Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 433,649 | T→G | 15.2% | G65G (GGT→GGG) | ribD → | fused diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase and 5‑amino‑6‑(5‑phosphoribosylamino) uracil reductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 433,649 | 0 | T | G | 15.2% | 234.9 / 7.8 | 147 | G65G (GGT→GGG) | ribD | fused diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase and 5‑amino‑6‑(5‑phosphoribosylamino) uracil reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (45/71); new base G (22/3); total (72/75) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.63e-06 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.57e-01 |
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
AAGAATTTGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAAGATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAACGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGTGAAAAAGCCAAAGGTGCGACCGCCTATGTCACACTCGAACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCG‑CTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAATTGAATAAAGGCTTTCTCAAGCGGATGCG > NC_000913/433414‑433882 | aaGAATTTGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAAGATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAACGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGTGAAAAAGCCAAAGGTGCg < 2:1328924/239‑1 (MQ=255) aaTTTGGCGAAGGGACCGCGGCCCGGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAAGAGGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAACGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGTGAAAAAGCCAAAGGTGCGAcc < 1:221893/239‑1 (MQ=255) tttGGCGAAGGGAGCGCGCGCGTGGAGGACTAAGCCGTGAAGGACGAGTATTACATGCCGCGGGCGGTAAACCGGCCGCACCGAGGAGTTTTTACCACGCTTCCCACCCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAAGAGGGCGAAATTGTCGGTGAAGTTTACCTCCAGCGGGCGGGTGACCCACATGCCGAAGTCCCCGCTTTGCGTATTGCGGGTGAAAAAGCCAAAGGTGCGACCGc < 1:1289335/239‑1 (MQ=255) tgggCGAAAAGATCGGCCGCCTGGAGGACAAGGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCAAAAGCTGGCACAACGAGGACGTTTTACCCCGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAAGAGGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCCCCACCGTGCGGGTGACCCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGTGAAAAAGCCAAAGGTGCGACCGcc < 1:618901/237‑1 (MQ=255) tGGGGAAGAGATCCGGCGCCTGGAGGGCGAAGCCGTGCAGGACGATTTTTACAGGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTCCCACGCATCCCACCCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTAAAAGAGGGCGAAATTGTCGGTAAAGGTTACCACCAGCGTGCGGGTGACCCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGTGAAAAAGCCAAAGGGGCGACCGCCt < 1:1658065/239‑1 (MQ=255) tGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAAGATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAACGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGTGGAAAACCCAAAGGGGAGACCGcc > 2:49045/1‑238 (MQ=255) aaGAGATCGCGCGCCTGGGGGCCGAAGCCGTCCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGTTAAAGCTGGCGCACAGAGGACGTTTTCCCCCGCATCCCAACCCGAATGCCGGGGGCGTCATTGTCAAAGATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAACGTGCGGGTGAACCACATGCGGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGTGAAAAAGCCAAAGGTGCGACCGCCTATGt < 1:49045/238‑1 (MQ=255) gcgcgcCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCCCGCATCCCACCCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAAGATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAACGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGTGAAAAAGCCAAAGGTGCGACCGCCTATGTCACACTCg < 2:688045/238‑1 (MQ=255) tGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAAGATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAACGTGCGGGTGAACAACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGGTAGAAAGCCCAAGGGGGGCCCGCCCATGTCccaccccgaccacgt > 1:606733/1‑228 (MQ=255) gaggaCAAGGCCGTGCAGGGCAAGTATTACAGGGCGCGGGCGCAAAAGCGGGCGCAACGAGAACGTTGTACCACGCATCCCACCCCAAGAGTGGGGCGCGTAATTGTGAAAGATGGCGAAATGGTTGGTGAGGGTTACCACCAACGGTGGGGTGACCCACAGGCCAAAGTACCCGCGTTGCGTATGGCGGGTGAAAAAGCCAAGGGTGCGACCGCCTATGTCACACTCGAACCCTGTa < 1:1101883/238‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |