| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3083829 = | 60 (1.180) | 6 (0.130) | 4/264 | 6.8 | 9.4% | intergenic (‑34/+104) | speB/speA | agmatinase/biosynthetic arginine decarboxylase, PLP‑binding |
| ? | NC_000913 | 3083866 = | 59 (1.240) | intergenic (‑71/+67) | speB/speA | agmatinase/biosynthetic arginine decarboxylase, PLP‑binding | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CACCCAGTCTGCATCGCTGTCATACGGCTGGAAGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGC > NC_000913/3083688‑3083971 | cACCCAGTCTGCATCGCTGTCATACGGCTGGAAGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATaaaaaaa < 2:286445/143‑1 (MQ=255) aGTCTGCATCGCTGTCATACGGCTGGAAGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGCAGGAATAAAGAAACCCtt > 1:701191/1‑143 (MQ=255) gTCCGCATCGCTGTCATACGGCTGGAAGCTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTc < 2:175177/143‑1 (MQ=255) gCATCGCTGTCATACGGCTGGAAGTTCATCGGCAGGCGTACAAAACCACAGGCATTGGACACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGCTGGACTCCTATTACCCAGTGGATCTAAAAACACCCTTCcgcg > 1:38456/1‑143 (MQ=255) aCGGCTGGAAGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCcga < 2:512084/143‑1 (MQ=255) tGGAAGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTACGCCCGACGAgg > 1:462477/1‑143 (MQ=255) gAAGTTCTTGGGCAGGCGTAGAAAACCAAAGGCACTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTGATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGaa < 1:122102/143‑1 (MQ=255) gAAGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTGCTATTACAAAGTCGATATAAAACAACCCTTCCGCGTCGTTCGGCCCGACGCGGaa > 2:537863/1‑143 (MQ=255) aGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAgg > 1:264062/1‑143 (MQ=255) ttCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGt > 1:293596/1‑143 (MQ=255) tCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTCTTAAAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAgggat > 1:666896/1‑141 (MQ=255) tCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGtt < 2:869771/143‑1 (MQ=255) tCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGtt < 1:502332/143‑1 (MQ=255) tCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGa > 1:552318/1‑143 (MQ=255) cGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTTGGAGTAATCGAGCCCGACCGCGTCGTGCGCCCCGCCGAGGGAGGGTTGGAt > 2:198495/1‑143 (MQ=255) cGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAACAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGCCGGGTTGGAt > 1:469936/1‑143 (MQ=255) ggCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGGATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGACGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGCTTGGGtt > 1:252389/1‑143 (MQ=255) gggCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACAAGTGAGTTATCGTACTGATGCCATAAGGCGCAAATGGCTGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAATAAACCCTTCAGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGt < 1:357915/142‑1 (MQ=255) gccgaaaaaaaCCAAAGGCATTGGAAACCAGGGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTc < 2:398384/138‑1 (MQ=255) gagagaaaaaCAAGAGGCATTGGCAACCAGCGCGTTATCGTATTGACGACCTAAGGTGCCCATGGATGGCCTCCCATTACAAAGTCGATATAAAAAACCCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTca < 1:803995/138‑1 (MQ=255) gCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTca < 1:138861/143‑1 (MQ=255) gCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATAGAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTca > 2:503940/1‑143 (MQ=255) aaaaaCCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATa > 1:570982/1‑143 (MQ=255) aaaaCCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTAATGATGACCTAAGGGGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCGTCCGCGACGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGagtgtgcaccatcc > 1:49944/1‑130 (MQ=255) aaCCAGAGGCATTGGAAGCCAGTGAGTTATAAAATTAATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAAt < 1:388714/143‑1 (MQ=255) cAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTCAGGTGCTCATGGAAGGACTCCTATTACAAACTCGACATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGACGGGTTGGATTTGTCACGATAACTtgt > 1:774634/1‑143 (MQ=255) cAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATACATtgt > 1:843834/1‑143 (MQ=255) cAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCGAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAGGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATtgt > 2:544465/1‑143 (MQ=255) aaaGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATtgtg < 1:586416/143‑1 (MQ=255) aagtcacgggAATCCAGTGAGTTATCGCATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGAGGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTGAGGCTCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTgg < 2:875331/135‑1 (MQ=255) aGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTAGTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGc < 2:359492/143‑1 (MQ=255) aaCCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCAc > 2:653980/1‑143 (MQ=255) caaGTGAGTTATGGTATTGATGACCTAAGGGGCTCATGGCTGGACTCCTATTACCACGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCg < 1:357408/141‑1 (MQ=255) gTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTGGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTa > 2:452210/1‑143 (MQ=255) tCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGc > 1:786723/1‑143 (MQ=255) gTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGCGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCAAAGCAAAATAAAGCgg > 2:266669/1‑143 (MQ=255) tATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGACGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATGACCGCTAAATTAAGCCGa > 2:232318/1‑143 (MQ=255) tATTGATGACCTAAGGTGCTCAGGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGa < 1:805190/143‑1 (MQ=255) caTTTATCACCCAAGGTGCTCATGGATGCACTCCTATTCCAAAGTCGATATAAAAACACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGa < 2:339864/142‑1 (MQ=255) tgatgaCCTAAGGTGCTCATGGATGGTTCCCTATTACAAAGTCGATATAAAAACATCTTTTTTCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTc < 1:770190/143‑1 (MQ=255) gtgaCCTAAGGTGCTCAAGGATAGACTCCTATTACAAAGTCGAGATAAACAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCaa < 1:409830/142‑1 (MQ=255) atgaCCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCaa > 2:476165/1‑143 (MQ=255) tgtgcTAAGGGGCGCAGGGATGGACTCCTATTACAAAGGCGATAGAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGTCGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAg < 1:410205/139‑1 (MQ=255) ggTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAg > 2:97388/1‑143 (MQ=255) tCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTACCACAGGACtt > 1:638218/1‑143 (MQ=255) tCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACtt > 1:113978/1‑143 (MQ=255) atcggtggaCGCCTATTACAAAGTCGATATAATAATACGCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTAc < 1:577582/138‑1 (MQ=255) tggtCTCGTATTACAACGTCGATATACAGAAACCCTTCCGCGTCGTGAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAACTTAAGCGGATTCATGTAACACAGGACTTACTCATc < 1:596314/143‑1 (MQ=255) tCCTATTCCAAAGTCGATATAAAAAAACACTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCaa < 2:462477/143‑1 (MQ=255) tactACAAAGGCGATAGAAAAAAGCCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGAt < 1:50390/140‑1 (MQ=255) aTTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATa < 2:293596/143‑1 (MQ=255) ttACGAGGTCGGTATCTAAAAACCCTTCCTCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATaa < 1:97388/143‑1 (MQ=255) ttACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATaa > 2:807609/1‑143 (MQ=255) cAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATGCTGGCGGATCATCCCCGCTAAATTAAGCGGCATCAAGTAACACACTACTTACCCAACATCAAgcacagta > 1:603014/1‑136 (MQ=255) tCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATGAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAAca > 1:513754/1‑142 (MQ=255) tataAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATACATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCAACTTCAAGATAAGTATAACCGTAc > 2:489458/1‑143 (MQ=255) tataAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAATATCAATTTAAcagaac > 1:805/1‑138 (MQ=255) taAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACaa < 2:570982/143‑1 (MQ=255) aaaaaaaCCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTTAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACaaa > 2:449708/1‑143 (MQ=255) aaaaaaaCCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTGAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACaaa > 2:859758/1‑143 (MQ=255) aaCCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCGCCGCGAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAAGCGTACAAACCTGc > 1:326388/1‑143 (MQ=255) | CACCCAGTCTGCATCGCTGTCATACGGCTGGAAGTTCATCGGCAGGCGTAAAAAACCAAAGGCATTGGAAACCAGTGAGTTATCGTATTGATGACCTAAGGTGCTCATGGATGGACTCCTATTACAAAGTCGATATAAAAAAACCCTTCCGCGTCGTTAGGCCCGACGAGGAAGGGTTGGATTTGTCACAATAAATTGTGGCGGATTATCACCGCTAAATTAAGCGGATTCAAGTAACACAGGACTTACTCATCTTCAAGATAAGTATAACCGTACAAACCTGC > NC_000913/3083688‑3083971 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |