| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 2,244,137 | T→G | 15.0% | V77G (GTG→GGG) | yeiG → | S‑formylglutathione hydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,244,137 | 0 | T | G | 15.0% | 240.2 / 2.8 | 108 | V77G (GTG→GGG) | yeiG | S‑formylglutathione hydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (48/40); new base G (10/10); total (58/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.06e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
AGCCACGCATGGAAATGCTCGAAGAGCACCGCTGTTTTGAAGGCTGGCAGCAACGCTGGCGACACGACTCCAGTACCTTAAACTGCCCGATGACGTTCAGTATCTTTCTCCCTCCACCTCGTGATCACACTCCGCCACCAGTGCTGTACTGGCTTTCCGGATTAACCTGCAATGACGAGAACTT‑‑CACCACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGC‑GGAACTGGGG‑ATTGTACTGGTGATGCCAGACACCAGCCCGCGCGGCGAAAAGGTT‑GCCAACGACGATGGCTACGATTTAGG‑CCA‑GGGCGCAGGCTTTTATCTTAATGCCACGCAACCGCCGTGGGCGACGCATTACCGGATGTATGATTATCTGCGC‑GATGAATTACCGGCGCTGGTTCAGTCGCAATTTAATGTCAGCGACCGCTGCGCCATTAGCGGTCACTCAATGGGTGGTCACGGTGCGCTGATTATG > NC_000913/2243900‑2244369 | aGCCACGCATGGAAATGCTCGAAGAGCACCGCTGTTTTGAAGGCTGGCAGCAACGCTGGCGACACGACTCCAGTACCTTAAACTGCCCGATGACGTTCAGTATCTTTCTCCCTCCACCTCGTGATCACACTCCGCCACCAGTGCTGTACTGGCTTTCCGGATTAACCTGCAATGACGAGAACTT‑‑CACCACCAAGGCGGGTGCCCAGCGGGTAGCGGC‑GGAACTGGGG‑ATTGTACTGGTg > 1:572687/1‑239 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |