| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,377,045 | Δ1 bp | 2.5% | coding (170/318 nt) | sugE → | multidrug efflux system protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,377,045 | 0 | C | . | 2.5% | 567.2 / 5.1 | 158 | coding (170/318 nt) | sugE | multidrug efflux system protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (85/69); new base . (2/2); total (87/71) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.14e-01 | |||||||||||
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
ATCAGCTTTGCAGGACGACCTGCAAACGCCTCTTTTCACCGGGGACGGCCCCAATTCTCCGGAGCCTGATATGTCCTGGATTATCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGCACTCACTAACTACCAGGCTGCTGTACCCAAATAAATTTACTGACATCAAACCCTTCCCGGGTCGCGACTGCCAGCATCTCCTGTTTCACTTCGTCAGA > NC_000913/4376806‑4377282 | aGCTTTGCAGGACGACCTGCAAACGCCTCTTTTCACCGGGGACGGCCCCAATTCTCCGGAGCCTGATATGTCCTGGATTATCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACg > 1:936573/1‑238 (MQ=255) aGCTTTGCAGGACGACCTGCAAACGCCTCTTTTCACCGGGGACGGCCCCAATTCTCCGGAGCCTGATATGACCTGGATTATCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACg > 2:463391/1‑238 (MQ=255) tGCAGGACGACCTGCAAACGCCTCTTTTCACCGGGGACGGCCCCAATTCTCCGGAGCCTGATATGTCCTGGATTATCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTAt > 2:681698/1‑239 (MQ=255) ggacCTTCAAACGCCTCTTTTCACCGGGGACGGCCCCAATTCTCCGGAGCCTGATATGTCCTGGATTAACTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATGCCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCgtg < 2:1317172/237‑1 (MQ=255) cgacCTGCAAACGCCTCTTTTCACCGGGGACGGCCCCAATTCTCCGGAGCCTGATATGTCCTGGATTATCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCgtgt > 1:150231/1‑239 (MQ=255) cgacCTGCAAACGCCTCTTTTCACCGGGGACGGCCCCAATTCTCCGGAGCCTGATATGTCCTGGATTATCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCgtgt > 1:1229885/1‑239 (MQ=255) ccTGCAAACGCCTCTTTTCACCGGGGACGGCCCCAATTCTCCGGAGCCTGATATGTCCTGGATTATCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGGCGTGTGGa > 2:1211975/1‑239 (MQ=255) cTGCACACGCCTCTTTTCACCGGGGACGGCCTCAATTCTCCGGAGCCTGATATGTCCTGGATTTTCTTAGTTATTGCTTTTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTTACGCCGAGTGTTATTACTGTTACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTTCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGAc < 1:375934/239‑1 (MQ=255) tGCAAACGCCTCTTTTCACCGGGGACGGCCCCAATTCTCCGGAGCCTGATATGTCCTGGATTATCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACg < 1:463391/239‑1 (MQ=255) gCCTCTTTTCACCGGGGACGGCCCCAATTCTCCGGAGCCTGATATGTCCTGGATTATCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGGTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTg > 2:344755/1‑239 (MQ=255) ctctTTTCACCGGGGACGGCCCCAATTCTCCGGAGCCTGATATGTCCTGGATTATCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGGAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTgg < 1:754586/238‑1 (MQ=255) cGGGGACGGCCCCAATTCTCCGGAGCCTGATATGTCCTGGATTATATTATTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGgcg < 2:1476246/239‑1 (MQ=255) cGGCCCCAATTCTCCGGAGCCTGATATGTCCTGGATTATCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGcc < 2:1426038/238‑1 (MQ=255) gCCCCAATTCTCCGGAGCCTGATATGTCCTGGATTATCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATa > 2:472659/1‑239 (MQ=255) gCCCCAATTCTCCGGAGCCTGATATGTCCTGGATTATCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGAGCGGCCATa > 1:1278291/1‑239 (MQ=255) aGCCTGATATGTCCTGGATTATCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGtgct > 2:333300/1‑238 (MQ=255) ccTGATATGTCCTGGATTATCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGCCGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCGTTGggctgc > 1:589915/1‑238 (MQ=255) atGTCCTGGATTATCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGa < 2:802511/239‑1 (MQ=255) atGTCCTGGATTAGCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGa < 2:458170/239‑1 (MQ=255) ccTGGATTATCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGTGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTa > 1:966463/1‑189 (MQ=255) ccTGGATTATCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGa < 2:532496/183‑1 (MQ=255) ccTGGATTATCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTa < 2:966463/189‑1 (MQ=255) ccTGGATTATCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGc > 1:28059/1‑208 (MQ=255) ccTGGATTATCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGc < 2:28059/208‑1 (MQ=255) cTGGATTATCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCg < 1:1416962/239‑1 (MQ=255) gATTATCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTa > 2:186198/1‑239 (MQ=255) tCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAAc > 1:452273/1‑205 (MQ=255) tCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCg > 2:494324/1‑239 (MQ=255) tCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCg > 1:310076/1‑239 (MQ=255) tCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCg > 2:68822/1‑239 (MQ=255) tCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCg > 2:915555/1‑239 (MQ=255) tCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGGGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCg > 2:585210/1‑239 (MQ=255) tCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGA‑GGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAAccc > 2:1225605/1‑237 (MQ=255) tAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATg < 2:496617/239‑1 (MQ=255) gTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCg < 1:1220398/226‑1 (MQ=255) gTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGG‑‑‑GGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATgcg > 2:1399872/1‑236 (MQ=255) tATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATgcgc < 1:472659/238‑1 (MQ=255) aTTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATgcg > 2:480444/1‑236 (MQ=255) tGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTg > 2:1052198/1‑238 (MQ=255) tGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTg > 1:1507068/1‑238 (MQ=255) tGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTg > 2:270384/1‑238 (MQ=255) tGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTg > 2:878749/1‑238 (MQ=255) tGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACAGGCATTGGGCTGCTCGGGGGGGCCGTTAACCCGAGGCCCCTg > 1:1108038/1‑238 (MQ=255) gCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGc < 1:80510/239‑1 (MQ=255) gTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAg > 2:572957/1‑238 (MQ=255) ctgctgGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTc < 1:1211975/238‑1 (MQ=255) ggTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAAt < 2:1229885/237‑1 (MQ=255) aTGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTa < 2:1170745/238‑1 (MQ=255) gggCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGt > 2:188175/1‑228 (MQ=255) gggCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTg < 1:44095/239‑1 (MQ=255) gCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTaa > 1:1050183/1‑229 (MQ=255) gCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTaa < 2:1050183/229‑1 (MQ=255) ttGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGgtt > 2:1054965/1‑239 (MQ=255) ttGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGatt > 1:1115561/1‑239 (MQ=255) ttGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGatt > 2:632585/1‑239 (MQ=255) ttGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGatt > 1:25830/1‑239 (MQ=255) tGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGatta > 2:1482951/1‑239 (MQ=255) tGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTgg > 1:1153017/1‑238 (MQ=255) tGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTgg > 1:477925/1‑238 (MQ=255) taCCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGaa > 1:87341/1‑237 (MQ=255) aCCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGAGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACt < 2:1278291/239‑1 (MQ=255) cACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAg < 1:915555/239‑1 (MQ=255) aCGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGc > 2:259341/1‑239 (MQ=255) aCGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGc > 1:1014301/1‑239 (MQ=255) aCGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGc > 1:106204/1‑239 (MQ=255) cGGCTTTTGTCGTTTGACGCCGAGTGTTTTTATCGGGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGGTACTTGCCTGGGCGGTGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGGCGGCGCCGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGca < 2:1108038/239‑1 (MQ=255) cGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGc > 1:918472/1‑238 (MQ=255) cGGCTTTAGGCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAAGCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGca < 2:1185508/239‑1 (MQ=255) cTTTAGGCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGca < 2:1001214/236‑1 (MQ=255) tAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTa < 1:76535/205‑1 (MQ=255) tAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGcactcact < 2:106204/239‑1 (MQ=255) tAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGcactcact < 1:345517/239‑1 (MQ=255) ttGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGCACTCACTAACTAcc > 1:1317134/1‑239 (MQ=255) ttGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGG‑‑‑GGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGCACTCACTAACTACCAgg < 1:1399872/239‑1 (MQ=255) tGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGCACTCACTAACTACCa < 1:572957/239‑1 (MQ=255) cGCCGAATGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGCACTCACTAACTACCAgg < 1:1074314/238‑1 (MQ=255) gAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGCACTCACTAACTACCAGgctgct < 1:333300/239‑1 (MQ=255) aGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACt < 2:1024685/212‑1 (MQ=255) taCTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGCACTCACTAACTACCAGGCTGCTGTACCCaaa < 1:550170/239‑1 (MQ=255) gtgACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAg < 2:1275724/135‑1 (MQ=255) gtgACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAg > 1:1275724/1‑135 (MQ=255) gtgACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGCACTCACTAACTACCAGGCTGCTGTACCCaaataaa > 1:1003305/1‑239 (MQ=255) gtgACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGCACTCACTAACTACCAGGCTGCTGTACCCaaataaa > 2:202873/1‑239 (MQ=255) gtgACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGCACTCACTAACTACAAGGCTGCTGTACCCaaataaa > 2:133831/1‑239 (MQ=255) gtgACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGCTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGCACTCACTAACTACCAGGCTGCTGTACCCaaataaa > 2:775471/1‑239 (MQ=255) agACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGCGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCTGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTTCGCAACCCCGAAGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTATTAGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCTGCACTCACTAACTCCCCGGATGCTGTACCCaaatacat > 2:710986/2‑239 (MQ=255) gACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGCACTCACTAACTACCAGGCTGCTGTACCCaaataaat < 1:681698/238‑1 (MQ=255) aCGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAAt < 2:927031/170‑1 (MQ=255) aCGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGCACTCACTAACTACCAGGCTGCTGTACCCAAATAAAttt > 2:1126630/1‑239 (MQ=255) cGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGCACTCACTAACTACCAGGCTGCTGTACCCAAATAAATTTACt < 2:1153017/238‑1 (MQ=255) gatTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGCACTCACTAACTACCAGGCTGCTGTACCCAAATAAATTTACTGACa > 1:526998/1‑238 (MQ=255) gTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGCACTCACTAACTACCAGGCTGCTGTACCCAAATAAATTTACTGACATCaaa < 1:270384/239‑1 (MQ=255) tGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGCACTCACTAACTACCAGGCTGCTGTACCCAAATAAATTTACTGACATCAAACCCTTc > 1:614823/1‑238 (MQ=255) tGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGCACTCACTAACTACCAGGCTGCTGTACCCAAATAAATTTACTGACATCAAACCCTTc > 1:1045190/1‑238 (MQ=255) tACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGCACTCACTAACTACCAGGCTGCTGTACCCAAATAAATTTACTGACATCAAACCCTTCCCGGGTc > 1:704140/1‑239 (MQ=255) cTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGCACTCACTAACTACCAGGCTGCTGTACCCAAATAAATTTACTGACATCAAACCCTTCCCGGGTcgc > 1:318872/1‑239 (MQ=255) gATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGCACTCACTAACTACCAGGCTGCTGTACCCAAATAAATTTACTGACATCAAACCCTTCCCGGGTCGCGACTGCCAGc < 1:216645/238‑1 (MQ=255) aGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGCACTCACTAACTACCAGGCTGCTGTACCCAAATAAATTTACTGACATCAAACCCTTCCCGGGTCGCGACTGCCAGCATCTCCTGTTTCACTTc < 1:978148/237‑1 (MQ=255) cGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGtgc < 2:330262/60‑1 (MQ=255) cGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGCACTCACTAACTACCAGGCTGCTGTACCCAAATAAATTTACTGACATCAAACCCTTCCCGGGTCGCGACTGCCAGCATCTCCTGTTTCACTTCGTCAGa < 1:1054965/238‑1 (MQ=255) | ATCAGCTTTGCAGGACGACCTGCAAACGCCTCTTTTCACCGGGGACGGCCCCAATTCTCCGGAGCCTGATATGTCCTGGATTATCTTAGTTATTGCTGGTCTGCTGGAAGTGGTATGGGCCGTTGGCCTGAAATATACCCACGGCTTTAGTCGTTTGACGCCGAGTGTTATTACTGTGACGGCGATGATTGTCAGTATGGCGCTACTTGCCTGGGCGATGAAATCGTTACCAGTAGGGACGGCTTATGCCGTGTGGACGGGTATTGGCGCAGTCGGCGCGGCCATAACCGGCATTGTGCTGCTCGGTGAGTCCGCTAACCCGATGCGCCTGGCGAGTCTGGCGTTAATCGTATTGGGGATTATTGGTCTGAAACTCAGCACTCACTAACTACCAGGCTGCTGTACCCAAATAAATTTACTGACATCAAACCCTTCCCGGGTCGCGACTGCCAGCATCTCCTGTTTCACTTCGTCAGA > NC_000913/4376806‑4377282 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |