| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 433,649 | 0 | T | G | 15.2% | 234.9 / 7.8 | 147 | G65G (GGT→GGG) | ribD | fused diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase and 5‑amino‑6‑(5‑phosphoribosylamino) uracil reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (45/71); new base G (22/3); total (72/75) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.63e-06 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.57e-01 | |||||||||||
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
AAGAATTTGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAAGATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAACGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGTGAAAAAGCCAAAGGTGCGACCGCCTATGTCACACTCGAACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCG‑CTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAATTGAATAAAGGCTTTCTCAAGCGGATGCG > NC_000913/433414‑433882 | aaGAATTTGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAAGATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAACGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGTGAAAAAGCCAAAGGTGCg < 2:1328924/239‑1 (MQ=255) aaTTTGGCGAAGGGACCGCGGCCCGGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAAGAGGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAACGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGTGAAAAAGCCAAAGGTGCGAcc < 1:221893/239‑1 (MQ=255) tttGGCGAAGGGAGCGCGCGCGTGGAGGACTAAGCCGTGAAGGACGAGTATTACATGCCGCGGGCGGTAAACCGGCCGCACCGAGGAGTTTTTACCACGCTTCCCACCCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAAGAGGGCGAAATTGTCGGTGAAGTTTACCTCCAGCGGGCGGGTGACCCACATGCCGAAGTCCCCGCTTTGCGTATTGCGGGTGAAAAAGCCAAAGGTGCGACCGc < 1:1289335/239‑1 (MQ=255) tgggCGAAAAGATCGGCCGCCTGGAGGACAAGGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCAAAAGCTGGCACAACGAGGACGTTTTACCCCGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAAGAGGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCCCCACCGTGCGGGTGACCCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGTGAAAAAGCCAAAGGTGCGACCGcc < 1:618901/237‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |