| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 1293032 = | 3 (0.050) | 65 (1.110) | 51/284 | 0.1 | 95.6% | intergenic (‑110/‑495) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | intergenic (‑55/‑483) | insA/uspC | IS1 repressor TnpA/universal stress protein | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
GATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCT > NC_000913/1292890‑1293173 | tagtttgttTACAGTTTTGTGTGCTTTGCTTATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTTTGCAATAGCTAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAttt < 1:294333/139‑1 (MQ=255) cgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagagacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaataagtaagttagcagcaccacctc < 1:792252‑M1/2‑2 (MQ=255) gctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagcagaacaggagggaaagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaactcagtaagttggcagcctcgcctca < 2:206703‑M1/3‑3 (MQ=255) ctgatgtcaggctgtgcttgtgccgttacgcaccaccacgtgagtagctgaacaggagcgacagctgttagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacacaaaatcagtaagttggcagcatcaccTtgt > 1:824117‑M1/140‑143 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |