| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3808072 | 101 (0.890) | 3 (0.030) | 3/430 | NT | 3.0% | coding (26/1035 nt) | waaQ | lipopolysaccharide core biosynthesis protein |
| ? | NC_000913 | = 3808073 | 97 (0.870) | coding (25/1035 nt) | waaQ | lipopolysaccharide core biosynthesis protein | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
ACCATCCACTGATCCGTAAGATTAATGACCAGGTCATAATTATTCGCACGCAGAGTTTTTATCAACGAAAGCACATTTTTAATTTTATCGAAAGTTCCCGCACCTTTATTGCTTATCCCATAGAGCGCATTAATTTCCGGGTTTTCAGACAAAATAGGGATGGTGTCCTGATAAAGCAGCATATCGATTTTTGCATCAGGATAATTCTGCTTGAGCGTACTGATGACAGGAGTAGTTAATAACATATCCCCATGATATCGCATCTTTATGACCAGGATTTTTCGAAATGGCTTTTCCACTAGCGACTCTTTTGTGTGATTGTCTGGTTAAGTTAAGCAGAAAAAAGCACGCTACCGCCCCAGGCTCAACAGCTACCTGAATACTGATAACGCACTTACTTTGACGTGCTAGTGTATCATTTCTTTCGCAGCAATCCGACCCGAATGATTTTTATACACAAAATATACTTTAAT > NC_000913/3807835‑3808307 | accaTCCACTGATCCGTAAGATTAATGACCAGGTCATAATTATTCGCACGCAGAGTTTTTATCAACGAAAGCACATTTTTAATTTTATCGAAAGTTCCCGCACCTTTATTGCTTATCCCATAGAGCGCATTAATTTCCGGGTTTTCAGACAAAATAGGGATGGTGTCCTGATAAAGCAGCATATCGATTTTTGCATCAGGATAATTCTGCTTGAGCGTACTGATGACAGGAGTAGTtaa < 2:112418/239‑1 (MQ=255) 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ACCATCCACTGATCCGTAAGATTAATGACCAGGTCATAATTATTCGCACGCAGAGTTTTTATCAACGAAAGCACATTTTTAATTTTATCGAAAGTTCCCGCACCTTTATTGCTTATCCCATAGAGCGCATTAATTTCCGGGTTTTCAGACAAAATAGGGATGGTGTCCTGATAAAGCAGCATATCGATTTTTGCATCAGGATAATTCTGCTTGAGCGTACTGATGACAGGAGTAGTTAATAACATATCCCCATGATATCGCATCTTTATGACCAGGATTTTTCGAAATGGCTTTTCCACTAGCGACTCTTTTGTGTGATTGTCTGGTTAAGTTAAGCAGAAAAAAGCACGCTACCGCCCCAGGCTCAACAGCTACCTGAATACTGATAACGCACTTACTTTGACGTGCTAGTGTATCATTTCTTTCGCAGCAATCCGACCCGAATGATTTTTATACACAAAATATACTTTAAT > NC_000913/3807835‑3808307 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |