| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 1,798,500 | T→G | 10.8% | H148P (CAC→CCC) | pheS ← | phenylalanine tRNA synthetase, alpha subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,798,500 | 0 | T | G | 10.8% | 342.2 / 5.2 | 131 | H148P (CAC→CCC) | pheS | phenylalanine tRNA synthetase, alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (58/54); new base G (16/3); total (74/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.11e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
GTGCCTTTCAGGTTGGTAAAGC‑TGATGTTGGTATCAACAATCAGACCTTCCATCTGATGGAACATCGGCGTGTGAGTCTGGTCGTAGTCGTTACGATAAACACGGCCAGGCGCGATGATACGAATCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATCTGTACGCCAGAGGTCTGGGTACGCAGCAGGCGGGTAGTGTCAAACCAGAAAGT‑GTCGTGGTCAGCGCGCGCCGGGTGGTGACCAGGAATGTTCAGAG‑CATCGAAGTTATGATAATCGTCTTCGATTTCCGGCCCGGTTGCCACGGTAAAGCCAAGCTCACCGAAGAAACTTTCGATACGGTCGATGGTACGGGTAACCGGATGCAGACCGCCGTTTTCAATGCGACGACCTGGCAGAGAGACATCAATCGTTTCCGCCGCCAGACGCGCATTCAGTGCAGCGCTTTCCAGTTCCGCTTTACGCGCAT > NC_000913/1798266‑1798728 | gtgccttgtgagTTGGGAAAGCGGGAGGTTGG‑ATCATCAATGTGGCCTTCCATCTGATGGAACAGCGGCGTGTGAGTCTGCTCGTAGTCGTTACGATAAACACAGCCCGGCTCGATGATACGAAGCGGTGGCTGCTGGGCTTTCATGGTGCGGATGTGTACGCCAGATGTCTTGGTGCGCAGTAGGCGGGTAGTGTCAAAGCAGAAAGT‑GTCGTGGTCAGCGCGCGCCTGgtggtgtc < 1:463277/227‑3 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |