| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 4,228,163 | A→G | 14.4% | E145G (GAG→GGG) | yjbB → | putative Na+/Pi‑cotransporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,228,163 | 0 | A | G | 14.4% | 348.6 / 8.9 | 134 | E145G (GAG→GGG) | yjbB | putative Na+/Pi‑cotransporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (44/67); new base G (19/2); total (65/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.84e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
ACCTCGTTTGTCGCTCAGGATCTGGTAGCCCTCGCACCGGCTCTGGTCATTGTGCTGGGTGCAGATGTCGGGACGGCGCTAATGGCGCGTATTCTCACCTTCGACTTATCCTGGCTGTCACCGTTACTTATTTTTATCGGCGTGATTTTTTTCCTCGGACGCAAACAGTCACGCGCCGGGCAACTGGGCCGCGTCGGTATTGGTCTTGGGCTGATTTTGCTAGCGCTGGAGTT‑GATTGTGCAGGCCGT‑AACGCCGATCACCCAGGCAAACGGCGTTCAGGTGATCTTTGCCT‑CGCTGACCGGCGATATTCTGCTGGATGCGCTGATTGGCGCGATGTTCGCCATTATCAGCTACTCCAGCCTTGCTGCTGTACTGCTGACCGCGACTCTGACCGCCGCAGGCATTATCTCCTTCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCT > NC_000913/4227934‑4228394 | aCCTCGTTTGTCGCTCAGGATCTGGTAGCCCTCGCACCGGCTCTGGTCATTGTGCTGGGTGCAGATGTCGGGACGGCGCTAATGGCGCGTATTCTCACCTTCGACTTATCCTGGCTGTCACCGTTACTTATTTTTATCGGCGTGATTTTTTTTCTCGGACGCCAACAGTCACGCGCCGGGCAACTGGGCCCCGTCGGTATTGGGCTTGGGTCGTGTTTTCTAGCGCTGGGGTT‑GGTtgt > 1:1216788/1‑239 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |