Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,206,434 | 0 | C | A | 13.3% | 260.5 / 3.7 | 123 | intergenic (‑180/‑27) | ttdR/ttdA | transcriptional activator of ttdABT/L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (42/58); new base A (4/14); total (51/72) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.26e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCA‑TTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATT‑CACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGA‑CAAATAC‑AAAAACTGGAGTTGCCAT‑GATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCA‑GTGAATAAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCTAAC‑TTTACCGCCATG‑ATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACT‑AAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATAC‑GATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTG > NC_000913/3206197‑3206668 | tgtgAACGATTTCTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCA‑TTCCCTGCTCTGGCGTAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATT‑CACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCa < 1:1427289/239‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |