New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 4162514 | 129 (1.140) | 3 (0.030) | 3/426 | NT | 2.2% | coding (756/1101 nt) | trmA | tRNA m(5)U54 methyltransferase, SAM‑dependent, tmRNA m(5)U341 methyltransferase |
? | NC_000913 | = 4162525 | 136 (1.240) | coding (745/1101 nt) | trmA | tRNA m(5)U54 methyltransferase, SAM‑dependent, tmRNA m(5)U341 methyltransferase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
TCTTGCATAACGTTTCCGGGTTACAGGAGATGTACAAAATACGCGGATACGCCTGCACCATTTTCTCGGTTTCACTGTCCAGACCGCTGCGCGGAGGGTCGACAAAAATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCACACCATTCATCGCCTGAGTAAATTCTTCTG‑CCGCCATACGAATAATTTGTACGTTATCAATAT‑GGTTAGCTGCGATGTTGTATTGCGCAGCAGCAACCGACGGCTTAGCGATTTCGGTGGCTAATACCCGATCAAAATTACGCGCCAGCGCTAATGAAAAGTTACCGTTGCCGCAGTACAGCTCCAGTAAATCGCCTTTTGAGCCTTTGGTTACGTCCAGCGCCCATTCCAGCATCTGAATATTCATCGCCGCGTTCGGCTGGGTAAAGCTGTTTTCTACCTGACGGTAGATCATCTCTTTCCCTGCGAC > NC_000913/4162276‑4162750 | tcctggataacgtTTCCGTGTTACAGGAGATGTACAAAAGACGCGGCTACGCCTGCACCATTTTCTCTGTTTCACTGTCCAGACCGCTGCGCGTAGGGTCGACAAAAATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCACACCATTCATCGCCTGAGTAAATTCTTCTG‑CCGCCATACGAATAATTTGTACGTTATCAATAT‑GGTTAGCTGCG < 1:780213‑M1/233‑1 (MQ=255) tCTTGCATAACGTTTCCGGGTTACAGGAGATGTACAAAATACGCGGATACGCCTGCCCCATTTTCTCGGTTTCACTGTCCAGACCGCTGCGCGGAGGGTCGACAAAAATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCACACCATTCATCGCCTGAGTAAATTCTTCTG‑CCGCCATACGAATAATTTGTACGTTATCAATAT‑GGTTAGCTGCG < 1:42020‑M1/239‑1 (MQ=255) tCTTGCATAACGTTTCCGGGTTACAGGAGATGTACAAAATACGCGGATACGCCTGCACCATTTTCTCGGTTTCACTGTCCAGACCGCTGCGCGGAGGGTCGACAAAAATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCACACCATTCATCGCCTGAGTAAATTCTTCTG‑CCGCCATACGAATAATTTGTACGTTATCAATAT‑GGTTAGCTGCG < 2:737490‑M1/239‑1 (MQ=255) ttcATAACGTTTCCGGGTTACAGGAGATGTGCAAAATACGCGGATACGGCTGCACCATTTTCTCGGTTTCACTGTCCAGACCGCTGCGCGGAGGGTCGACAAAAATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCACACCATTCATCGCCTGAGTAAATTCTTCTG‑CCGCCATACGAATAATTTGTACGTTATCAATAT‑GGTTAGCTGCGAtg < 2:652232/237‑1 (MQ=255) cGTTTCCGGGTTACAGGAGATGTACAAAATACGCGGATACGCCTGCACCATTTTCTCGGTTTCACTGTCCAGACCGCTGCGCGGAGGGTCGACAAAAATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCACACCATTCATCGCCTGAGTAAATTCTTCTT‑CCGCCATACGAATAATTTGTACGTTATCAATAT‑GGTTAGCTGCGCTGTTGTAtt > 2:132088/1‑239 (MQ=255) tCCGGGTTACAGGAGATGTACAAAATACGCGGATACGCCTGCACCATTTTCTCGGTTTCACTGTCCAGACCGCTGCGCGGAGGGTCGACAAAAATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCACACCATTCATCGCCTGAGTAAATTCTTTTG‑CCGCCATACGAATAATTTTTACGTTATCAATAT‑GGTTAGCTGCGATGTTGTATTGcg < 2:1220132‑M2/238‑3 (MQ=255) tGTACAAAATACGCGGATACGCCTGCACCATTTTCTCGGTTTCACTGTCCAGACCGCTGCGCGGAGGGTCGACAAAAATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAAACAGCGCACACCCTTTCTCGCCTGAGTAAAATCTTCTG‑CCCCCATACGAAATATTTGTTCGTTATCAAAAT‑GGTTGGCTTCGCTGTTTTTTTgtgcccccagcaaccaccg > 1:642527/1‑223 (MQ=255) 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TCTTGCATAACGTTTCCGGGTTACAGGAGATGTACAAAATACGCGGATACGCCTGCACCATTTTCTCGGTTTCACTGTCCAGACCGCTGCGCGGAGGGTCGACAAAAATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCACACCATTCATCGCCTGAGTAAATTCTTCTG‑CCGCCATACGAATAATTTGTACGTTATCAATAT‑GGTTAGCTGCGATGTTGTATTGCGCAGCAGCAACCGACGGCTTAGCGATTTCGGTGGCTAATACCCGATCAAAATTACGCGCCAGCGCTAATGAAAAGTTACCGTTGCCGCAGTACAGCTCCAGTAAATCGCCTTTTGAGCCTTTGGTTACGTCCAGCGCCCATTCCAGCATCTGAATATTCATCGCCGCGTTCGGCTGGGTAAAGCTGTTTTCTACCTGACGGTAGATCATCTCTTTCCCTGCGAC > NC_000913/4162276‑4162750 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |