Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,191,262 | 0 | T | . | 2.7% | 557.1 / 3.8 | 149 | coding (725/1371 nt) | purB | adenylosuccinate lyase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (88/57); new base . (2/2); total (90/59) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.49e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 |
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
CAATACCGCGTTGGAAAGGCCCAGATTCCCTTCGGAGTTTTCGAAGTCGATCGGGTTAACTTTATGCGGCATGGTGGAAGAACCAATCTCACCAGCAATGGTTTTCTGTTTGAAGTGGTTAAGGGCGATATAACCCCAGACGTCACGGTCAAAGTCGATCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAATCAAACAGTTCGGCAATGTAGTCGTGCGGTTCGATCTGGGTGGTGTACGGGTTCCACTGAATACCCAGCGAGGTGACGAACTCTTCGCTGAACTGATGCCAGTCAACTTCCGGGTAAGCGGCGATGTGGGCGTTATAGTTACCGACCGCGCCGTTGATTTTGCCGAGGATCTCCACCTGGTTAAGCTGGCGGTACTGGCGCTCCATACGGTAGGCGACGTTTGCCATCTCTTTACCGATGGTTGACGGCGTGGCTGGCTGACCGTGGGTACGAGACAGCAGCGGGA > NC_000913/1191024‑1191496 | cAATACCGCGTTGGAAAGGCCCAGATTCCCTTCGGAGTTTTCGAAGTCGATCGGGTTAACTTTATGCGGCATGGTGGAAGAACCAATCTCACCAGCAATGGTTTTCTGTTTGACGGGGTTAAGGGCGATATAACCCCAGACGCCACGGTCAAAGTCGTTCAGAATAGTGTTGAAGCGCGCAACGCAATCAAACAGTTCGGCAATGTAGTCGTGCGGTTCGATCTGGGTGGGGTACGGGt > 2:1179893/1‑239 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |