| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 1,744,418 | Δ1 bp | 2.8% | coding (962/1374 nt) | mdtK → | multidrug efflux system transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,744,418 | 0 | T | . | 2.8% | 492.1 / 3.9 | 140 | coding (962/1374 nt) | mdtK | multidrug efflux system transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (66/68); new base . (2/2); total (69/71) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
GGTTTGCCGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGACCGGGCTTATGGTGGGTGTCTGTATGGCAACCCTGACGGCCATTTTCACGGTTTCACTGCGGGAGCAAATCGCCCTGTTGTACAACGACAATCCCGAGGTTGTAACGCTGGCTGCGCATTTGATGTTGCTGGCGGCGGTATATCAGATTTCTGACTCAATCCAGGTGATTGGCAGTGGGATTTTGCGTGGTTATAAAGATACGCGTTCCATTTTCTATATTACCTTTACGGCTTACTGGGTGCTGG > NC_000913/1744180‑1744651 | ggTTTGCCGATTGCGCTGGCACTGTTCTTTGAAGTGACACTGTTTGCCGTCGTGGCTCTGTTAGTGTCTCCGCTCGGTATTGTTGATGTCGCAGGACACCAGATTGCCCTGAACTTTAGTTCACTAATGTTCGTGCTTCCAATGTCGCTGGCGGCAGCGGTAACTATCCGCGTAGGTTATCGTCTGGGTCAGGGCTCAACGCTGGATGCGCAAACCGCTGCGCGGACCGGGCTTAtggt < 2:271329/239‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |