Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,145,075 | A→C | 14.6% | N361T (AAC→ACC) | pflD → | putative glycine radical domain‑containing pyruvate formate‑lyase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,145,075 | 0 | A | C | 14.6% | 344.5 / 3.9 | 167 | N361T (AAC→ACC) | pflD | putative glycine radical domain‑containing pyruvate formate‑lyase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (81/47); new base C (2/33); total (83/84) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.59e-10 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
TCATTAACCCAGGGCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCTTGCATGACATCGCGATGTTTAATCTGCT > NC_000913/4144840‑4145312 | gcggtgaCCCAGGGCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAAcc < 1:1417232/232‑1 (MQ=255) catTAACCCAGGGCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCCAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCt > 1:299653/1‑238 (MQ=255) catTAACCCAGGGCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTc < 1:945934/239‑1 (MQ=255) catTAACCCAGGGCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTc > 1:111661/1‑239 (MQ=255) ttAACCCAGGGCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCg > 2:854982/1‑238 (MQ=255) ttAACCCAGGGCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGGGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCg > 2:1224472/1‑238 (MQ=255) aaCCCAGGGCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCg > 1:67600/1‑239 (MQ=255) cccAGGGCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACTGCACTGCTCGGCGGGTTAACCCAGAACGGACGGAACCCGGTGAAGGAGCTTTCGTTCGCTT‑GCCCTGCCGCCTATCAAC‑ACGAGC‑ACTTACCGCAACCGAACCTCGGCgg > 2:1333378/1‑237 (MQ=255) ccaggCGAAGATGAGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCTCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTCCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCGCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTgcg < 2:1166260/236‑1 (MQ=255) cAGGGCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTgcg < 1:1322237/239‑1 (MQ=255) gggCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGGACCTCGGCGTgcgc > 1:1261390/1‑238 (MQ=255) gggCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTc > 1:165593/1‑229 (MQ=255) gggCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGGGC‑AATTACCGCAACCGACCCTCGGCGtcccc > 2:281961/1‑234 (MQ=255) gggCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGCAGCGCGGTGAACGGGCTTTCGTTCCTTT‑TCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGCACCTCGGCGTgcgc > 1:591420/1‑238 (MQ=255) gggCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACCTAGCGCGGTGAACGGGCTTTCGTTCCCTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGTACCTCGGCGTgcgc > 1:335447/1‑238 (MQ=255) cGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACt < 1:1257701/238‑1 (MQ=255) cGAAGAGGAGGCGTGACTGGAAGAACTGATAGAATCGTTATGGTTGAAATGAAACGACACCGTGCTGTTGCGCACCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGGTTCCCGACCGGGTAGACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGCACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCGATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAGCCGAACCTCGGCGTGCGAACt < 2:484040/238‑1 (MQ=255) gAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑a < 1:399840/238‑1 (MQ=255) aGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AAc > 1:1292573/1‑238 (MQ=255) tGCGGCGTTCGTGAAAGAACTTCTCGAAGCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCAACAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGcc < 2:1123941/238‑1 (MQ=255) agcggcgTCGTTGAAAGACCTGCGCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAGCGGCCGCGTGCTTTGTGGCTCCACCGGTGGCGCGCATGAATCCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAAACGAGAACGGACGTATCGCTGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCGTGTCGCCTATCATA‑GCGTGC‑AATTTCCGCAACCGAGCCTCGGCGTGCGCACT‑AACGc < 2:1344514/236‑1 (MQ=255) cggcgTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTg < 2:504219/224‑1 (MQ=255) cggcgTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTg > 1:504219/1‑224 (MQ=255) cggcgTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCCCT‑AACGCCTTg > 2:359801/1‑239 (MQ=255) cggcgTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTg > 1:233768/1‑239 (MQ=255) tCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ac < 1:926146/239‑1 (MQ=255) gAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCACCCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGc < 1:401855/239‑1 (MQ=255) aCTGCTCGAAGCTTTATGGGGCAAATGCACCGCCATCGTTCTGTTGCGTTCCTCCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGTTTTCCCGGCCGGCTATACCGCGCTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTTCCGCACCCGAGCCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTc < 2:834806/238‑1 (MQ=255) tGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCtg > 1:107806/1‑239 (MQ=255) aTCTTTAGGGGTGAAATGCAACGACATCTGGTTTTTGCCCTCCCCCGTTAGCGCGCGTTTTTTCGCCGGTTTCCCGCCCGGCTTTCCCGCATTGCGCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTG‑GCCTTGCCGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTCCCGAAACCGACCCTCGGCGTGCGCACT‑ACCGCTTTGA‑TCG‑CCACGCCGTCCCTGAGGaaa < 2:67600/238‑1 (MQ=255) aaaTGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAACACCGCCGAAAACAt > 2:193264/1‑239 (MQ=255) aaaTGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCAGAAACCAt > 2:842044/1‑239 (MQ=255) aaTGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCAGAAACCAtt < 1:842044/239‑1 (MQ=255) aaCGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACAAGCCGGTCCTGCTGAAAACCGCCGAAACCATTCGCt > 2:1391665/1‑238 (MQ=255) aaCGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTGGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCACCCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCtt < 1:983132/239‑1 (MQ=255) aCGACATCGTGCGGTTGCGCGCCCCCAGGAGCGCGCTTTATCTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCATTGCTCGGCGGGTTAACCGAGGACTGGCGTGGCGCGGTGAACGTGCTTCCGTTCCTTT‑TCCTTGACGCCAAACAAA‑GGGTGC‑AATTCCCGAAACCGAACTTCGGCGTGCGAACA‑AACGACTTGA‑TCG‑ACACGCTTTTCCTGATGAAACCCGCCGAAACCATTCGCTTc < 2:555256/239‑1 (MQ=255) gaccgcggccTGTTGCGCTCGCCCAGTAGGGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGTCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACGGAGAACGGACGTAGGGCGGTGAACGTGTTTTCGTCCCTTT‑GCCTTGAGGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCACCCGACCCCCGGCGTGCGCACT‑AACGCTTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCgg < 2:726762/230‑1 (MQ=255) cgctgccggtggccccccaccaGAGGCGCGCGTTTTTTCGCCGGTTCCCCGCCCGGCTATCCCGCAGTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTGGACGCCTATCAAA‑GCGGGC‑AATTCCCGCAACCGAACCTCGGCGGGCGCACT‑AACGCTTGGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTAc < 2:481069/223‑1 (MQ=255) gTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGGGAACGGGCGGAGCGCGGTGGACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCCTGACGGCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAAACCAAAATCGCCGCGCGCAAT‑AATGCCTTGT‑TCG‑ACCCGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCCAAAACATTCTCTTCGGTACCgg > 2:1440725/1‑239 (MQ=255) gcgcgTTTTTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTAAACCGCACTGCTCGGGGGGTTACCCGAGAACGGACGTAGCGCGGTAAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTCCCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑ACCGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATg < 2:20922/238‑1 (MQ=255) gcgcgTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TTG‑ACACGCCCGTCCTGATGACAACCCCCGCAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCCTTGACGATGa > 2:742818/1‑239 (MQ=255) gcgcgTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGa > 1:543794/1‑239 (MQ=255) gcgcgTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGa > 1:1126217/1‑239 (MQ=255) gcgtaattccgcggttcccccGCCGGGCTACACCGCACTGCGCGGCGGGTTACCCGAGACCGGACGAAGCGCGGTGAACGGGCTTTCGTTCCTTT‑CCCTTGACGCTTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCACCCGACCCTCGCCGGGCGCCCT‑ACCGCCTTGA‑TGG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGaa < 2:111661/220‑1 (MQ=255) cgTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGGGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAACACCGCCGAAACCCTTCGCTTCGGTCCCGGTATTCCGCAAATCTTTACAGATGaaat > 2:660844/1‑237 (MQ=255) cGGTTCCCCCACCGGTTATGCCGCGCTCTCCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTTCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCACCCGACCCTCGGCTTGCCCCCA‑ACCGCCTTGA‑CCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAg < 2:693690/239‑1 (MQ=255) ggCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GACTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCg > 1:1149173/1‑239 (MQ=255) ccGCACTGCTCGGCGGTTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCTTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGtt < 1:1224472/239‑1 (MQ=255) cTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCATCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGa > 1:649913/1‑239 (MQ=255) cTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGa > 1:744894/1‑239 (MQ=255) cTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGa > 1:1324231/1‑239 (MQ=255) cTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGGGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGa > 1:823120/1‑239 (MQ=255) ggtttAACCAAGACCGGCCGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCTTTGACGCCTATAAAA‑GCGTGC‑AATTCCCGCACCCGACCCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑CCACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATg < 2:1251762/235‑1 (MQ=255) gTTAACGGAGAACGGACGTGGCGCGGTGACCGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTGGACGCCTATCAAA‑GCGTGA‑ATTTACCGCAACCGACCCTCGGCGTGCGCACT‑ACCGCCTTGA‑TCG‑CCACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATgcg < 2:422272/238‑1 (MQ=255) gTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCCAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGGACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCCGTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCCGCTTTCCTCAACCGTGCCGTTTCGCTGGAAGATgcg > 2:167229/1‑238 (MQ=255) tAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGCCGCCTATCAAA‑GCGTTC‑AATTACCGCACCCGACCCCCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATgcgcgc < 1:209971/239‑1 (MQ=255) tAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCACCCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATgcgcgc < 1:623245/239‑1 (MQ=255) gtcagatggttataagaggcaggTGAACGTCCTTTCGTCCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑CCGTGC‑AATCACCGCACCCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑ACCGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATgcgcgc < 2:435495/217‑1 (MQ=255) cccGCGAACGGACGTAGGGGGGTGAACGGCATTTCGTTCTTTT‑GCCTGGCCGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTCCCGCAACCGACCCCCGGCGGGCGCACA‑AACGCCTTGA‑CGG‑CCGCGCCGTCCGTGATGAAAACCGCCGAAACCATGCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGGGa < 2:357567/238‑1 (MQ=255) acggagaACGGAGGTGGGGTGGTGAACGCGCTTGGGTATGTAT‑GCCTGGACTTCTATCAGA‑GCGTGA‑AATTGCCGCAGCCGAGCCGGGGCGGGCGCACT‑ACCGCCGTGC‑TCA‑ACACCCGGTTCAAGATGAAAACCGCCGAAACCAGTCGCTTCGGTACCGGTATACCGCAAATCTTTAACGATGAAGAGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGATGGAAGATGCGCGCGa < 2:1203478/236‑1 (MQ=255) aCCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTCCCGCAACCGACCCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑CCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGa < 1:100698/239‑1 (MQ=255) aaaCGGACGAAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTCCCTTT‑GCCTGGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTAtt < 1:423701/238‑1 (MQ=255) aCGGAGGTAGCGGGGTGAACGTGCTTTC‑TTCCTTTGGCCTTGCCGCCTACAAAA‑GC‑TGCAAATTCCCGCACCCGACCCTCGGCGGGCGCACA‑AACGCTTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAGCCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTAtt < 2:1261390/237‑1 (MQ=255) aCGGACGTAGCGCGGTGAACGTGTTTTCTTTCCTTT‑GCCTTGACCCCTATCAAG‑GCGTGC‑ATTTACCGCAACCGACCCTCGGCGTGCCCATT‑AACGCCTGGA‑TCG‑ACGCGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTAtt < 1:457649/237‑1 (MQ=255) gcGTGGCGGGGTGCAGTTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGCCGCCTACAAAG‑GCGTGC‑AATTACCGCACCCGACCCGCGGCGTGCGCACT‑ACCGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTa < 2:233768/237‑1 (MQ=255) acgtgcggcggtaactgtgtTTTGGTCCCTTT‑GCCTTGACGCCCACTAAA‑GGGTAA‑AATTACCGCACCCGACCCGCGGTGGGCCCCCT‑AACGCCTTGA‑ACG‑CCCCGCCTTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCCGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTa < 2:379301/222‑1 (MQ=255) aCGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAg > 1:465986/1‑239 (MQ=255) aCGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAg > 1:70585/1‑239 (MQ=255) aGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTCCCTTT‑GCCTTGGCGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTCCCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCTTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTggg < 1:1184934/239‑1 (MQ=255) gcgcGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTgg > 1:1070446/1‑237 (MQ=255) gTGAACGGGCTTCCGGTCCTTT‑CCCTTGGCTCCTATCAAA‑GCGGGA‑AATTACCGCAACCGAACCCGGGCGGGCGCATT‑ACGGCCTTGA‑TCG‑ACCCGCCGTTCCTGAGGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCtgtg < 2:158534/238‑1 (MQ=255) gAACGTGCTTTCGGTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGACACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTgg > 2:1241885/1‑239 (MQ=255) ttCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGCTGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTa > 2:1099174/1‑239 (MQ=255) ttCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCg > 1:435495/1‑215 (MQ=255) cGTTCCTGT‑GCCTTGACGCCT‑TCAAACGGGGGA‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGGGTGGGCACA‑AACGCCTTGA‑CCG‑CACCGCCGTCCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTAtt < 2:756511/239‑1 (MQ=255) tt‑GCCTTGTCCACTTACAAA‑GTGTGCAAATTGCCGCACCCGACCTTCGCCGGGCGCACT‑AAC‑TCTTTA‑GCGCACCCCCCTTCCCTATTGAAATCCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGc < 2:776034/239‑1 (MQ=255) tt‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCCCACT‑AGCGCCTGGC‑TCG‑CCACGCCGTTCCGGGTGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCa < 1:567361/239‑1 (MQ=255) tt‑GCCGTGACGCCTATCAAA‑CCGTGC‑AATTACCGCAACCGACCCCCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCa < 1:1059119/239‑1 (MQ=255) gt‑GCCTGGACGCATAACACA‑GCGGGA‑AAATCCCGCACCGGAACCCGCGCGCGCGCACA‑ACCGTCTTGA‑CCG‑ACACGCCGTTCCTGATAAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCa < 2:649913/238‑1 (MQ=255) aCGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTa > 1:1372716/1‑200 (MQ=255) ccTAGCAAA‑GCGGCC‑AATTCCCCCAACCGAACCGCGGCG‑GCCCAATGAACGCCTTGT‑CCA‑CCACGCCGTTCCTGAGGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGGGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGc < 2:1070446/239‑1 (MQ=255) tATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑CCACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCtt > 1:139762/1‑239 (MQ=255) tATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCtt > 1:733209/1‑239 (MQ=255) gCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCTTGCATGAc > 1:476044/1‑239 (MQ=255) tGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCTTGCCTGACATc > 2:1319357/1‑239 (MQ=255) tGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCTTGCATGACAt > 1:369971/1‑238 (MQ=255) tGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCCCTGGAAGAGGCGCGCGCCTATTCCGTCGTGGGCTGTGTGGAATTTTCTGTTTCCGGCAGAACCTCCGGccgtgatgacat > 2:875506/1‑227 (MQ=255) gC‑AATTACCGCAACCAACCCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCTTGCATGACATcg < 1:359801/239‑1 (MQ=255) c‑AATTACCGCACCCGACCCTCGGCGTGCGCCCT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATAAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCTTGCATGACATcg < 2:369971/238‑1 (MQ=255) c‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCTTGCATGACATcgc > 2:707851/1‑239 (MQ=255) aaaTTCCCGCACCCGACCCCCGGCGTGCGCCCA‑AACGCCTTGA‑CCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCTTGCATGACATcgc < 2:572557/238‑1 (MQ=255) aatcccccaacccGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑GCG‑ACACGCCGTTCCGGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCTTGCATGACATcgc < 2:1292573/227‑1 (MQ=255) aaTTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCTTGCATGACATcgc < 1:460580/238‑1 (MQ=255) acccGACCCGCGGCGTGCCCAC‑‑AACCCCTTTAGTCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCTTGCATGACATCGCGATGTTTAAt < 2:465636/237‑1 (MQ=255) aaCCGACCCTCGGCGTGCCCACA‑AGCGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCTTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTTGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCTTGCATGACATCGCGATGTTTAAt < 2:543794/239‑1 (MQ=255) aaCCGACCCACGGCGTGCGCACT‑AACGCTTTGT‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCTTGCATGACATCGCGATGTTTAAt < 1:487207/239‑1 (MQ=255) aCCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑ACCGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTAtt < 1:1027795/167‑1 (MQ=255) aCCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTAtt > 2:1027795/1‑167 (MQ=255) aCCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCTTGCATGACATCGCGATGTTTaa > 2:907208/1‑237 (MQ=255) aaCCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCTTGCATGACATCGCGATGTTTAATctgct > 1:263991/1‑239 (MQ=255) | TCATTAACCCAGGGCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTT‑GCCTTGACGCCTATCAAA‑GCGTGC‑AATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACT‑AACGCCTTGA‑TCG‑ACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCTTGCATGACATCGCGATGTTTAATCTGCT > NC_000913/4144840‑4145312 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |