| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4030411 = | 183 (1.310) | 3 (0.020) | 3/402 | NT | 1.9% | coding (560/2190 nt) | fadB | fused 3‑hydroxybutyryl‑CoA epimerase/delta(3)‑cis‑delta(2)‑trans‑enoyl‑CoA isomerase/enoyl‑CoA hydratase/3‑hydroxyacyl‑CoA dehydrogenase |
| ? | NC_000913 | 4031384 = | 140 (1.070) | coding (225/1332 nt) | pepQ | proline dipeptidase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
AAGGGTAAAAAATGGAATCACTGGCCTCGCTCTATAAAAATCATATAGCTACCTTACAAGAACGGACTCGCGATGCGCTGGCGCGCTTCAAGCTGGATGCGTTACTTATTCACTCCGGCGAGCTGTTCAATGTTTTTCTCGACGATCATCCCTATCCGTTTAAAGTGAACCCGCAATTCAAAGCGTGGGTGCCGGTAACTCAGGTGCCAAACTGCTGGTTGCTGGTGGATGGCGTGAACAAGCCGAAACTGTGGTTCTATCTGCCGGTTGATTACTGGCACAACGTCGAACCGCTGCCGACCTCTTTCTGGACTGAAGATGTGGAAGTGATCGCGCTGCCGAAAGCCGATGGCATTGGTAGCCTGCTGCCTGCTGCGCGCGGCAATATCGGTTATATCGGTCCGGTGCCGGAACGTGCGCTGCAACTGGGTATTGAGGCCAGCAACATCAACCCGAAAGGGGTTATCGACTACC > NC_000913/4031149‑4031622 | aGGGTAAAAAATGGAATCACTGGCCTCGCTCTATAAAAATCATATAGCTACCTTACAAGAACGGACTCGCGATGCGCTGGCGCGCTTCAAGCTGGATGCGTTACTTATTCACTCCGGCGAGCTGTTCAATGTTTTTCTCGACGATCATCCCTATCCGTTTAAAGTGAACCCGCAATTCAAAGCGTGGGTGCCGGTAACTCAGGTGCCAAACTGCTGGTTGCTGGTGGATGGCGTGaa < 1:202057/237‑1 (MQ=255) aaTCACTGGCCTCGCTCTATAAAAATCATATAGCTACCTTACAAGAACGGACTCGCGATGCGCTGGCGCGCTTCAAGCTGGATGCGTTACTTATTCACTCCGGCGAGCTGTTCAATGTTTTTCTCGACGATCATCCCTATCCGTTTAAAGTGAACCCGCAATTCAAAGCGTGGGTGCCGGTAACTCAGGTGCCAAACTGCTGGTTGCTGGTGGCTGGCGTGAACAAGCCGCACTTGTgg > 2:624915/1‑239 (MQ=255) aaTCACTGGCCTCGCTCTATAAAAATCATATAGCTACCTTACAAGAACGGACTCGCGATGCGCTGGCGCGCTTCAAGCTGGATGCGTTACTTATTCACTCCGGCGAGCTGTTCAATGTTTTTCTCGACGATCATCCCTATCCGTTTAAAGTGAACCCGCAATTCAAAGCGTGGGTGCCGGTAACTCAGGTGCCAAACTGCTGGTTGCTGGTGGATGGCGTGAACAAGCCGAAACTGTgg > 2:780413/1‑239 (MQ=255) aaTCACTGGCCTCGCTCTATAAAAATCATATAGCTACCTTACAAGAACGGACTCGCGATGCGCTGGCGCGCTTCAAGCTGGATGCGTTACTTATTCACTCCGGCGAGCTGTTCAATGTTTTTCTCGACGATCATCCCTATCCGTTTAAAGTGAACCCGCAATTCAAAGCGTGGGTGCCGGTAACTCAGGTGCCAAACTGCTGGTTGCTGGTGGATGGCGTGAACAAGCCGAAACTGTgg > 1:1376504/1‑239 (MQ=255) ggcggtggctgcgaatgcgtgctggcgaccgattatcgtctggcgacgccggatctgcgcatcggtctgccggaaaccaaactgggcatcatgcctggctttggcggttctgtacgtatgccacgtatgctgggcgctgacagtgcgctggaaatcattgccgccggtaaagatgtcggcgcggatcaggccctgaaaatcggtctggtgggtggcgtGAACAAGCCGCAACTGcggg > 2:66509‑M2/219‑237 (MQ=255) cTCGCTCTATAAAAATCATATAGCTACCTTACAAGAACGGACTCGCGATGCGCTGGCGCGCTTCAAGCTGGATGCGTTACTTATTCACTCCGGCGAGCTGTTCAATGTTTTTCTCGACGATCATCCCTATCCGTTTAAAGTGAACCCGCAATTCAAAGCGTGGGTGCCGGTAACTCAGGTGCCAAACTGCTGGTTGCTGGTGGATGGCGTGAACAAGCCGAAACTGTGGTTCTATCTGc < 1:1259827/239‑1 (MQ=255) gCTCTATAAAAATCATATAGCTACCTTACAAGAACGGACTCGCGATGCGCTGGCGCGCTTCAAGCTGGATGCGTTACTTATTCACTCCGGCGAGCTGTTCAATGTTTTTCTCGACGATCATCCCTATCCGTTTAAAGTGAACCCGCAATTCAAAGCGTGGGTGCCGGTAACTCAGGTGCCAAACTGCTGGTTGCTGGTGGATGGCGTGAACAAGCCGAAACTGTGGTTCTATCTGCCgg < 1:355345/239‑1 (MQ=255) ctATAAAAACCATATAGCTACCTTACAAGAACGGACTCGCGATGCGCTGGCGCGCTTCAAGCTGGATGCGTTACTTATTCACTCCGGCGAGCTGTTCAATGTTTTTCTCGACGATCATCCCTATCCGTTTAAAGTGAACCCGCAATTCAAAGCGTGGGTGCCGGTAACTCAGGTGCCAAACTGCTGGTTGCTGGTGGATGGCGTGAACAAGCCGAAACTGTGGTTCTATCTGCCGGTTg < 1:765390/239‑1 (MQ=255) taAAAATCATATAGCTACCTTACAAGAACGGACTCGCGATGCGCTGGCGCGCTTCAAGCTGGATGCGTTACTTATTCACTCCGGCGAGCTGTTCAATGTTTTTCTCGACGATCATCCCTATCCGTTTAAAGTGAACCCGCAATTCAAAGCGTGGGTGCCGGTAACTCAGGTGCCAAACTGCTGGTTGCTGGTGGATGGCGTGAACAAGCCGAAACTGTGGTTCTATCTGCCGGTTGAtt > 2:1298580/1‑239 (MQ=255) cATATAGCTACCTTACAAGAACGGACTCGCGATGCGCTGGCGCGCTTCAAGCTGGATGCGTTACTTATTCACTCCGGCGAGCTGTTCAATGTTTTTCTCGACGATCATCCCTATCCGTTTAAAGTGAACCCGCAATTCAAAGCGTGGGTGCCGGTAACTCAGGTGCCAAACTGCTGGTTGCTGGTGGATGGCGTGAACAAGCCGAAACTGTGGTTCTATCTGCCGGTTGATTACTGGca < 2:532988/239‑1 (MQ=255) atatAGCTACCTTACAAGAACGGACTCGCGATGCGCTGGCGCGCTTCAAGCTGGATGCGTTACTTATTCACTCCGGCGAGCTGTTCAATGTTTTTCTCGACGATCATCCCTATCCGTTTAAAGTGAACCCGCAATTCAAAGCGTGGGTGCCGGTAACTCAGGTGCCAAACTGCTGGTTGCTGGTGGATGGCGTGAACAAGCCGAAACTGTGGTTCTATCTGCCGGTTGATTACTGGcac > 2:1460462/1‑239 (MQ=255) atatAGCTACCTTACAAGAACGGACTCGCGATGCGCTGGCGCGCTTCAAGCTGGATGCGTTACTTATTCACTCCGGCGAGCTGTTCAATGTTTTTCTCGACGATCATCCCTATCCGTTTAAAGTGAACCCGCAATTCAAAGCGTGGGTGCCGGTAACTCAGGTGCCAAACTGCTGGTTGCTGGTGGATGGCGTGAACAAGCCAAAACTGTGGTTCTATCTGCCGGTTGATTACTGGcac > 1:1354310/1‑239 (MQ=255) ataGCTACCTTACAAGAACGGACTCGCGATGCGCTGGCGCGCTTCAAGCTGGATGCGTTACTTATTCACTCCGGCGAGCTGTTCAATGTTTTTCTCGACGATCATCCCTATCCGTTTAAAGTGACCCCGCAATTCAAAGCGTGGTTGCCGGTACCTCAGGTGCCAAACTGCTTGTTGCTGGTGGCTGGCGTGAACAAGCCGATACTGCGGTTCTATCTGCCGGTTGATTACTGGcaca > 2:183043/1‑238 (MQ=255) 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aCCTTACAAGAACGGACTCGCGATGCGCTGGCGCGCTTCAAGCTGGATGCGTTACTTATTCACTCCGGCGAGCTGTTCAATGTTTTTCTCGACGATCATCCCTATCCGTTTAAAGTGAACCCGCAATTCAAAGCGTGGGTGCCGGTAACTCAGGTGCCAAACTGCTGGTTGCTGGTGGATGGCGTGAACAAGCCGAAACTGTGGTTCTATCTGCCGGTTGATTACTGGCACAACGTCGa > 2:1363719/1‑239 (MQ=255) ccTTACAAGAACGGACTCGCGATGCGCTGGCGCGCTTCAAGCTGGATGCGTTACTTATTCACTCCGGCGAGCTGTTCAATGTTTTTCTCGACGATCATCCCTATCCGTTTAAAGTGAACCCGCAATTCAAAGCGTGGGTGCCGGTAACTCAGGTGCCAAACTGCTGGTTGCTGGTGGATGGCGTGAACAAGCCGAAACTGTGGTTCTATCTGCCGGTTGATTACTGGCACAACGTCGa > 1:67039/1‑238 (MQ=255) cTTACAAGAACGGACTCGCGATGCGCTGGCGCGCTTCAAGCTGGATGCGTTACTTATTCACTCCGGCGAGCTGTTCAATGTTTTTCTCGACGATCATCCCTATCCGTTTAAAGTGAACCCGCAATTCAAAGCGTGGGTGCCGGTAACTCAGGTGCCAAACTGCTGGTTGCTGGTGGATGGCGTGAACAAGCCGAAACTGTGGTTCTATCTGCCGGt < 2:844743/216‑1 (MQ=255) cTTACAAGAACGGACTCGCGATGCGCTGGCGCGCTTCAAGCTGGATGCGTTACTTATTCACTCCGGCGAGCTGTTCAATGTTTTTCTCGACGATCATCCCTATCCGTTTAAAGTGAACCCGCAATTCAAAGCGTGGGTGCCGGTAACTCAGGTGCCAAACTGCTGGTTGCTGGTGGATGGCGTGAACAAGCCGAAACTGTGGTTCTATCTGCCGGt > 1:844743/1‑216 (MQ=255) tACAAGAACGGACTCGCGATGCGCTGGCGCGCTTCAAGCTGGATGCGTTACTTATTCACTCCGGCGAGCTGTTCAATGTTTTTCTCGACGATCATCCCTAGCCGTTTAAAGTGAACCCGCAATTCAAAGCGTGGGTGCCGGTAACTCAGGTGCCAAACTGCTGGTTGCTGGTGGATGGCGTGAACAAGCCGAAACTGTGGTTCTATCTGCCGGTTGATTACTGGCACAACGTCGAACCg < 2:103887/239‑1 (MQ=255) cAAGAACGGACTCGCGATGCGCTGGCGCGCTTCAAGCTGGATGCGTTACTTATTCACTCCGGCGAGCTGTTCAATGTTTTTCTCGACGATCATCCCTATCCGTTTAAAGTGAACCCGCAATTCAAAGCGTGGGTGCCGGTAACTCAGGTGCCAAACTGCTGGTTGCTGGTGGATGGCGTGAACAAGCCGAAACTGTGGTTCTATCTGCCGGTTGATTACTGGCACAACGTCGAAcc > 2:1379112/1‑236 (MQ=255) agagCGGCCTCGCGATGCGCTGGCGCGCTTCAAGCTGGATGCGTTACTTATTCACTCCGGCGAGCTGTTCAATGTTTTTCTCGACGATCATCCCTATCCGTTTAACGTGAACCCGCAATTCAATGCGTGGGTGCCGGTAACTCAGGTGCCAAACTGTTGGTTGCTGGTGGAGGGCGTGAACAAGCCGCACCTGTGGTTCTCTCTGCCGGTTGATTACTGGCGCAACGTCGAGCCGATg > 2:326866/1‑238 (MQ=255) 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aCCCGCAATTCAAAGCGTGGGTGCCGGTAACTCAGGTGCCAAACTGCTGGTTGCTGGTGGATGGCGTGAACAAGCCGAAACTGTGGTTCTATCTGCCGGTTGATTACTGGCACAACGTCGAACCGCTGCCGACCTCTTTCTGGACTGAAGATGTGGAAGTGATCGCGCTGCCGAAAGCCGATGGCATTGGTAGCCTGCTGCCTGCTGCGCGCGGCGat < 1:40782/218‑1 (MQ=255) aCCCGCAATTCAAAGCGTGGGTGCCGGTAACTCAGGTGCCAAACTGCTGGTTGCTGGTGGATGGCGTGAACAAGCCGAAACTGTGGTTCTATCTGCCGGTTGATTACTGGCACAACGTCGAACCGCTGCCGACCTCTTTCTGGACTGAAGATGTGGAAGTGATCGCGCTGCCGAAAGCCGATGGCATTGGTAGCCTGCTGCCTGCTGCGCGCGGCGat > 2:40782/1‑218 (MQ=255) aCCCGCAATTCAAAGCGTGGGTGCCGGTAACTCAGGTGCCAAACTGCTGGTTGCTGGTGGATGGCGTGAACAAGCCGAAACTGTGGTTCTATCTGCCGGTTGATTACTGGCACAACGTCGAACCGCTGCCGACCTCTTTCTGGACTGAAGATGTGGAAGTGATCGCGCTGCCGAAAGCCGATGGCATTGGTAGCCTGCTGCCTGCTGCGCGCGGCAATATCGGTTATATCGGTCCGGt > 1:1514914/1‑238 (MQ=255) aCCCGCAATTCAAAGCGTGGGTGCCGGTAACTCAGGTGCCAAACTGCTGGTTGCTGGTGGATGGCGTGAACAAGCCGAAACTGTGGTTCTATCTGCCGGTTGATTACTGGCACAACGTCGAACCGCTGCCGACCTCTTTCTGGACTGAAGATGTGGAAGTGATCGCGCTGCCGAAAGCCGATGGCATTGGTAGCCTGCTGCCTGCGGCGCGCGGCCATATCGGTTATATCGGTCCGGt > 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gTGCCGGTAACTCAGGTGCCAAACTGCTGGTTGCTGGTGGATGGCGTGAACAAGCCGAAACTGTGGTTCTATCTGCCGGTTGATTACTGGCACAACGTCGAACCGCTGCCGACCTCTTTCTGGACTGAAGATGTGGAAGTGATCGCGCTGCCGAAAGCCGATGGCATTGGTAGCCTGCTGCCTGCTGCGCGCGGCAATATCGGTTATATCGGTCCGGTGCCGGAACGTGCGCTGCAAc < 1:395489/238‑1 (MQ=255) tGCCGGTAACTCAGGTGCCAAACTGCTGGTTGCTGGTGGATGGCGTGAACAAGCCGAAACTGTGGTTCTATCTGCCGGTTGATTACTGGCACAACGTCGAACCGCTGCCGACCTCTTTCTGGACTGAAGATGTGGAAGTGATCGCGCTGCCGAAAGCCGATGGCATTGGTAGCCTGCTGCCTGCTGCGCGCGGCAATATCGGTTATATCGGTCCGGTGCCGGAACGTGCGCTGCAACt < 1:834957/238‑1 (MQ=255) ggCCGGGAACCCAGGGGCCAAACTGCTGGTTGCTGGTGGATGGCGTGAACAAGCCGAAACTGTGGTTCTATCTGCCGGTTGATTACTGGCACAACGTCGAACCGCTGCCGACCTCTTTCTGGACTGAAGATGTGGAAGTGATCGCGCTGCCGAAAGCCGATGGCATTGGTAGCCTGCTGCCTGCTGCGCGCGGCAATATCGGTTATATCGGTCCGGTGCCGGAACGTGCGCTGCAACt < 2:834571/237‑1 (MQ=255) 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ggttgctggtGGATGGCGTGAACAAGCCGAAACTGTGGTTCTATCTGCCGGTTGATTACTGGCACAACGTCGAACCGCTGCCGACCTCTTTCTGGACTGAAGATGTGGAAGTGATCGCGCTGCCGAAAGCCGATGGCATTGGTAGCCTGCTGCCTGCTGCGCGCGGCAATATCGGTTATATCGGTCCGGTGCCGGAACGTGCGCTGCAACTGGGTATTGAGGCCAGCAACATCAACCCg < 1:666514/239‑1 (MQ=255) tgctggtGGATGGCGTGAACAAGCCGAAACTGTGGTTCTATCTGCCGGTTGATTACTGGCACAACGTCGAACCGCTGCCGACCTCTTTCTGGACTGAAGATGTGGAAGTGATCGCGCTGCCGAAAGCCGATGGCATTGGTAGCCTGCTGCCTGCTGCGCGCGGCAATATCGGTTATATCGGTCCGGTGCCGGAACGTGCGCTGCAACTGGGTATTGAGGCCAGCAACATCAACCCGaaa < 1:1460462/239‑1 (MQ=255) tgctgggtgatggcgtGAACAAGCCGAAACTGTGGTTCTATCTGCCGGTTGATTACTGGCACAACGTCGAACCGCTGCCGACCTCTTTCTGGACTGAAGATGTGGAAGTGATCGCGCTGCCGAAAGCCGATGGCATTGGTAGCCTGCTGCCTGCTGCGCGCGGCAATATCGGTTATATCGGTCCGGTGCCGGAACGTGCGCTGCAACTGGGTATTGAGGCCAGCAACATCAACCCGaa < 2:1376504‑M2/222‑1 (MQ=255) 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AAGGGTAAAAAATGGAATCACTGGCCTCGCTCTATAAAAATCATATAGCTACCTTACAAGAACGGACTCGCGATGCGCTGGCGCGCTTCAAGCTGGATGCGTTACTTATTCACTCCGGCGAGCTGTTCAATGTTTTTCTCGACGATCATCCCTATCCGTTTAAAGTGAACCCGCAATTCAAAGCGTGGGTGCCGGTAACTCAGGTGCCAAACTGCTGGTTGCTGGTGGATGGCGTGAACAAGCCGAAACTGTGGTTCTATCTGCCGGTTGATTACTGGCACAACGTCGAACCGCTGCCGACCTCTTTCTGGACTGAAGATGTGGAAGTGATCGCGCTGCCGAAAGCCGATGGCATTGGTAGCCTGCTGCCTGCTGCGCGCGGCAATATCGGTTATATCGGTCCGGTGCCGGAACGTGCGCTGCAACTGGGTATTGAGGCCAGCAACATCAACCCGAAAGGGGTTATCGACTACC > NC_000913/4031149‑4031622 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |