Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,206,454 | A→G | 12.3% | intergenic (‑200/‑7) | ttdR ← / → ttdA | transcriptional activator of ttdABT/L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,206,454 | 0 | A | G | 12.3% | 305.7 / 13.1 | 140 | intergenic (‑200/‑7) | ttdR/ttdA | transcriptional activator of ttdABT/L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/86); new base G (11/7); total (45/95) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.05e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
TACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTTGAC‑AGAGATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATT > NC_000913/3206216‑3206691 | tACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCTAACAAACAACAAAACT‑AGa > 2:295705/1‑239 (MQ=255) aCCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAg < 2:1369602/239‑1 (MQ=255) tGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAAATTTTTTAAACAAAAAACAAAAAA‑GGAGttt > 2:484347/1‑238 (MQ=255) aaGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTACGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTACGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGcc < 2:222988/238‑1 (MQ=255) aGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑TTATTTTTTCATACAAAAAAAAAAACA‑TGAGTTggcca > 2:1174881/1‑235 (MQ=255) cTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCatg < 1:529821/237‑1 (MQ=255) tAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGa < 2:402569/238‑1 (MQ=255) tAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGa < 2:1224327/238‑1 (MQ=255) tAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGa < 1:1133157/238‑1 (MQ=255) tAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGa < 1:303635/238‑1 (MQ=255) cAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGt‑aat < 1:1058654/238‑1 (MQ=255) ttCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCatga < 1:173132/218‑1 (MQ=255) ttCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAc < 1:264100/239‑1 (MQ=255) tCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAC‑a < 1:1060572/239‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑gg < 1:351998/236‑1 (MQ=255) cGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGGT‑GAATTTTT‑CAGACCAAAACCAAAACT‑AGCGTTGCTCTGATGAGCGGCAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GACACTg > 2:554090/1‑239 (MQ=255) aTTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTG‑AATaa < 2:1345318/239‑1 (MQ=255) tCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTTg < 2:356486/239‑1 (MQ=255) gCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GGATTTTTTCACACAAAAAAAAAAAAT‑GGAGTTGTCATGATGTGGGAAAGT‑AAAAAACAAC‑A‑GGAAGTG‑AATAAGTTGAC‑a > 2:1314934/1‑239 (MQ=255) gCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTTGAC‑a < 1:230324/239‑1 (MQ=255) tgtgATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTTGAC‑Agaga < 1:319244/238‑1 (MQ=255) tgtgATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGGTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTTGAC‑AGAGAt < 1:554090/239‑1 (MQ=255) tAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTTGAC‑AGAGATTGTCg < 2:443225/239‑1 (MQ=255) cgcAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTTAGACAAATACAAAAAAT‑GGAGTTGTCCTTGTGAGCGGAAGT‑AAAAAAAAAA‑A‑AGCAACG‑AAAAAGATTAA‑AGAGATTGTGGcgca > 2:76146/1‑236 (MQ=255) cgcAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAACT‑GGAGTTGTCAAGGAGAGGGGAAGT‑AATAAACAAA‑A‑AGCAAGG‑AATAAATTTGC‑AGAGAATGtgtctca > 1:764714/1‑233 (MQ=255) cgcAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAAATTTTTCAAACAAAAAAAAAAAAT‑TGAGTTTTCCTGGTGTGTGGAAGT‑AAAAAACAAC‑ACGGCA‑TG‑GATAAAGTGAC‑AGAGAATGTCGC‑Taa > 1:716197/1‑239 (MQ=255) tgtATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTTAAACAAAAAAAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAAAAAA‑A‑GGCAGAG‑AATAAAATGAC‑AGAGATTGTCGC‑TAACttt > 2:977525/1‑238 (MQ=255) tATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCa < 1:381189/203‑1 (MQ=255) ttCGCAAAACATTGCAATTCCCTGCTCTGGCGAAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACAAACTGTTAATTACATATTCCGGGGGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑AAATTTTTCCAGAAAAATACAAAACCG‑GGAGTTGCCATGATGAGCAAAAGA‑AATAAGCAAC‑G‑GGAAGTG‑AATAAGTGGAC‑AGAGATTGTCGC‑TAATTTTACCGcc < 1:1034508/239‑1 (MQ=255) tCGAAAAACATTGCCTTTCCCTGCTCTGGCCCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTAATTCACAAACTGTTAATTACATATTCACGGTGAAAAAAAATAAAAAACCAAATTTTTGGTGGTAGTTTGGGGC‑GGT‑GAATTTTTCAAGAAAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGAAAC‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTTGAA‑AGAGATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCa < 2:159431/239‑1 (MQ=255) aaaaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCAGACAAATAAAAAAAAT‑GGAGTTGCCATGATTAGCGGAAGT‑AAAAAAAAAC‑A‑AGAAGAG‑AATAATCTGAC‑AGAGGATGTCGC‑GACAATTACCGCCATTAt > 1:673571/1‑239 (MQ=255) aaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCAGGAAAATATAAAAAAA‑GGAGGTGCCCTGTTGTGGGGAAGG‑AATAAACAAA‑A‑GGAAAAG‑GAAAAAGTGAC‑AGGGATTGTCGC‑TAAATTTACCCCCCTAAttt > 1:113305/1‑239 (MQ=255) tGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGGAATTTTTCCA‑ACACAAACAAAAACT‑GGAGTTTGCATGGTGGGGGGAAGG‑AATAAGTAAC‑A‑AGCAGAG‑AAAAAGTTGTA‑AGAGGTTGTCGC‑Taaactctacgcaccaattttcta > 2:68787/1‑217 (MQ=255) cATTCCCTGCTCTGGCGAAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTGGTGGC‑GGT‑AAATTTTTCCAGAAAAATAAAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTTGAC‑AGAGATTGTCGT‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGa < 1:817567/239‑1 (MQ=255) cccTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑gg < 1:129546/179‑1 (MQ=255) ctctGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCAGACAAAAACAAAAACA‑GGAGTTGTCACGGTGGGCGAAAGT‑AAAAAGCAAC‑A‑CGCAGGG‑AAAAAATTGTC‑AGAAAATGTCGC‑TAACTTTACCACCCCGATTTCT‑ACCCGACAGCCtgat > 2:487715/1‑239 (MQ=255) gcgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCTAACAAAAAAAAAAAAT‑GGGGTTGGCATGATGAGGGGAAAT‑AAAAAAAAACAA‑GACAG‑G‑AATAAGTTGACAAGAGATTGTGGT‑GAACTTTCCGCCCAGAATTTTT‑ACCGCAATGCGTG‑TGACgg > 2:638215/1‑238 (MQ=255) gcAATATTAATTCTTATTTTCATGTGGATTCACGCACTGTTATTTACATACTCCCGGTGTAAAAAAATAAAAAACCACTTTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTCCCAGGATGAGGGAAAGT‑AATAAGCAAC‑T‑GGCAGTG‑AAAAGGTTGGC‑AGCGATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACgtg < 1:874948/238‑1 (MQ=255) gaaaTATTATTTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGAAAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTTGAC‑AGAGATTGTCGC‑TAATTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACgtg < 2:261785/236‑1 (MQ=255) atatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGa < 1:851443/147‑1 (MQ=255) tatTCATTCTTTTTTTCGCGTTGATTCACTAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAACCCACATTTTTAGTGTTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACG‑GGAGTTGCAATGATGAGGAAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTA‑AATAAGTTGAC‑AGAGATTGTCGC‑TAACTTTCCCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 1:28355/239‑1 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTTGAC‑AGAGATTGTCGC‑TACCTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACgtg < 1:1346673/234‑1 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGA‑GAAATTTTTCACAAAAATAAAAAAAAT‑GGGGTTGTCATAGTGGGCGTGAGT‑AAAAAGAAAA‑A‑AGAAAAG‑AATAAAATTTC‑AGAGATATTTGC‑TAAAATTATCCCCCTGCATTTT‑ACCCCAATGTCtgatgagaggtggga > 1:739830/1‑230 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGAGGAGCGAAAGT‑AAAAAGCAAC‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTTGAC‑AGAGATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 1:977525/239‑1 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTACGCGTTGATTCACGACCTGTTAATTACATAGTCACGGTGGAAAAAAATATAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAACACAAAAATT‑GGAGTTGCCATGAGGAGCGAAAGT‑AATAACCAAC‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTTGAA‑AGAGATTGTCCA‑TAATTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 1:777044/239‑1 (MQ=255) ttcattcTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTTCGACAAAAACAAAAACA‑AGAGTTGCCATGATGAGGGGAAGA‑AAAAAACAAA‑A‑GGAAGAG‑AAAAAGATGAA‑AGAGAATGTCGC‑TAACATTTCCGCCATAATTTTT‑ACACGCATGTCGCATGAGGTGGTGGGTa > 2:28355/1‑239 (MQ=255) tATTTTCGGTTTGTTTCACGAAAGGTAAATTACATATTCAGGGTGTAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGGAGTTTGTGGG‑GGT‑AAATTTTCCCAGACAAATAAAAAAACG‑GGAGTTGCCAAGATGAGC‑AAAGTAAAAAAGCAAA‑A‑GGCGGTA‑AATAAGTTGAC‑AGAGATTGTCGT‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 2:303189/239‑1 (MQ=255) tATTTTCGCTTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGACAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAAACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTTGAC‑AGAGATTGTCGT‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 1:1211880/239‑1 (MQ=255) ttttCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCAGACAAAAACAAAAAAT‑GGAGGTGTCATGATGAGCGGAAGA‑AATAAACAAC‑A‑AACAGAG‑AATAAATTGAC‑AGAGATTGTCGCGTAAATTT‑CCCCCCTGATTTTT‑ACCCCAAAAGCTGATGACGTTGTGGGGAAAATAAAACa > 2:731558/1‑239 (MQ=255) ttttCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAAATTTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAT‑AGAGTTTGCATTATGAGGGAAAGG‑AAAAAAAAAA‑A‑GGGAGAG‑GAAAAATTGAA‑AAAAAGTGTTAG‑TAACATTACCGCCCATATTTTT‑ACCCGGAAGGCTGATGTGGGGGGGGGTGAAATAAAACa > 2:975011/1‑239 (MQ=255) ttttCGCGTTGATTCACGAAATGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGA‑GGT‑GAAATTTTTCATACAAATAAAAAAAAT‑CAAGGTGTCATGATAAGAGGAAAA‑AATAAGCAAA‑A‑GGAAGGG‑AAAAAGATGAC‑CGAGATTGTCGC‑TAACTTCAACGGCATGATTTCT‑ACCCCAAAGACTGAAGACGCGGGGGGTAAAcacaaaaa > 1:114003/1‑232 (MQ=255) tttCGCATGAATTAACGAATTTTAAATTAATTATAAAAGTTGGAAAAAAATAGAAAACCAAATTTTTAGTGGTATTTTGTGGA‑GGT‑AAATTTTTCCAGAAAAATACAAAAACT‑GGAGTCGCAATGATGAGTGAATGT‑AATAAGCACC‑G‑GGAAGTG‑ATTAATTTGAC‑AGAGTTTGGCCT‑TAACTTTCCCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAg < 1:551818/239‑1 (MQ=255) gaatccgcGAATTTTTAATTAGATAGTGCCGGTGAAAAAAAATAAAAAACCACTGTTGTAGTGGTGGTTTGGGGC‑GGG‑GAATTTTGCCAAACAAATAAAAAAACG‑GGTGTTGCTATGACGAGCAAAATT‑AAAAAAAAAC‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTAGAC‑AAAGATTGTCGT‑TAACTTTCCCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTAGATAAACTAAAACAGCTAAAgg < 2:1112907/231‑1 (MQ=255) tGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGG‑GAAATTTTTCAGACAAATAAAAAAAAT‑GGAGTTGGCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAACAAC‑A‑AGCAGGG‑AATAAATTGAC‑AGAAATTTTCGC‑TAACTTTAACGCCCTGATTTCT‑ACCCCAATGCCTGGTGACGTGGGGGGTAAACTAAAACAACTAAAGGGTG‑C‑CGAAAcgtc > 1:812328/1‑239 (MQ=255) ttAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCAGACAAATACAAAAAAT‑GGAGTTTTCATGATGAGCGAAAGA‑AATAAGCAAC‑A‑CGCAGGG‑AATAAATTGAC‑ACAGATTGTCGC‑CAACTTTACCGCCCTGATTTCT‑ACCCCCATGCCCGATGACGTGGTGGGGAAAACACAAAAGCTAAAGGGTA‑C‑CGgaaagcgg > 2:599508/1‑233 (MQ=255) ttAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGC‑CAATTTTTTTAGAAAAAAGCAAAAAATCTGGTTTGGCAAG‑TGGATGTAAGG‑GAAAAACAAG‑A‑GGCCGTG‑TATAAGTTATA‑AGTAATTGTCGG‑AAAGTTTTACACCATGATTTCT‑CCGCCCAAGCCTCATGACGTGGTGGTTAAACTAAAAAAACCAAACGATgggcaaacgccg > 2:1244826/1‑227 (MQ=255) aaTTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GGATTTTTTCTAACAAATACAAAAAAT‑TGAGTTGCCATGATGAGGGAAAGA‑AATAAGAAAA‑A‑AGGAATG‑AATAAAATTAA‑AGAGATTGGCGC‑CAACCTTACAGCCATGATTTTT‑ACCCGAATGCCTGATTACGGGGTGGGAAAACTAAAAAAACTAAAGGATG‑C‑CGaaaaactgtcg > 1:904245/1‑231 (MQ=255) aaTTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCAGACAAATACAAAAACT‑GGGGGTTCCCTGATGAGAGAAAAG‑AATAAACAAC‑A‑AGCAGTG‑AATAAATTGAC‑AGAGATTTTCGC‑TTACTTTACCCCCCTGATTTTT‑TCCCCCATGCCCGATGACGTGGGGGGTAAACTCAAAAAGCTAAAAGATT‑C‑CGAAACctcgtc > 1:398705/1‑238 (MQ=255) aaTTAAATATACACGGTGGCAAAAAAAATAAACCCACATTTTTAGTGGTATTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTTGAC‑AGAGATTGTCGC‑TAATTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGtcgtcg < 1:484347/239‑1 (MQ=255) atatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCATACAAAAACAAAAAAA‑TGAGTTGCCATGGTGAGCGAAAAG‑AATAAACAAC‑A‑AGAAGTG‑AAAAAATTGAA‑AGAGATTGTTGC‑TAAATTTACCGCCCTGATTTCT‑ACCCGAAATCCTGATGAAGTGGGGGATCAAAATAAACAGCTAAAGGAGT‑C‑CCAAAAATTGTCGGTgggg > 1:1352722/1‑239 (MQ=255) atatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCAGACAAATACAAAAACT‑TGAGGTGGCCTTATGGGCGGAAGA‑AATAAACAAA‑A‑AGCAGTG‑AATAAGTTGAC‑AGAGATTGTCGC‑TTACTTTACCGCCCTGATTTTT‑TCCCCGATGCCTTATGACGTGGGGGGTAAAATAAAACAACTAAAGGAAGCC‑CGAAAC‑TCGTTGGTgggg > 1:358918/1‑239 (MQ=255) atatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTG‑AATaa < 1:1278150/130‑1 (MQ=255) tatTCACGGTGGAAAAAAATAAAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGG‑GGT‑AAATTTTTCCAGAAAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGAAGTG‑AATAAGTGGAC‑AGAGATTGTCGC‑TATCTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGa < 2:1241603/239‑1 (MQ=255) tatTCACCGTGGAAAAAAATAGAAAACCAAATTTTAAGGGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAAAAAAATACAAAAACT‑GGAGGTGCCATAAGGGGCAAAATT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTGGAC‑AGAGATTGTCGC‑AAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:1084316/239‑1 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAAATTTTTTATAAAAAAACACAAAAT‑GGAGTTTTCATGAGGAGGGAAAAT‑AATAAACAAA‑C‑AGCAGAG‑AATAAGTTGAA‑CGAGATTGTCGC‑TAAATTTAACCCCATGATTTTT‑ATCCGAATGCCTCGTTAAGTGGGGGGTAAACTAAAACAGCTAAACGAAG‑C‑CCAAAccaagtacattgggga > 2:1128489/1‑224 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAAATTTTTCCGACAAAAACAAAAACA‑GGGGTTTCCATTGTGAGGGGAAGT‑AATAAACAAC‑A‑GGCAGTG‑AAAAAATTGAC‑AAAGAATGTCGC‑TAACTTTACCCCCCTGATTTTT‑ACCCCAATTCCTGATTGAGGGGTGGGTAAACTAAAAAAACTCAAAGATT‑G‑CGAAACGTCCGCGATggggga > 1:1241603/1‑237 (MQ=255) agggtgaaaaaaaaTAAAAAACCACATTTTTGGTGGGAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTACAGACAAATACAAAAACG‑GGGGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTTGAC‑AGAGTTTGTCGC‑TAATTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAAtt < 2:1341638/231‑1 (MQ=255) aCGGTGGAAAAAAATATAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGG‑GGT‑GAATTTTTCAAGAAAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTTGAC‑AGAGATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAAtt < 2:812328/239‑1 (MQ=255) ggTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGC‑GAATTTTTCCAAAAAAAAAAAAAAAAA‑TGGGGTGTCATTATGAGCGGAAAG‑AAAAAAAAAA‑A‑AACAATG‑AAAAAATTGAC‑AGAGAATGTCGC‑TCACATTTTCACCCTAATTTCT‑ACCCCAAAGCCCGATGAGCGGGGGGTTAAAATCAAAAAAATAAACGATG‑C‑CGAAACGTCGCCGATGGGGAAAAatat > 2:1182401/1‑239 (MQ=255) ttGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTAAGTGGTATTTTTGGGC‑GGT‑GAATTTTACCAGACAAAAACAAAAACT‑GGGGTTTCGTTGAGGAGCAAAAGT‑AATAACCAAC‑A‑GGCAGTA‑AATAAGTTGAC‑AGAGTTGGTGGC‑TAACTTTGCCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 1:1128489/237‑1 (MQ=255) gTGGAAAAAAATATAAAACCACATGTTTAGTGGTAGTTTGTGGG‑GTT‑AAATTTTTCCAAAAAAATACAAAAACT‑GGAGTGGCAATGAGGAGTGAAATT‑AAAAAGCACC‑A‑GGAAGAA‑AATAATTTGAC‑AGGAATTGTCGC‑TAATTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 1:709548/238‑1 (MQ=255) gTGGAAAAAAATAAAAACCCAAATTTTAAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGAAAAAAACAAAAACG‑GGAGTGGCCATGATGAGCAAAAGA‑AATAAGCAAC‑A‑GGAATTA‑AATAAGTAGAC‑AGAGTTTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 1:638215/238‑1 (MQ=255) aaaaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAAAAAAATACAAAAACT‑GGATTGGCCATTATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTTGAC‑AGAGATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATa < 1:372883/239‑1 (MQ=255) aaaaTAAAAACCCACATTTTTAGGGGTATTTTGTGGC‑GGT‑AAATTTTTCCAGAAAAATAAAAAAACG‑GGGATGTCAATGAGGAGCAAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTTGAC‑AGAGTATGTCGC‑TAATTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATa < 2:576389/239‑1 (MQ=255) aaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGAAAC‑A‑GGAAGTA‑AATAAGTTGAC‑AGAGTTTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 1:731558/239‑1 (MQ=255) aaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTCCCAAACAAATAAAAAAACT‑GGAGTTGCAATGATGAGCGAAAGA‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTA‑AATAAGTTGAC‑AGAGATTGTCGC‑TAATTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 1:36974/239‑1 (MQ=255) aaTAAAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GATTTTTCCCAGACAAAAAAAAAAACG‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGAAAC‑A‑GGCGGTA‑AATAAGTTGAC‑AGAGTTTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 2:1352722/239‑1 (MQ=255) aaTAAAAACCCAAATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGG‑GGT‑AAATTTTCCCAGACAAATAAAAAAACG‑GGAGTGGCAATGATGAGAGAAATT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTA‑AATAAGTTGAA‑AGAGATTGTCGT‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 2:1291049/239‑1 (MQ=255) tataAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTTGAC‑Agaga < 1:1393126/121‑1 (MQ=255) aaaTTTTGAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑AAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAATA‑AAAAAGCAAC‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTTGAC‑AGAGATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGacaa < 1:487715/237‑1 (MQ=255) caTTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCTAACAAAAAAAAAAAAT‑GGAGTTGTCATGCTGAGGGAAAAT‑AAAAAGAAAA‑A‑AGCAGGGAAAAAAGTTG‑C‑AGAGGTTTTAGC‑TAACATTCCCGCCACAACTTCTAACCCCAAT‑CCCGATTACGCGGGGGACAAAATAAAAAAACTAACAGATG‑CACAAAACG‑CGTTGCGGGGGGAAATTAATTACCATACCATTTTTGacaaa > 2:685745/1‑238 (MQ=255) caTTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTTCAGAAAAAAACAAAAAAA‑GGAGGTGCCATGATGGGCGAAAGT‑AATAAACAAC‑A‑GGCAGAG‑AAAAAGTTGAC‑AGAGATTGTGGC‑Taa > 2:1393126/1‑121 (MQ=255) aattggtgGC‑GGT‑AAATTTTTCAGGCAAAACAAAAAAACT‑GGATTTCCCATGATGAGCCAAAGT‑AATAAGCACC‑A‑GGCGGTG‑AATAAGTGGAC‑AGTGTTGCTCGC‑TATCTTTGCCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGTCGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 1:758974/234‑1 (MQ=255) aGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACG‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTTGAC‑AGAGATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 1:148146/239‑1 (MQ=255) gTTTGTGGG‑GGG‑AAATTTTTCCAGAAAAATACAAAACCT‑GAAGTTGCCAGAATGGGCGAAAAT‑AATAAGCAAC‑A‑GGAAGTG‑AATAAGTGGAC‑AGGGATTGTCGC‑TAATTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 1:1182401/238‑1 (MQ=255) gTTGGTGGC‑GGT‑AAATTTTTCAAGAAAAATAAAAAAACT‑GGAGTGGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAATCAAC‑A‑GGCGGTA‑AATAAGTTGAA‑AGAGTTTGTCGT‑TACCTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 2:821929/238‑1 (MQ=255) gtgtgggtagtt‑GAATTTTGACAGAAAAATAAAAACACT‑GGATTTGCGAAGAGGAGCAAAAAT‑GATAAGCAAC‑A‑TGCGGTG‑AAAAATTTAAC‑AGTAGTTGTCCA‑TAATTTTACCACCATGATTTCT‑ACCCGCATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 1:1176372/227‑1 (MQ=255) tgtgGG‑GGT‑AAATTTTCCAAAAAAAATAAAAAAATG‑GGAGTTGCCATGAAGAGCGAAATA‑AATAAGCAAC‑A‑GGCGGTA‑AATAAGTTGAA‑AGAGATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGa < 2:1067518/239‑1 (MQ=255) ggggC‑GGT‑GAATTTTTCCAAAAAAATAAAAAAACG‑GGAGTTGCCATGATGAGCAAAAGA‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTA‑AATAAGTGGAC‑AGAGATTTTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGAc < 2:764714/237‑1 (MQ=255) ggT‑AAATTTTACAAGAAAAATACAAAAACG‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTA‑AATAAGTTGAC‑AGAGATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGa < 2:398705/238‑1 (MQ=255) aTTTTCCCAGACAAAGCCAAAAATT‑GGAGTTCCACTGTTGAGCGAAAGA‑AACAAGCAAC‑A‑GGCACTT‑AATAGGTGGAC‑AGAGATTTCCGC‑TAACTGTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGACG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTc < 2:1148441/239‑1 (MQ=255) tttCCAAACAAATAAAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGAGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGAAGTG‑AATAAGTTGAC‑AGAGATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctg < 1:1379660/239‑1 (MQ=255) ttacaaGAAAAAGACAAAATCG‑GGAGTTGCCAGGATGAACGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTG‑AAAAAGTTGAC‑GGAGATTGTGGT‑TATCTTAACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctg < 1:297075/234‑1 (MQ=255) taaaaaaaaaaaaaaaaaTG‑GGGGTTGCAATGAGGAGCAAAAGT‑AAAAAGCAAA‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTTGAC‑AGATTTGGTCGT‑TATCTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctgcc < 2:113305/226‑1 (MQ=255) aaaaaaacaaaaacT‑GGATTTGCCATAATGAGAAAAATA‑AAAAAGCAAC‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTTGAC‑AGAGTTTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCa < 1:1314934/237‑1 (MQ=255) aaaaaaacaaaaacT‑GGAGTTGCCATGATGGGCGAAAGA‑AAAAAGCAAC‑G‑GGCAGTG‑AATAAGTTGAC‑AGAGATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCa < 1:38975/237‑1 (MQ=255) aaTAAAAAAAGT‑AGATTTGACATGAGGAGCAAAAGT‑AATAAGCAAA‑A‑GGCAATA‑AATGAGGGGAC‑AGAGAGGGATTC‑TAACTGTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCAGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGAGGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCGGAATCGTCCTGCCTGTCAGGa < 2:689243/239‑1 (MQ=255) aaaaaaaCG‑GGAGTTGCCATGTGGAGAAAAAGT‑AATAAGAAAC‑A‑GGCAGTA‑AATAAGTGGAC‑AGAGATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGacac < 2:716197/237‑1 (MQ=255) acactgggAGTTGCGATAATGACGAAAAGA‑AATAGTCACC‑T‑GGAATTA‑AATAGGTGGAC‑AGAGTTTGTCGC‑TACTTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgg < 2:1096056/233‑1 (MQ=255) gAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTTGAC‑AGAGATTGTCGC‑TAACTTTACAGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCCGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATCCAACAAGCGATTGACCTGAATACTCCTGCCTGTCAGGACACCTGGGAGAta > 2:767572/1‑238 (MQ=255) | TACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGCAAC‑A‑GGCAGTG‑AATAAGTTGAC‑AGAGATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATT > NC_000913/3206216‑3206691 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |