| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2495446 | 179 (1.390) | 4 (0.030) | 4/422 | NT | 2.2% | intergenic (‑156/‑197) | yfdY/lpxP | DUF2545 family putative inner membrane protein/palmitoleoyl‑acyl carrier protein (ACP)‑dependent acyltransferase |
| ? | NC_000913 | = 2495447 | 178 (1.410) | intergenic (‑157/‑196) | yfdY/lpxP | DUF2545 family putative inner membrane protein/palmitoleoyl‑acyl carrier protein (ACP)‑dependent acyltransferase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
GCCGATACCACGTTCAGTACCTGACCGATGTAGCCGCTTACGCAGACAATACACAGGGCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAGCAGTCAGCGAGTGATAAAGTACAGATACCGCATTCATGCTCCTCGTGGTTATGTCCTGACTAGTCTTTACACTCTTTACAGGAACCATTGTCGTACATGATGGCCCAACCAATTGAGTGTACCGCTGTCGACATGGAATCTTCTGCGATACAACAATTCGTATCTACAGAAGGTAACTATGTTTCCACAATGCAAATTTTCCCGCGAGTTTCTACATCCT > NC_000913/2495208‑2495684 | gccgATACCACGTTCAGTACCTGACCGATGTAGCCGCTTACGCAGACAATACACAGGGCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTA < 1:1154541‑M1/239‑1 (MQ=255) aGTACCTGACCGATGTAGCCGCTTACGCAGACAATACACAGGGCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGa > 1:982092/1‑239 (MQ=255) gACCGATGTAGCCGCTTACGCAGACAATACACAGGGCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCACGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTACACGATTAATAATCAGTAGCTGAaagaag > 2:73187/1‑238 (MQ=255) gACCGATGTAGCCGCTTACGCAGACAATACACAGGGCGAGAAACATCCATAAATTAATCATAGCTCAACCTCCTGCCGCGCTAAAAAACCTGTAACTTCAGTCACTTTAATAGTAAGACAATCCTTAACCTCTGGCAATTTTTGCTAAGCATCAATGAAAACAGCATGTTAAATGCAAGACTGTTGTGTACGGAAAAATATTTACTTTGCACGATTAATAATCAGTAGCTGAAAg > 1:1329305/1‑235 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |