Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,571,181 | 0 | A | C | 18.4% | 171.5 / 6.1 | 90 | V132G (GTG→GGG) | yjiR | putative DNA‑binding transcriptional regulator/putative aminotransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/32); new base C (4/16); total (42/48) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.04e-02 | |||||||||||
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GCAGCATCTGCATCGAACCGTAATAACAGGGGGATTCGACCGCGACAATATCGCCC‑GGTTTACACACTGCCATTAACGCCAGCGACATCGAGTTATGGCAGCCGCTGGTGAT‑GATGATGTCA‑TCGGCGGTGACCACCGAGCCGCTGTCGAGCATCAGGCGGGCAATCTGCTCTCGCAATACTCGCTGA‑CCGGCTAAC‑AAGTCATAACCGAG‑AACGGTTTGCAGATTATGCTGCACCACCCGGCTTAGCTCCCGCCACAGCGG‑TTTCAGGCTGGGCGCTTCG‑ACAT‑CCGGTGT‑GCTTTTGCTTAACGGAACAATGGAACTGTCGCTATGCGCCTCCAGCATATCCAGCACCTGATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGC‑GGCTGGGCTTTACGTTGTGCGACAAAATAACCCGAACGCGGCTGCGGAGTGATGAGCT > NC_000913/4570948‑4571415 | gcagcaTCTGCATCGAACCGTAATAACAGGGGGATTCGACCGCGACAATATCGCCC‑GGTTTACACACTGCCATTAACGCCAGCGACATCGAGTTATGGCAGCCGCTGGTGAT‑GATGATGTCA‑TCGGCGGTGACCACCGAGCCGCTGTCGAGCATCAGGCGGGCAATCTGCTCTCGCAATACTCGCTGA‑CCGGCTAAC‑AAGTCATAACCGAG‑AACGGTTTGCAGATTATGCTGCaccacc < 1:714881/239‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |