| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,228,308 | 0 | G | C | 12.9% | 215.5 / 3.7 | 104 | pseudogene (300/1287 nt) | mdtQ | pseudogene, putative channel/filament proteins |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (40/47); new base C (4/11); total (46/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.59e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
AGAAGTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCT‑ACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGTTTGCTCGCGTTCCGCCGCCCGT‑GCTTTAACCGTACCCAGGCGGGCA‑GTAACCTCCGCCCGATTCTTTC‑CCCAG‑ATATCGAGATGCCAGCCCGCCGTTAAGCCAAAAGTACCGTTGGTGTACCACGGGCCGGTCGTACCTGCGGCCGGATCGTTCAGA‑GC‑AAACGGCCCCATTAAGCCTTCTGCCGACATTTTTTGCCGCTCCATATCCGCCGAAAAGTCGATCTGCGGACCATCCTGAGTGGCAACTGCCTTCGCCTGGGCTTCAGCTAGCTGAATGCGCTGTTCAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTG > NC_000913/2228071‑2228542 | agaagTAATCCCGTTCTGATATAGCTGGCGATCGGTCGCGATAATGGTGTTCTGCTCTTTTTCTATTTGCTGCAAGACCGTGTTTAACGCCGCCTGGGTTTGCCACTCCCAGTACAGGCGGGCT‑ACGCTGCCAGCCAGCAATTGGCGGGGTTGCTCGCGTTCCCCCCCCCCG‑GGTTTAACCGTACCCCGGCGGGGC‑GTAACCTCCGCCCGATTCTTTC‑CCCCC‑ATATCGCGATGCCAg > 1:825542/1‑238 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |