| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 2514275 = | NA (NA) | 23 (0.210) | 22/432 | NT | 25.0% | intergenic (+33/‑54) | nupC/insL1 | nucleoside (except guanosine) transporter/IS186 transposase |
| ? | NC_000913 | = 2536318 | 70 (0.620) | coding (487/510 nt) | crr | glucose‑specific enzyme IIA component of PTS | |||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
TCTCTCCGCGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGT‑‑GAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTC > NC_000913/2514043‑2514508 | tctctcCGCGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGT‑‑GAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAgcg < 2:375900/239‑1 (MQ=255) 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tctcCGCGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGT‑‑GAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCt < 1:295986/239‑1 (MQ=255) tctcCGCGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGT‑‑GAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCt < 2:553958/239‑1 (MQ=255) tctcCGCGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACAGCTCTACCCTGGT‑‑GAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCt < 1:499508/239‑1 (MQ=255) 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> NC_000913/2514043‑2514508 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |