New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2290110 | NA (NA) | 73 (1.450) | 41/280 | 0.2 | 96.1% | intergenic (‑31/+2) | insH1/yejO | IS5 transposase and trans‑activator/pseudogene, autotransporter outer membrane homology,putative transport, Not classified, putative ATP‑binding component of a transport system |
? | NC_000913 | = 3553105 | 3 (0.060) | coding (23/2706 nt) | malT | mal regulon transcriptional activator |
AAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289970‑2290110 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTTTTGCGCTTCGTAATTAATGGTTATAAGGTCGGCCAGAAACCTTTCTAATGCAAGCGATGACGTTTTTTTATGT < NC_000913/3553105‑3552967 AAGAAGTTCGCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 1:790654/143‑1 AAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTTACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 1:712165/143‑1 AAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATTAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 2:826648/143‑1 AAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTGGCACCATCCT > 1:127010/1‑143 AAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT > 1:656907/1‑143 AAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT > 2:717042/1‑143 AAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCCGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGAGCTTGTTGGCACCTTCCT > 1:436507/1‑143 agtaatTCTCTTGTGTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT < 1:14463/137‑1 AGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT < 2:591500/143‑1 GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 2:742363/143‑1 GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA > 2:659251/1‑143 GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA > 2:650079/1‑143 GAAAATCTCTTGTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 2:761301/143‑1 AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGACTTCACTTTCTGCGAAGGTAAGTTGATGACGCATGATGCCCCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAG < 1:625703/143‑1 AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAG < 2:796618/143‑1 AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAG > 2:640039/1‑143 AAAAGCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAG < 2:814865/143‑1 tcgTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTgtt < 2:733918/140‑4 tcgTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGA < 2:97173/140‑1 cCTTTTCTGGTTTGACTGCGCTTACTGCTTAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCCTATCATGGAGTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTgtt < 1:727940/142‑4 TCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGCCTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGACCCTTCCTTggcgaagt > 1:552007/1‑135 TCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTGATATCAGGGGCTTGTTCGCACCTTCCGTAGTTTgtt > 2:471565/1‑140 TCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTgtt < 1:731059/143‑4 TCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGCGACTTGTCCGCACCCTCCctcagttaaa > 1:702843/1‑133 TCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACGGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTgtt < 2:800100/143‑4 tgttcgTGGTCGGTCGGCGGTTAATGCATAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGTCTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGAC < 1:46084/137‑1 TTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTgttgt > 2:345776/1‑138 TTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGAATTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTgttgt > 2:438908/1‑138 TGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATC > 2:784095/1‑143 cgggTGACGGCGCTGCCTGACGAACGCACGGCCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGCACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATAGCAGGCACTTGTTCGCACCTTCCATAGTTTTGACGGAATCA < 1:498483/139‑1 tcggtCGGCGCTTACTGCTTAATTCAGTGTGTGCGAAGGTAATTTGATCACTAATGATGACCCCTGTTCTATGGCTCCAGATTACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAACCAGC < 1:769008/138‑1 TCTGGCGGCGCTCACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGC < 1:875625/143‑1 TCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGC < 2:552559/143‑1 CTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTgttgtgcggtaagt < 2:259493/143‑15 CTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGGAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTgttgtgcggtaagt < 2:571832/143‑15 TGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCAT < 2:520303/143‑1 CTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTT < 1:785184/143‑1 CTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCAC > 1:889109/1‑143 TTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGG < 2:615079/143‑1 ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAA > 1:688313/1‑143 CTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGCCTCATGATGAACCCTGCTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAA < 1:67894/143‑1 CGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAG < 2:19736/143‑1 GAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGCAAATGACGAca > 2:135878/1‑141 GAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACACTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACGTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAA > 1:487110/1‑143 GATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTaaat > 2:639255/1‑139 GATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTT < 2:383323/143‑1 gTGACTCATTATTCACTCTGTTCTGTGGCTCCAGACGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTTT < 1:619497/142‑1 TCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTGGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTTTTGCGC > 2:794673/1‑143 ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTTTTGCGCTT > 2:522906/1‑143 TGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTTTTGCGCTTC < 2:857448/143‑1 TGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTGACTGTGGAAAATGAGGAAATGTTATTTTTTTTGCGCGTCGTA > 2:254978/1‑143 gagCCCGGTTCTATGGCTCCAGAAGAAAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTGCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTTGTGCGCTTCGTAA < 2:235106/140‑1 CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAAGGACTTGTTAGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTTTTGAGCTTCGTAATTA > 2:267063/1‑143 GCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTTTTGCGCTTCGTAATTAATGGTTATAAGG < 2:889109/143‑1 TCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTTTTGCGCTTCGTAATTAATGGTTATAAGGTC > 2:427622/1‑143 AGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTGTTTTTGCGCTTCGTAATTAATGGTTATAAGGTCGGC < 1:612263/143‑1 GATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTTTTGCGCTTCGTAATTAATGGTTATAAGGTCGGCC > 2:475259/1‑143 ACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGACCTATTCTTTTTTTTGCGCTTCGTAATTAATGGTTATAAGGTCGGCCACAA > 2:389193/1‑143 ATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTTTTGCGCTTCGTAATTAATGGTTATAAGGTCGGCCAGAAACCTTT < 1:370726/143‑1 TGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTTTTGCGCTTCGTAATTAATGGTTATAAGGTCGGCCAGAAACCTTTC < 2:778148/143‑1 ATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTTTTGCGCTTCGTAATTAATGGTTATAAGGTCGGCCAGAAACCTTTCTA > 2:150292/1‑143 ATCTCAGATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTTTTGCGCTTCGTAATTAATGGTTATAAGGTCGGCCAGAAACCTTTCTA < 2:70501/143‑1 aTCATATCAGGCACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTAACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTTTTGCGCTTCGTAATTAATGGTTATAAGGTCGGCCAGAAACCTTTCTAAT < 1:784095/142‑1 ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTTTTGCGCTTCGTAATTAATGGTTATAAGGTCGGCCAGAAACCTTTCTAATGCAAG < 1:328176/143‑1 agcGACTTCGTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACTGAATCAGGATAGTTAATCCCTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTTTTGCGCTTCGTAATTAATGGTTATAAGGTCGGCCAGAAACCTTTCTAATGCAAGCGA < 2:861926/140‑1 AGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTTTTGCGCTTCGTAATTAATGGTTATAAGGTCGGCCAGAAACCTTTCTAATGCAAGCGA > 2:79429/1‑143 ggtACTTGTGCGAACGTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATGTTTTGGGCGCTTCGTAATTAATGGTTATAAGGTCGGCCAGAAACCTTTCTAATGCAAGCGAT < 1:468851/140‑1 GGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTCCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTTTTGCGCTTCGTAATTAATGGTTATAAGGTCGGCCAGAAACCTTTCTAATGCAAGCGATG > 2:716268/1‑143 gacttggtgtctCCTCCCTTAGTTTGGGCGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTTTTGCGCTTCGTAATTAATGGTTATAAGGTCGGCCAGAAACCTTTCTAATGCAAGCGATGA < 2:590829/131‑1 TTCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTTTTGCGCTTCGTAATTAATGGTTATAAGGTCGGCCAGAAACCTTTCTAATGCAAGCGATGAagcaac > 2:782326/1‑137 TCGCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTTTTGCGCTTCGTAATTAATGGTTATAAGGTCGGCCAGAAACCTTTCTAATGCAAGCGATGACGTTTTT < 1:443320/143‑1 GCACCTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTTTTGCGCTTCGTAATTAATGGTTATAAGGTCGGCCAGAAACCTTTCTAATGGACGAGATGACGTTTTTTT > 1:762354/1‑143 CTTCCTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTCACCCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTTTTGCGCTTCGTAATTAATGGTTATAAGGTCGGCCAGAAACCTTTCTAATGCAAGCGATGACGTTTTTTTATGT < 2:688313/143‑1 CTTCCTTAGTTCTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTTTTGCGCTTCGTAATTAATGGTTATAAGGTCGGCCAGAAACCTTTCTAATGCAAGCGATGACGTTTTTTTATGT < 2:39619/143‑1 AAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289970‑2290110 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTAGTTTTGACGGAATCAGCATAGTTAATCACTTCACTGTGGAAAATGAGGAAATATTATTTTTTTTGCGCTTCGTAATTAATGGTTATAAGGTCGGCCAGAAACCTTTCTAATGCAAGCGATGACGTTTTTTTATGT < NC_000913/3553105‑3552967 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |