| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,206,504 | C→A | 13.7% | T15K (ACA→AAA) | ttdA → | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,206,504 | 0 | C | A | 13.7% | 271.5 / 4.7 | 125 | T15K (ACA→AAA) | ttdA | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (45/59); new base A (7/12); total (54/71) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.01e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
AGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCA‑TTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATT‑CACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATAC‑AAAAACTGGAGTTGCCAT‑GATGAGCGAAAGTAATAAGCAA‑‑‑‑CA‑‑‑GGCAGTGAATAAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCTAAC‑TTTACCGCCATG‑ATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATAC‑GATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCCACTGCTTGGCGAGCTGC > NC_000913/3206279‑3206740 | aGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCA‑TTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATT‑CACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTTAGACAAATAA‑AAAAAAATGAGTTGTCATGGTTGAG‑GGAAGTAAAAAACAA‑‑‑‑CA‑‑‑AGCAGGGAAAAAAGTG‑ACAGAGATGTTCGc > 2:894581/1‑238 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |