New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3276528 = | 67 (0.880) | 3 (0.040) | 3/486 | NT | 3.5% | coding (1249/1572 nt) | garD | D‑galactarate dehydrogenase |
? | NC_000913 | 3277294 = | 101 (1.380) | coding (295/336 nt) | prlF | antitoxin of the SohA(PrlF)‑YhaV toxin‑antitoxin system |
GTAACGGAAGTGCGTGACGCGATCCATCTGCTGACACCACGCGCAGTGAACGAAGAGGTCGGCAAACGGCTGCTGGAGGAGATGGAGTGGTACGATAACTATCTCAATATGGGAAAAACCGACCGCAGCGCCAACCCTTCGCCGGGCAACAAGAAAGGCGGTCTGGCAAACGTGGTAGAGAAGGCACTCGGCTCCATTGCTAAATCGGGTAAAAGCGCAATTGTTGAAGTGCTGTCGCCCGGTCAACGCCCGACTAAACGCGGATTAATTTACGCCGCGACGCCAGCCAGCGATTTTGTCTGTGGCACGCAACAGGTGGCTTCGGGTATCACAGTGCAAGTGTTTACGACCGGTCGTGGTACGCCGTACGGCCTGATGGCGGTACCCGTCATTAAAATGGCAACCCGCACCGAGCTGGCGAACCGCTGGTTTGATTTAATGGATATTAATGCGGGCACCATCGCTACCGGCGAAGAAACTATTGAAGAGGTGGGCTGGAAGTTGTTCCACTTTATTCTCGACGTCGCCAGCGGGAAGAAGAAAACCTTCTCGGATCAATGGGG > NC_000913/3276243‑3276805 | gTAACGGAAGTGCGTGACGCGATCCATCTGCTGACACCACGCGCAGTGAACGAAGAGGTCGGCAAACGGCTGCTGGAGGAGATGGAGTGGTACGATAACTATCTCAATATGGGAAAAACCGACCGCAGCGCCAACCCTTCGCCGGGCAACAAGAAAGGCGGTCTGGCAAACGTGGTAGAGAAGGCACTCGGCTCCATTGCTAAATCGGGTAAAAGCGCAATTGTTGAAGTGCTGTCGCCCGGTCAACGCCCGACTAAACGCGGATTAATTTACGCCGCGACgccagcca > 2:700632/1‑289 (MQ=255) tAACGGAAGTGCGTGACGCGATCCATCTGCTGACACCACGCGCAGTGAACGAAGAGGTCGGCAAACGGCTGCTGGAGGAGATGGAGTGGTACGATAACTATCTCAATATGGGAAAAACCGACCGCAGCGCCAACCCTTCGCCGGGCAACAAGAAAGGCGGTCTGGCAAACGTGGTAGAGAAGGCACTCGGCTCCATTGCTAAATCGGGTAAAAGCGCAATTGTTGAAGTGCTGTCGCCCGGTCAACGCCCGACTAAACGCGGATTAATTTACGCCGCGACgccagcca < 1:82604/288‑1 (MQ=255) tAACGGAAGTGCGTGACGCGATCCATCTGCTGACACCACGCGCAGTGAACGAAGAGGTCGGCAAACGGCTGCTGGAGGAGATGGAGTGGTACGATAACTATCTCAATATGGGAAAAACCGACCGCAGCGCCAACCCTTCGCCGGGCAACAAGAAAGGCGGTCTGGCAAACGTGGTAGAGAAGGCACTCGGCTCCATTGCTAAATCGGGTAAAAGCGCAATTGTTGAAGTGCTGTCGCCCGGTCAACGCCCGACTAAACGCGGATTAATTTACGCCGCGACgccagcca > 1:526787/1‑288 (MQ=255) aCGGAAGTGCGTGACGCGATCCATCTGCTGACACCACGCGCAGTGAACGAAGAGGTCGGCAAACGGCTGCTGGAGGAGATGGAGTGGTACGATAACTATCTCAATATGGGAAAAACCGACCGCAGCGCCAACCCTTCGCCGGGCAACAAGAAAGGCGGTCTGGCAAACGTGGTAGAGAAGGCACTCGGCTCCATTGCTAAATCGGGTAAAAGCGCAATTGTTGAAGTGCTGTCGCCCGGTCAACGCCCGACTAAACGCGGATTAATTTACGCCGCGACGCCAGCCAGCg > 1:335439/1‑289 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |