Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 2,906,012 | Δ1 bp | 3.1% | coding (304/873 nt) | ygcG → | TPM domain protein, putative phosphatase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,906,011 | 0 | G | . | 3.1% | 473.6 / 6.8 | 128 | coding (303/873 nt) | ygcG | TPM domain protein, putative phosphatase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (68/56); new base . (2/2); total (70/58) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.44e-01 |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
TCCCACAATTACAGCAACAAGTTACGGATCTTACGAGTAGCTTAAACTCACAAGAAAAGAAAGAACTGACGCACAAGTTAGAATCTATTTTCAATAATACCCAAGTGCAAATTGCCGTATTAATTGTTCCCACAACCAAAGACGAGACAATTGAACAATATGCTACAAGAGTTTTTGACAATTGGCGTTTAGGAGATGCCAAACGTAATGATGGGATACTGATCGTTGTTGCCTGGTCGGATCGCACTGTCCGCATCCAGGTAGGTTATGGGCTGGAAGAAAAGGTAACCGATGCTCTGGCTGGAGATATCATCCGTAGCAACATGATACCCGCATTTAAACAACAAAAATTAGCTAAGGGATTAGAGCTAGCTATAAACGCTTTGAATAACCAACTCACTTCACAACACCAATATCCGACTAATCCTTCAGAAAGTGAATCAGCGTCTTCCAGTGATCATTATTACTTT > NC_000913/2905773‑2906242 | tCCCACAATTACAGCAACAAGTTACGGATCTTACGAGTAGCTTAAACTCACAAGCAAAGAAAGAACTGACGCACAAGTTAGAATCTATTTTCAATAATACCCAAGTGCAAATTGCCGTATTAATTGTTCCCACAACCAAAGACGAGACAATTGAACAATATGCTACAAGAGTTTTTGACAATTGGCGTTTAGGAGATGCCAAACGTAATGATGGGATACTGATCGTTGTTGCCTGGTCg > 1:668752/1‑239 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |