ACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATATTAACGGTGCGTTTTTGCTGACTTTAAGGCAGTATGTAACGATGCAACAGTAAGTTAGCCTTAGTGAATGTGGGCTTTGTCACGAGCACACAGACGGTCTTATACTGTATGATAACGGTTAACTTAACGGATGTTTCGCGGTGTGGGTGAGCATGATGGT > 1:1324005/1‑238 ATTACGCCACGGTTACTTTATGT‑ACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATATTAACGGTGCGTTTTTGCTGACTTTAAGGCAGTATGTAACGATGCAACAGTAAGTTAGCCTTAGTGAATGTGGGCTTTGTCACGAGCACACAGA > 2:1381008/1‑172 ATTACGCCACGGTTACTTTATGT‑ACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATATTAACGGTGCGTTTTTGCTGACTTTAAGGCAGTATGTAACGATGCAACAGTAAGTTAGCCTTAGTGAATGTGGGCTTTGTCACGAGCACACAGA < 1:1381008/172‑1 ttCGCCACGGTTACTTTATGT‑ACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATATTAACGGTGCGTTTTTGCTGACTTTAAGGCAGTATGTAACGATGCAACAGTAAGTTAGCCTTAGTGAATGTGGGCTTTGTCACGAGCACACAGACGGTCTTATACTGTATGAT < 1:1378227/187‑1 TACGCCACGGTTACTTTATGT‑ACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGTTCAATATTAACGGTGCGTTTTTGCTGACTTTAAGGCAGTATGTAACGATGCAACAGTAAGTTAGCCTTAGTGAATGTGGGCTTTGTCACGAGCACACAGACGGTCTTATACTGTATGAT > 2:1378227/1‑189 TACGCCACGGTTACTTTATGT‑ACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATATTAACGGTGCGTTTTTGCTGACTTTAAGGCAGTATGTAACGATGCAACAGTAAGTTAGCCTTAGTGAATGTGGGCTTTGTCACGAGCACACAGACGGTCTTATACTGTATGATAACGGTTAACTTAACGGATGTTTCGCGGTGTGGGTGAGCATGATGGTTC > 1:977707/1‑238 TACGCCACGGTTACTTTATGT‑ACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATATTAACGGTGCGTTTTTGCTGACTTTAAGGCAGTATGTAACGATGCAACAGTAAGTTAGCCTTAGTGAATGTGGGCTTTGTCACGAGCACACAGACGGTCTTATACTGTATGATAACGGTTAACTTAACGGATGTTTCGCGGTGTGGGTGAGCATGATGGTTC > 2:576587/1‑238 TACGCCACGGTTACTTTATGT‑ACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATATTAACGGTGCGTTTTTGCTGACTTTAAGGCAGTATGTAACGATGCAACAGTAAGTTAGCCTTAGTGAATGTGGGCTTTGTCACGAGCACACAGACGGTCTTATACTGTATGATAACGGTTAACTTAACGGATGTTTCGCGGTGTGGGTGAGCATGATGGTTC > 2:592546/1‑238 CACGGTTACTTTATGT‑ACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATATTAACGGTGCGTTTTTGCTGACTTTAAGGCAGTATGTAACGATGCAACAGTAAGTTAGCCTTAGTGAATGTGGGCTTTGTCACGAGCACACAGACGGTCTTATACTGTATGATAACGGTTAACTTAACGGATGTTTCGCGGTGTGGGTGAGCATGATGGTTCACCGG < 2:102483/238‑1 CACGGTTACTTTATGT‑ACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATATTAACGGTGCGTTTTTGCTGACTTTAAGGCAGTATGTAACGATGCAACAGTAAGTTAGCCTTAGTGAATGTGGGCTTTGTCACGAGCACACAGACGGTCTTATACTGTATGATAACGGTTAACTTAACGGATGTTTCGCGGTGTGGGTGAGCATGATGGTTCACCGG < 2:1324005/238‑1 ACGGTTACTTTATGT‑ACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATATTAACGGTGCGTTTTTGCTGACTTTAAGGCAGTATGTAACGATG < 1:648201/114‑1 ACGGTTACTTTATGT‑ACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATATTAACGGTGCGTTTTTGCTGACTTTAAGGCAGTATGTAACAATG > 2:648201/1‑114 CGGTTACTTTATGT‑ACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATATTAACGGTGCGTTTTTGCTGACTTTAAGGCAGTATGTAACGATGCAACAGTAAGTTAGCCTTAGTGAATGTGGGCTTTGTCACGAGCACACAGACGGTCTTATACTGTATGATAACGGTTAACTTAACGGATGTTTCGCGGTGTGGGTGAGCATGATGGTTCACCGGCA > 1:500976/1‑238 CGGTTACTTTATGT‑ACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATATTAACGGTGCGTTTTTGCTGACTTTAAGGCAGTATGTAACGATGCAACAGTAAGTTAGCCTTAGTGAATGTGGGCTTTGTCACGAGCACACAGACGGTCTTATAATGTATGATAACGGTTAACTTAACGGATGTTTCGCG > 1:851889/1‑209 CGGTTACTTTATGT‑ACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATATTAACGGTGCGTTTTTGCTGACTTTAAGGCAGTATGTAACGATGCAACAGTAAGTTAGCCTTAGTGAATGTGGGCTTTGTCACGAGCACACAGACGGTCTTATAATGTATGATAACGGTTAACTTAACGGATGTTTCGCG < 2:851889/209‑1 TACGTTTAAATGAGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGAAACATCCGTTAAGTTAACCGTTATCATACAGTATAAGACCGTCTGTGTGCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2642853‑2643098‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cattacgccacggtTACTTTATGT‑ACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATATTAACGGTGCGTTTTTGCTGACTTTAAGGCAGTATGTAACGATGCAACAGTAAGTTAGCCTTAGTGAATGTGGGCTTTGTCACGAGCACACAGACGGTCTTATACTGTATGATAACGGTTAACTTAACGGATGTTTCGCGGTGTGGGTGAGCATGATGGTTCACCGGCA < NC_000913/2643108‑2642875 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |