| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2531963 | 138 (0.990) | 4 (0.030) | 3/410 | NT | 2.7% | coding (503/762 nt) | cysZ | sulfate transporter, sulfite inhibited |
| ? | NC_000913 | = 2532165 | 161 (1.210) | coding (705/762 nt) | cysZ | sulfate transporter, sulfite inhibited | |||||
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
ACTTCATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGATGTGGGTCGATTGCTATCGCGATAAACACGCGATGTGGCGGTAACAATCTACCGGTTATTTTGTAAACCGTTTGTGTGAAACAGGGGTGGCTTATGCCGCCCCTTATTCCATCTTGCATGTCATTATTTCCCTTCTGTATATAGATATGCTAAATCCTTACTTCCGCATATTCTCTGAGCGGGTATGCTACCTGTTGTATCCCAATTTCATACAGTTAAGGA > NC_000913/2531930‑2532400 | cATCCCTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTggcgcg < 1:131813‑M2/238‑7 (MQ=255) cTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTggcgc < 2:323727‑M2/232‑6 (MQ=255) cTGGTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTggcgc > 1:323727‑M2/1‑227 (MQ=255) ggTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCCACGGCGAt > 1:1407386/1‑239 (MQ=255) gTATTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGAtg > 1:805136/1‑239 (MQ=255) aTTGGGCAAACCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTGGCGCGACGGCGAtgt < 1:1058314/238‑1 (MQ=255) aCCGTCGCGCCGGTACTGTGGTTCCTGTTTAGCGCCTGGATGTTAGCCATCCAGTATTGCGATTACCCCTTCGATAACCACAAAGTGCCGTTTAAAGAGATGCGCACCGCCCTGCGCACACGCAAAATCACCAATATGCAGTTTGGTGCTTTAACCAGCCTGTTTACGATGATCCCGCTGCTTAATCTGTTCATCATGCCCGTTGCCGTTTGTggcgcgacg < 2:294181‑M2/222‑10 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |