Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,731,688 | 0 | C | A | 12.8% | 489.0 / 8.7 | 173 | Q187K (CAA→AAA) | xylF | D‑xylose transporter subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (80/66); new base A (2/23); total (82/91) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.93e-06 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.07e-01 |
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
TAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGACCAATG‑G‑GTTGATGGCTGGTTACCGGAAAA‑CGCA‑TTGAAAATTATGGAAAAC‑GCGCTAACCGCCAATAATAACAAAATTGATGCTGTAGTTGCCTCAAACGATGCCACCGCAGGTGGGGCAATTCAGGCATTAAGCGCGCAAGGTTTATCAGGGAAAGTAGCAATCTCCGGCCAGGATGCGGATCTCGCAGGTATTAAACGTATTGCTGCCGGTACGCAAACTATGACGGTGTATA > NC_000913/3731450‑3731922 | tAAAGTATTAGCTTACGACCGTATGATTAACGATGCGGATATCGATTTTTATATTTCTTTCGATAACGAAAAAGTCGGTGAACTGCAGGCAAAAGCCCTGGTCGATATTGTTCCGCAAGGTAATTACTTCCTGATGGGCGGCTCGCCGGTAGATAACAACGCCAAGCTGTTCCG‑CGCCGGACAAATGAAAGTGTTAAAACCTT‑ACGTTGATT‑CCG‑GAAAAATTAAA‑GTCGTTGGTGAcc > 2:63893/1‑239 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |