| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,675,488 | T→G | 17.7% | V235G (GTG→GGG) | yhjE → | putative MFS transporter, membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,675,488 | 0 | T | G | 17.7% | 369.5 / 12.4 | 139 | V235G (GTG→GGG) | yhjE | putative MFS transporter, membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/76); new base G (26/2); total (61/78) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.08e-09 | |||||||||||
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Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
CCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTATCGGCCTGTATG‑TTCGCGTG‑TCG‑CTGCA‑TGAGTCGCC‑GGTG‑TT‑T‑GAGAAAGTCGCTAAAGC‑GAAAAAACAGGTGAAGATCCCGCTGGGTACGCTGCTGACCAAACATGTTCGCGTAACCGTACTGGGTACGTTCATTATGCTGGCAACCTATACGCTGTTTTACATCATGACGGTCTACTCTATGACCTTTAGTACCGCCGCCGCGCCAGTTGGGCTTGGCCTGCCGCGTAACGAAGTGTTGTGGATGTTGATGATGGCAGTTATTGGTTTTGGCGTGATGGTGCCAGTCGCTGGATTAC > NC_000913/3675250‑3675715 | ccGCGCAAACGTTCAGTGTCTGTCTCCGTTCGGCAGCTGTGCGCACCGTTTGTCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTGTCGTGCTGTTTTCCTTGCTGCTAACGGGCGAGCGGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTGTCTTGCCGGCGGTGCTGGTCATTATCGGCCTGTATG‑TTCGCGTG‑TCG‑CTGCA‑TGAGGCGCC‑GGTG‑TT‑T‑GAGAAAGGCGCTAAAGC‑GAAAAAACAGGt < 2:530367/239‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |