| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2240539 | 150 (0.950) | 3 (0.020) | 3/426 | NT | 2.0% | intergenic (‑193/+87) | mglB/galS | methyl‑galactoside transporter subunit/galactose‑ and fucose‑inducible galactose regulon transcriptional isorepressor, mgl operon transcriptional repressor, autorepressor |
| ? | NC_000913 | = 2240544 | 147 (0.940) | intergenic (‑198/+82) | mglB/galS | methyl‑galactoside transporter subunit/galactose‑ and fucose‑inducible galactose regulon transcriptional isorepressor, mgl operon transcriptional repressor, autorepressor | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
CATGCTGGCCATCACAGCAGACAGGGTTAACACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTAAAACGGTGCAATCATAGCTATCACATTGTTAAGATACTGTGAAATCACTCACAGATTGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGCCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAAT > NC_000913/2240302‑2240776 | tGGCCATCACAGCAGACAGGGTTAACACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACAt > 1:1032577/1‑238 (MQ=255) tGGCCATCACAGCAGACAGGGTTAACACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACAt > 2:907315/1‑238 (MQ=255) tGGCCATCACAGCAGACAGGGTTAACACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACAt < 1:221477/238‑1 (MQ=255) cacaGCAGACAGGGTTAACACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGtt > 1:889134/1‑238 (MQ=255) acaGCAGTTAGGGTTAGCACCTGATTATTCATGGTATCTTCTGTTTTTCTTATGCACGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCTTCGGGTCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTTACGTTTTAAATATCGTTCTTTCATGCACGGTAACGCTCCAGAAATCGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTCCCTCGGGAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTAc < 1:636389/239‑1 (MQ=255) acaGCAGACAGGGTTAACACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTAc < 1:562276/239‑1 (MQ=255) acaGCAGACAGGGTTAACACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTAc < 2:1731961/239‑1 (MQ=255) acaGCAGACAGGGTTAACACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTAc < 2:236302/239‑1 (MQ=255) acaGCAGACAGGGTTAACACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTAc < 2:372291/239‑1 (MQ=255) gTTAACTCCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTaaaa < 1:1043889/237‑1 (MQ=255) gTTAACACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTaaaa < 1:1523783/237‑1 (MQ=255) gTTAACACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTaa < 2:52683/235‑1 (MQ=255) tAACACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTAAAACGGt < 1:1255270/239‑1 (MQ=255) aaCACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTAAAACGGTg < 1:1536701/239‑1 (MQ=255) aaCACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTAAAACGGTg < 1:1032521/239‑1 (MQ=255) aaCACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTAAAACGGTg < 2:493901/239‑1 (MQ=255) aaCACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTAAAACGGTg < 2:657642/239‑1 (MQ=255) cttcttATTCAGGGTATCTCCTGTTTTTATTATGCAGGGTAGTGTTTGAGATGAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGATCTCTTTCTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAACTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTGCAACGTTAAATCGGTGCAATc < 1:546214/239‑1 (MQ=255) ttcttATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACaa > 1:896141/1‑220 (MQ=255) ttcttATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTAAAACGGTGCAATCa > 2:476926/1‑239 (MQ=255) ttcttATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTAAAACGGTGCAATCa > 1:137866/1‑239 (MQ=255) ttcttATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTAAAACGGTGCAATCa > 1:351461/1‑239 (MQ=255) tcttATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTAAAACGGTGCAATCAt > 2:656812/1‑239 (MQ=255) tcttAGTCAGGGTCTCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGGGCTTGAGATAAAGGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGGAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACCCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTGACATACGGGTTACAACGTTAAAACGGTGCAATCAt < 1:692963/239‑1 (MQ=255) cttATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTAAAACGGTGCAATCATa > 2:677600/1‑239 (MQ=255) 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tATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTAAAACGGTGCAATCATAGCTATCACAt < 2:1640275/238‑1 (MQ=255) tATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTAAAACGGTGCAATCATAGCTATCACAt < 2:1287127/238‑1 (MQ=255) tATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTAAAACGGTGCAATCATAGCTATCACAt < 2:904200/238‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |