Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,206,489 | C→A | 15.3% | A10E (GCA→GAA) | ttdA → | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,206,489 | 0 | C | A | 15.3% | 265.2 / 12.1 | 132 | A10E (GCA→GAA) | ttdA | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/68); new base A (9/12); total (51/81) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.23e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 |
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
ATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCC > NC_000913/3206253‑3206723 | ttAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑GATTTTTTCAGACAAAAACAAAAACTAGAGTTGTCCTGATGAGCGTGAGG‑AATAAAC‑AAC‑AAGCCGG‑G‑aa > 1:261785/1‑239 (MQ=255) ttAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCAGACAAATAAAAAAACTGTAGATTGCATGGTGGGAGAGAGG‑TAAAAAC‑AAC‑AGGCAAT‑G‑ag > 2:148146/1‑238 (MQ=255) tAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑aa < 2:538390/238‑1 (MQ=255) aTTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATaa < 2:1345318/239‑1 (MQ=255) ttATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAg < 1:378572/239‑1 (MQ=255) tCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTg < 2:356486/239‑1 (MQ=255) gCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑GATTTTTTCACACAAAAAAAAAAAATGGAGTTGTCATGATGTGGGAAAGT‑AAAAAAC‑AAC‑AGGAAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑a > 2:1314934/1‑239 (MQ=255) gCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑a < 1:230324/239‑1 (MQ=255) tgtgATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑Ag‑a‑ga < 1:319244/238‑1 (MQ=255) tgtgATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGGTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAt < 1:554090/239‑1 (MQ=255) gATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑Tg < 2:868002/238‑1 (MQ=255) tAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCg < 2:443225/239‑1 (MQ=255) tAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATGCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTc < 1:717129/238‑1 (MQ=255) cgcAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTTAGACAAATACAAAAAATGGAGTTGTCCTTGTGAGCGGAAGT‑AAAAAAA‑AAA‑AAGCAAC‑G‑AAAAAGATTAA‑AG‑A‑GAT‑TGTGGcgca > 2:76146/1‑236 (MQ=255) tgtATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTTAAACAAAAAAAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAAA‑AAA‑AGGCAGA‑G‑AATAAAATGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACttt > 2:977525/1‑238 (MQ=255) tATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCa < 1:381189/203‑1 (MQ=255) ttCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑CATTTTTTCCTAAACAACAAAAAAAAGGGGGTGTCACAATGAGGGCAAGT‑AATAAAC‑CAC‑AAGCAAC‑G‑GAAAACTTGTC‑AG‑C‑GAT‑TGTCGG‑CCACTTTAcccc > 2:297075/1‑236 (MQ=255) ttCGCAAAACATTGCAATTCCCTGCTCTGGCGAAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACAAACTGTTAATTACATATTCCGGGGGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTA‑AATTTTTCCAGAAAAATACAAAACCGGGAGTTGCCATGATGAGCAAAAGA‑AATAAGC‑AAC‑GGGAAGT‑G‑AATAAGTGGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAATTTTACCGcc < 1:1034508/239‑1 (MQ=255) aaaaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCAGACAAATAAAAAAAATGGAGTTGCCATGATTAGCGGAAGT‑AAAAAAA‑AAC‑AAGAAGA‑G‑AATAATCTGAC‑AG‑A‑GGA‑TGTCGC‑GACAATTACCGCCATTAt > 1:673571/1‑239 (MQ=255) aaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTTACACAAATAAAAAAAATGGGGATTTCCTGATGAGAGAAAGT‑AATAAAC‑AAA‑AAGCAAG‑G‑AAAAAATTGAC‑AG‑A‑GAG‑TTTTCC‑TAACTTTTCCGCACTGAttt > 1:1369101/1‑239 (MQ=255) cccTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AAATTTTTCTGACACAAACAAAAAAATGAGGTGGCATGATGAGGGGAAGA‑AAAAAAC‑AAA‑AAGCAGT‑G‑GAAAAGTTGAA‑CA‑A‑GGA‑TGTTGG‑CAACTTTACCGCCCCGATTTCT‑TCCCCaaaa > 2:1211880/1‑236 (MQ=255) ctctGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCAGACAAAAACAAAAACAGGAGTTGTCACGGTGGGCGAAAGT‑AAAAAGC‑AAC‑ACGCAGG‑G‑AAAAAATTGTC‑AG‑A‑AAA‑TGTCGC‑TAACTTTACCACCCCGATTTCT‑ACCCGACAGCCtgat > 2:487715/1‑239 (MQ=255) gcgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCTAACAAAAAAAAAAAATGGGGTTGGCATGATGAGGGGAAAT‑AAAAAAA‑AACAAGACAG‑‑G‑AATAAGTTGACAAG‑A‑GAT‑TGTGGT‑GAACTTTCCGCCCAGAATTTTT‑ACCGCAATGCGTG‑TGACgg > 2:638215/1‑238 (MQ=255) gcAATATTAATTCTTATTTTCATGTGGATTCACGCACTGTTATTTACATACTCCCGGTGTAAAAAAATAAAAAACCACTTTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTCCCAGGATGAGGGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑TGGCAGT‑G‑AAAAGGTTGGC‑AG‑C‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACgtg < 1:874948/238‑1 (MQ=255) gaaaTATTATTTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGAAAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAATTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACgtg < 2:261785/236‑1 (MQ=255) atatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGGG‑AATTTTTTTCAACAAAAAAAAAAAATTGAGTTGTCATTATTAGCGGAAGT‑AATAAACAAAC‑AGAAAGT‑G‑AAAAATTAGAA‑AG‑A‑‑AG‑TGTCGG‑CAAATTTACCCGCCTGATTTAT‑AACCGGAAGCCCGGTGAccttgttg > 2:782590/1‑232 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑GATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAAATGGAGTTGTCATGATGAGGGGAAAT‑AAAAAAC‑AAA‑AAGGAGG‑G‑AAAAAGATGAC‑CG‑A‑GAA‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGAATTTT‑ACCCCTATGCCTGAGGACGGGGTGGa > 2:372883/1‑239 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TACCTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACgtg < 1:1346673/234‑1 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGAG‑AAATTTTTCACAAAAATAAAAAAAATGGGGTTGTCATAGTGGGCGTGAGT‑AAAAAGA‑AAA‑AAGAAAA‑G‑AATAAAATTTC‑AG‑A‑GAT‑ATTTGC‑TAAAATTATCCCCCTGCATTTT‑ACCCCAATGTCtgatgagaggtggga > 1:739830/1‑230 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTACGCGTTGATTCACGACCTGTTAATTACATAGTCACGGTGGAAAAAAATATAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAACACAAAAATTGGAGTTGCCATGAGGAGCGAAAGT‑AATAACC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAA‑AG‑A‑GAT‑TGTCCA‑TAATTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 1:777044/239‑1 (MQ=255) tATTTTCGGTTTGTTTCACGAAAGGTAAATTACATATTCAGGGTGTAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGGAGTTTGTGGGGGTA‑AATTTTCCCAGACAAATAAAAAAACGGGAGTTGCCAAGATGAGC‑AAAGTAAAAAAGC‑AAA‑AGGCGGT‑A‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGT‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 2:303189/239‑1 (MQ=255) tATTTTCGCTTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGACAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAAACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGT‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 1:1211880/239‑1 (MQ=255) tATTTGCGGGTTAATTCACGAACTTTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACTTTTTTAGTGGTAGTTGGTGGGGGTA‑AATTTTTCCAGAAAAAAACAAAAACGGGATTTGCCATGAGGAGCGAAAGT‑AATAAGA‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 1:782590/239‑1 (MQ=255) ttttCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCAGACAAAAACAAAAAATGGAGGTGTCATGATGAGCGGAAGA‑AATAAAC‑AAC‑AAACAGA‑G‑AATAAATTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGCGTAAATTT‑CCCCCCTGATTTTT‑ACCCCAAAAGCTGATGACGTTGTGGGGAAAATAAAACa > 2:731558/1‑239 (MQ=255) ttttCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AAATTTTTCAAAAAAAAAAAAAAAATAGAGTTTGCATTATGAGGGAAAGG‑AAAAAAA‑AAA‑AGGGAGA‑G‑GAAAAATTGAA‑AA‑A‑AAG‑TGTTAG‑TAACATTACCGCCCATATTTTT‑ACCCGGAAGGCTGATGTGGGGGGGGGTGAAATAAAACa > 2:975011/1‑239 (MQ=255) ttttCGCGTTGATTCACGAAATGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGAGGTG‑AAATTTTTCATACAAATAAAAAAAATCAAGGTGTCATGATAAGAGGAAAA‑AATAAGC‑AAA‑AGGAAGG‑G‑AAAAAGATGAC‑CG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTCAACGGCATGATTTCT‑ACCCCAAAGACTGAAGACGCGGGGGGTAAAcacaaaaa > 1:114003/1‑232 (MQ=255) tttCGCATGAATTAACGAATTTTAAATTAATTATAAAAGTTGGAAAAAAATAGAAAACCAAATTTTTAGTGGTATTTTGTGGAGGTA‑AATTTTTCCAGAAAAATACAAAAACTGGAGTCGCAATGATGAGTGAATGT‑AATAAGC‑ACC‑GGGAAGT‑G‑ATTAATTTGAC‑AG‑A‑GTT‑TGGCCT‑TAACTTTCCCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAg < 1:551818/239‑1 (MQ=255) ctgtttGATTCACGAACGTTTAATTACATATTCGCGGTGGCAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGCGGTA‑AATTTTCCCAGAAAAACACAAAAACTGGATTGGCCATAATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAGGTGGAC‑GG‑A‑GAT‑TGCCGC‑TACCTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTa < 1:1129549/235‑1 (MQ=255) cgcgTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTa < 1:362532/239‑1 (MQ=255) tGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGGG‑AAATTTTTCAGACAAATAAAAAAAATGGAGTTGGCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAAC‑AAC‑AAGCAGG‑G‑AATAAATTGAC‑AG‑A‑AAT‑TTTCGC‑TAACTTTAACGCCCTGATTTCT‑ACCCCAATGCCTGGTGACGTGGGGGGTAAACTAAAACAACTAAAGGGTG‑C‑CGAAAcgtc > 1:812328/1‑239 (MQ=255) ttaattaaATATTCACGGTGGAAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 1:1335734/214‑1 (MQ=255) aaTTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑GATTTTTTCTAACAAATACAAAAAATTGAGTTGCCATGATGAGGGAAAGA‑AATAAGA‑AAA‑AAGGAAT‑G‑AATAAAATTAA‑AG‑A‑GAT‑TGGCGC‑CAACCTTACAGCCATGATTTTT‑ACCCGAATGCCTGATTACGGGGTGGGAAAACTAAAAAAACTAAAGGATG‑C‑CGaaaaactgtcg > 1:904245/1‑231 (MQ=255) aaTTAAATATACACGGTGGCAAAAAAAATAAACCCACATTTTTAGTGGTATTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAATTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGtcgtcg < 1:484347/239‑1 (MQ=255) tacaattacACGGGGGAAAAAAAAAAAAACCCAAATTTTTAGTGGTAG‑TTGGGGGGGTGAAATTTTTCCAGAAAAAAACAAAAACGGGGGTGGCTTGGATGAGCGAAAGA‑AATAAGC‑AAC‑GGGAAGT‑A‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑GGTCGA‑TAATTTACCCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATg < 2:592744/231‑1 (MQ=255) atatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCAGACAAATACAAAAACTTGAGGTGGCCTTATGGGCGGAAGA‑AATAAAC‑AAA‑AAGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TTACTTTACCGCCCTGATTTTT‑TCCCCGATGCCTTATGACGTGGGGGGTAAAATAAAACAACTAAAGGAAGCC‑CGAAAC‑TCGTTGGTgggg > 1:358918/1‑239 (MQ=255) tatTCACGGTGGAAAAAAATAAAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGGGGTA‑AATTTTTCCAGAAAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGAAGT‑G‑AATAAGTGGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TATCTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGa < 2:1241603/239‑1 (MQ=255) tatTCACGGGGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:41850/239‑1 (MQ=255) tatTCACCGTGGAAAAAAATAGAAAACCAAATTTTAAGGGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAAAAAAATACAAAAACTGGAGGTGCCATAAGGGGCAAAATT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTGGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑AAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:1084316/239‑1 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AAATTTTTTATAAAAAAACACAAAATGGAGTTTTCATGAGGAGGGAAAAT‑AATAAAC‑AAA‑CAGCAGA‑G‑AATAAGTTGAA‑CG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAAATTTAACCCCATGATTTTT‑ATCCGAATGCCTCGTTAAGTGGGGGGTAAACTAAAACAGCTAAACGAAG‑C‑CCAAAccaagtacattgggga > 2:1128489/1‑224 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AAATTTTTCCGACAAAAACAAAAACAGGGGTTTCCATTGTGAGGGGAAGT‑AATAAAC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AAAAAATTGAC‑AA‑A‑GAA‑TGTCGC‑TAACTTTACCCCCCTGATTTTT‑ACCCCAATTCCTGATTGAGGGGTGGGTAAACTAAAAAAACTCAAAGATT‑G‑CGAAACGTCCGCGATggggga > 1:1241603/1‑237 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAAAATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAAAACAAAAACTGGATTGGCCATGATGAGCAAAAGA‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGaa < 1:294935/239‑1 (MQ=255) ttgaCGGTGGAAAAAAAAAAAAACCCAAATTATTATTGGTGATTGGTGGCGGAT‑AATTTTTCAAAACAAAAAAAAAAACTGGAGTGCCGATGATGAAAGAAATT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑T‑AATAAGTTGAC‑GG‑A‑GCT‑TGTCGA‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGa < 2:686643/234‑1 (MQ=255) agggtgaaaaaaaaTAAAAAACCACATTTTTGGTGGGAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTACAGACAAATACAAAAACGGGGGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GTT‑TGTCGC‑TAATTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAAtt < 2:1341638/231‑1 (MQ=255) aCGGTGGAAAAAAATATAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGGGGTG‑AATTTTTCAAGAAAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAAtt < 2:812328/239‑1 (MQ=255) aCGGTGACAAAAAAGATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑ATTTTTACAAGAAAAAGAGAAAAACTGGGGGTGCTATGAGGGGGTAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGAAGG‑G‑AAAAAGTTGAA‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTCCCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAAtt < 1:1244826/239‑1 (MQ=255) cGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCCCACAAAAAAAAAAAATGGAGTTGCCATGATGAGAGAAAGA‑AATAAAC‑AAA‑AAGGAAT‑G‑AAAAAAATGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAAATTTACCGCCATGATTTTT‑ACCCCAATGCCCGATGACGTGGTGGGTAAAATAAAAAAGCTAAAGGAAG‑C‑CGAAAAGGCGTCGATGGGGGAAATTa > 1:1067518/1‑239 (MQ=255) ggTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGCG‑AATTTTTCCAAAAAAAAAAAAAAAAATGGGGTGTCATTATGAGCGGAAAG‑AAAAAAA‑AAA‑AAACAAT‑G‑AAAAAATTGAC‑AG‑A‑GAA‑TGTCGC‑TCACATTTTCACCCTAATTTCT‑ACCCCAAAGCCCGATGAGCGGGGGGTTAAAATCAAAAAAATAAACGATG‑C‑CGAAACGTCGCCGATGGGGAAAAatat > 2:1182401/1‑239 (MQ=255) ttGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTAAGTGGTATTTTTGGGCGGTG‑AATTTTACCAGACAAAAACAAAAACTGGGGTTTCGTTGAGGAGCAAAAGT‑AATAACC‑AAC‑AGGCAGT‑A‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GTT‑GGTGGC‑TAACTTTGCCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 1:1128489/237‑1 (MQ=255) gTGGAAAAAAATATAAAACCACATGTTTAGTGGTAGTTTGTGGGGTTA‑AATTTTTCCAAAAAAATACAAAAACTGGAGTGGCAATGAGGAGTGAAATT‑AAAAAGC‑ACC‑AGGAAGA‑A‑AATAATTTGAC‑AG‑G‑AAT‑TGTCGC‑TAATTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 1:709548/238‑1 (MQ=255) aaaggaaaacacgaaatttagaGTGGTAGTTGGTGGCAGTA‑TATTTTTCAAGACAAAAACAAAAACTGGGTTTGCCAGTATGAGCGAAAGA‑AATAACC‑AAC‑AGGCAGG‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GGT‑GGTCGC‑AAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATa < 2:240694/218‑1 (MQ=255) aaaaTAAAAACCCACATTTTTAGGGGTATTTTGTGGCGGTA‑AATTTTTCCAGAAAAATAAAAAAACGGGGATGTCAATGAGGAGCAAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GTA‑TGTCGC‑TAATTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATa < 2:576389/239‑1 (MQ=255) aaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGA‑AAC‑AGGAAGT‑A‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GTT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 1:731558/239‑1 (MQ=255) aaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTCCCAAACAAATAAAAAAACTGGAGTTGCAATGATGAGCGAAAGA‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑A‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAATTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 1:36974/239‑1 (MQ=255) aaTAAAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑ATTTTTCCCAGACAAAAAAAAAAACGGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGA‑AAC‑AGGCGGT‑A‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GTT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 2:1352722/239‑1 (MQ=255) aaTAAAAACCCAAATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGGGGTA‑AATTTTCCCAGACAAATAAAAAAACGGGAGTGGCAATGATGAGAGAAATT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑A‑AATAAGTTGAA‑AG‑A‑GAT‑TGTCGT‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 2:1291049/239‑1 (MQ=255) aaTAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGCGGTA‑AATTTTCCCAGAAAAATACAAAAACGGGAGTTGCCATGAGGAGCAAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑GGGCAGT‑A‑AATAAGTTGAA‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 1:68787/239‑1 (MQ=255) cacaTTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCCGACAAATAAAAAAAATGGAGTTGTCATGATGGGCGGAAGA‑AATAAAC‑AAC‑AAGCAGA‑G‑AAAAAAATGGC‑AA‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTTCCCCCCTGATTTTT‑ACCCGAATGACTGATGACGTGGGGGGTAAACAAAAAAAACTAAAGGAAG‑C‑CGAAACGGCGTCGGTGGGGGAAAATATTTAACAAACGAAATTTGaca > 2:127087/1‑239 (MQ=255) acaTTTTTATTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATAAAAAAACTGGAGTTGCAATGATGAGGGAAAGT‑AATAAGA‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAGGTTAAG‑AG‑A‑GAT‑TGTCGT‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGacaa < 1:1174881/239‑1 (MQ=255) aaaTTTTGAGTGGTAGTTTGTGGCGGTA‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAATA‑AAAAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGacaa < 1:487715/237‑1 (MQ=255) caTTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCTAACAAAAAAAAAAAATGGAGTTGTCATGCTGAGGGAAAAT‑AAAAAGA‑AAA‑AAGCAGG‑GAAAAAAGTTG‑C‑AG‑A‑GGT‑TTTAGC‑TAACATTCCCGCCACAACTTCTAACCCCAAT‑CCCGATTACGCGGGGGACAAAATAAAAAAACTAACAGATG‑CACAAAACG‑CGTTGCGGGGGGAAATTAATTACCATACCATTTTTGacaaa > 2:685745/1‑238 (MQ=255) caTTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCAGAAAAAAACAAAAAAAGGAGGTGCCATGATGGGCGAAAGT‑AATAAAC‑AAC‑AGGCAGA‑G‑AAAAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTGGC‑Taa > 2:1393126/1‑121 (MQ=255) aattggtgGCGGTA‑AATTTTTCAGGCAAAACAAAAAAACTGGATTTCCCATGATGAGCCAAAGT‑AATAAGC‑ACC‑AGGCGGT‑G‑AATAAGTGGAC‑AG‑T‑GTT‑GCTCGC‑TATCTTTGCCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGTCGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 1:758974/234‑1 (MQ=255) aGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACGGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 1:148146/239‑1 (MQ=255) aGTTTGTGGCGGTA‑AATTTTTCAAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AAAAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 1:76146/239‑1 (MQ=255) gtgtgggtagttG‑AATTTTGACAGAAAAATAAAAACACTGGATTTGCGAAGAGGAGCAAAAAT‑GATAAGC‑AAC‑ATGCGGT‑G‑AAAAATTTAAC‑AG‑T‑AGT‑TGTCCA‑TAATTTTACCACCATGATTTCT‑ACCCGCATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 1:1176372/227‑1 (MQ=255) gTTGGTGGCGGTA‑AATTTTTCAAGAAAAATAAAAAAACTGGAGTGGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAATC‑AAC‑AGGCGGT‑A‑AATAAGTTGAA‑AG‑A‑GTT‑TGTCGT‑TACCTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 2:821929/238‑1 (MQ=255) tgtgGGGGTA‑AATTTTCCAAAAAAAATAAAAAAATGGGAGTTGCCATGAAGAGCGAAATA‑AATAAGC‑AAC‑AGGCGGT‑A‑AATAAGTTGAA‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGa < 2:1067518/239‑1 (MQ=255) ggggCGGTG‑AATTTTTCCAAAAAAATAAAAAAACGGGAGTTGCCATGATGAGCAAAAGA‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑A‑AATAAGTGGAC‑AG‑A‑GAT‑TTTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGAc < 2:764714/237‑1 (MQ=255) ggTA‑AATTTTACAAGAAAAATACAAAAACGGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑A‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGa < 2:398705/238‑1 (MQ=255) tttCCAAACAAATAAAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGAGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGAAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctg < 1:1379660/239‑1 (MQ=255) tttCCAAAAAAAAAAAAAAACTGGATGTGCAATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑A‑AATAATGTGAA‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑AAATTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctg < 1:975011/239‑1 (MQ=255) ttacaaGAAAAAGACAAAATCGGGAGTTGCCAGGATGAACGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AAAAAGTTGAC‑GG‑A‑GAT‑TGTGGT‑TATCTTAACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctg < 1:297075/234‑1 (MQ=255) taaaaaaaaaaaaaaaaaTGGGGGTTGCAATGAGGAGCAAAAGT‑AAAAAGC‑AAA‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑TTT‑GGTCGT‑TATCTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctgcc < 2:113305/226‑1 (MQ=255) tataagagacaaagCTGGAGTTGCCATGAGGAGAAAAAGA‑AAAAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑A‑AATAAGTTGAG‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGt < 2:108414/228‑1 (MQ=255) aaaaaaacaaaaacTGGATTTGCCATAATGAGAAAAATA‑AAAAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GTT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCa < 1:1314934/237‑1 (MQ=255) aaaaaaacaaaaacTGGAGTTGCCATGATGGGCGAAAGA‑AAAAAGC‑AAC‑GGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCa < 1:38975/237‑1 (MQ=255) aaaaaTACAAAAACTGACTTTCCCATGATGAGCGAAAGA‑AAAAAGC‑AAC‑AGG‑AGTGG‑AATAAGTT‑AC‑AG‑AGGAT‑TTCCGC‑TATTTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCa < 2:1131393/237‑1 (MQ=255) aaTAAAAAAAGTAGATTTGACATGAGGAGCAAAAGT‑AATAAGC‑AAA‑AGGCAAT‑A‑AATGAGGGGAC‑AG‑A‑GAG‑GGATTC‑TAACTGTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCAGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGAGGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCGGAATCGTCCTGCCTGTCAGGa < 2:689243/239‑1 (MQ=255) aaaaaaaCGGGAGTTGCCATGTGGAGAAAAAGT‑AATAAGA‑AAC‑AGGCAGT‑A‑AATAAGTGGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGacac < 2:716197/237‑1 (MQ=255) acactgggAGTTGCGATAATGACGAAAAGA‑AATAGTC‑ACC‑TGGAATT‑A‑AATAGGTGGAC‑AG‑A‑GTT‑TGTCGC‑TACTTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgg < 2:1096056/233‑1 (MQ=255) aaaggggatcgacagaatgaGGGAAAGT‑AAAAACA‑AAA‑AGGAAGT‑G‑‑ATGAATTG‑C‑AGAA‑GATGTGTTGC‑AAACTTTACCGCCATGATTTCT‑AATCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAAGCGTCCTGCCTGTCAGGACATCgggg < 2:14695/223‑1 (MQ=255) aaCTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAATTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgggg < 1:567100/239‑1 (MQ=255) gCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTc < 1:752411/80‑1 (MQ=255) gCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTc > 2:752411/1‑80 (MQ=255) gCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGt > 1:1068313/1‑238 (MQ=255) gCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGt > 1:100135/1‑238 (MQ=255) gCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGAGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGt > 2:228097/1‑238 (MQ=255) aaGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑A‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GTT‑TGTCTC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGt < 2:36186/237‑1 (MQ=255) c‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTcc > 2:5762/1‑238 (MQ=255) c‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGAAGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGAAGGGGAAAATGATCTACCATACTATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCATCCTGCCTGACAGTACACCGCGGAGACTATGTTCTTCGTTAAAGTCGATTCCCACTTccc > 1:1386537/1‑239 (MQ=255) | ATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑AGGCAGT‑G‑AATAAGTTGAC‑AG‑A‑GAT‑TGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCT‑ACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑C‑CGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCC > NC_000913/3206253‑3206723 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |