| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 1,258,996 | T→G | 20.8% | V69G (GTG→GGG) | ychH → | DUF2583 family putative inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,258,996 | 0 | T | G | 20.8% | 135.8 / 3.8 | 80 | V69G (GTG→GGG) | ychH | DUF2583 family putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (27/32); new base G (16/3); total (45/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.67e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGTTACAACCCAGAAAGTTCCGGAGGTGACATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑CGCCGCGCGACGATTCGGGAAGAAC‑GCCAGGCGTCCCGGGATCGGTTGAATGCCAGCGCGAGCCATAGTGCGCAGTGGCTGGAATTCCACGT > NC_000913/1258759‑1259230 | tGTTACAACCCAGAAAGTTCCGGAGGTGACATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGgtg > 2:534794/1‑239 (MQ=255) 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TGTTACAACCCAGAAAGTTCCGGAGGTGACATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑CGCCGCGCGACGATTCGGGAAGAAC‑GCCAGGCGTCCCGGGATCGGTTGAATGCCAGCGCGAGCCATAGTGCGCAGTGGCTGGAATTCCACGT > NC_000913/1258759‑1259230 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |