New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2566837 = | 49 (0.840) | 4 (0.070) | 4/270 | 8.2 | 8.5% | coding (46/1404 nt) | eutA | reactivating factor for ethanolamine ammonia lyase |
? | NC_000913 | 2566935 = | 40 (0.720) | coding (1171/1227 nt) | eutH | ethanolamine transporter | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAGCATCATCGCCACGCCAATCGCCGTTACGCCGCCGATC > NC_000913/2566700‑2566972 | gCCCTGTTTATCGACAGCGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAGTTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGc < 1:425297/143‑1 (MQ=255) cccTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCCGCAAGTTTTTCGTTTAATGAATTAGTAGCTCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGcc < 2:961303/143‑1 (MQ=255) tttATCGACAGGTGTAAAGAACACCGGTCTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGatat < 1:562015/143‑1 (MQ=255) tttATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGatat < 2:927127/143‑1 (MQ=255) ttactgACAGGGGTCATGTACACTGGGCTTTGCCAGCTACTTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGTACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATc < 1:372430/138‑1 (MQ=255) aTCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGa > 2:71907/1‑143 (MQ=255) gACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATAc < 1:580694/143‑1 (MQ=255) tAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGCGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTc > 2:712835/1‑143 (MQ=255) gaggcgacCGGACGTGGCCAGGTAATTGCGCGGTTAAGGGTTTCGTAGGGCGGCGCCTGCGACGCCGCCGCACGGTTGACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCaa < 1:359252/137‑1 (MQ=255) aaCACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAg > 2:810172/1‑143 (MQ=255) accggcctcggacAGCTAATTGCGCGTTTAATGACTTCGGAGCGCGGCACCTGCGACGGCGCCGCACGGTTAATCGTCTCCAGCCTGGAGAAAGTCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTg < 1:667287/131‑1 (MQ=255) acCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTg > 2:377741/1‑143 (MQ=255) cGGACTTTGCCAGCTAATGTCGCGTTTAATGAAGTCGGAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCCGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGc < 2:926405/143‑1 (MQ=255) gccTTTGCCTGCTAATTTCGCGTTTAATGAATCCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGa < 1:843216/141‑1 (MQ=255) gCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGATGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGa < 1:778851/143‑1 (MQ=255) aTTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATtgt < 2:381846/143‑1 (MQ=255) aTTTCGCGTTTAAGGAATTCGTAGCGCGTCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATtgt < 1:317866/143‑1 (MQ=255) ttCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGACACTCACCTGGGTGGCGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGCGTTCACGATTTTGc > 2:418398/1‑143 (MQ=255) gTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGTTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTTGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCg > 2:515914/1‑143 (MQ=255) gTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGACTCCg > 2:779236/1‑143 (MQ=255) tAATGAAGTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCtt < 2:368786/143‑1 (MQ=255) tCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTa < 1:71907/143‑1 (MQ=255) cGTAGCGCGGCACCTGCGACGCCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAg < 2:59526/143‑1 (MQ=255) cgcgGAACCGGCGACACCGCCGCACGGTTCACCATCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTTGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCTGCTTCGGTTTTAgtcgcg < 2:652525/143‑1 (MQ=255) tgccctcgCGACACCTCCGCACGGTTAACCTGCCCCACCCGTGAGAAAATCACCTCGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCTACGCTCCATATCTTGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAgtcgcggtc < 1:579217/136‑1 (MQ=255) catcgtgcacCGCCGCACGGTTGACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGt < 1:868680/136‑1 (MQ=255) cTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGGTCACGATTGTGACTCCGCTTAGGTTTTAGTCGCGGTCGCGtc > 1:586572/1‑143 (MQ=255) acacCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGAGATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGCGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTCCCGTACTAgtcgcggtcgcctactact > 1:766714/1‑135 (MQ=255) cacCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGCTTTAGTCGCGGGCGCGTcttcttg > 2:55287/1‑142 (MQ=255) acCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTCGTGCCGCTATCCATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGAGTTCACGCTTGTGCCTCCGCCTCGGTCTTCGTCGCGGTCGCGTCTCCtttt > 1:200829/1‑143 (MQ=255) ccgccgCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGGCGCGCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTCCGGTTTTAGTCTCGGTCTCCGCCTCttttt > 2:244989/1‑142 (MQ=255) cgccgcACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTgg > 2:594117/1‑143 (MQ=255) gccgcACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTGCGGTTTTAgtggccgtcgccgcgtcctttagc > 1:759547/1‑130 (MQ=255) cgcACGGTTATGCAGCTCCTGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCAc < 1:437789/143‑1 (MQ=255) cgcACGGTTAACCAGCGCCAGCCGGGAGAACGTCACCGGGGTGGGGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCAc < 1:712835/143‑1 (MQ=255) taCGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCa < 1:165128/142‑1 (MQ=255) aCGGTTCACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGGGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAg < 1:692431/143‑1 (MQ=255) tAACCAGGTCCTGCGGGGAGAAAATCGCCTGGGTGGTGGTGGTGCAAATTTTTATTTCGGGGGTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAGcatca < 2:465419/143‑1 (MQ=255) cAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAGCATCATcgc > 2:347506/1‑143 (MQ=255) cAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTTAATAGCCGGCGCGTGTTCGCGCTTCTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCCGCCTCATcgccacgcc > 2:38778/1‑143 (MQ=255) cAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTCTTGGCACCAGCATCATcgccacgac > 2:420027/1‑141 (MQ=255) gCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAGCATCATCGCCACGCCaa > 1:60335/1‑143 (MQ=255) agaAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCAGCAGCATCATCGCCACGCCAATCGCCg > 2:1004900/1‑143 (MQ=255) gatgacagggggggTGGTGCAGCCAAAATCGACACCGACGCTCAATAACGGGCGAGTGTCCACGATTGCGCCGCCGCTTCGGTTTTAGTCGCTGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAGCATCATCGCCACGCCAATCGCCGTTAc < 2:267452/135‑1 (MQ=255) gttGGGTGGTGTTGGTGCCGTTATCGTTACCTACTCTCACTAGCTGCCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAGCATCATCGCCACGCCAATCGCCGTTAcgccgc < 1:389201/141‑1 (MQ=255) cTGGGTGGTGGTGGTGACGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGAGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAGCAACATCGCCACGCCCACACCCGTGACgcggcc > 1:374871/1‑143 (MQ=255) ggtggtggtggtGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAGCATCATCGCCACGCCAATCGCCGTTACGCCGCCGAt > 2:386079/1‑143 (MQ=255) gtggtggtggtgCCGATATCGATACCGCCGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAGCATCATCGCCACGCCAATCGCCGTTACGCCGCCGATc < 1:90163/143‑1 (MQ=255) gtggtggtggtgCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAGCATCATCACCACGCCACTCGCCGTTACGCCGCCGCTc > 2:62660/1‑143 (MQ=255) | GCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAGCATCATCGCCACGCCAATCGCCGTTACGCCGCCGATC > NC_000913/2566700‑2566972 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |