Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,206,436 | G→A | 19.8% | intergenic (‑182/‑25) | ttdR ← / → ttdA | transcriptional activator of ttdABT/L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,206,436 | 0 | G | A | 19.8% | 243.3 / 20.7 | 122 | intergenic (‑182/‑25) | ttdR/ttdA | transcriptional activator of ttdABT/L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (24/71); new base A (12/13); total (38/84) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.76e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
AACGATTTCTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGT > NC_000913/3206201‑3206673 | aaCGATTTCTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACa < 1:450241/239‑1 (MQ=255) tttCTACCAGTGCCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTACCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACGGTTAATTACAAATTCACGGTCGCAAAAAATATAAAACCACATGTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑Ac < 1:19926/239‑1 (MQ=255) aCCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACaaaaa < 2:204919/239‑1 (MQ=255) tACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTTC‑TGACAAAT‑AAAAAAAcatga > 2:1150314/1‑235 (MQ=255) tACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTTC‑AAACAAAA‑ACAAAAAAT‑GGa > 2:1210753/1‑239 (MQ=255) gccTTCAAGTTTTTGGCTAAAGGCCATCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCTCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAg < 1:1129662/238‑1 (MQ=255) aCCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAg < 1:1146938/239‑1 (MQ=255) gCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGc < 2:402123/239‑1 (MQ=255) tCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCatg < 1:68778/238‑1 (MQ=255) tGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑g < 1:502759/239‑1 (MQ=255) tAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCTCAGTTGTGATAAGCGCAGTGGAGTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAAGTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TGTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGa < 1:1055856/238‑1 (MQ=255) tAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGa < 1:740794/239‑1 (MQ=255) tAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGa < 2:686263/238‑1 (MQ=255) tAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTAGTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGa < 2:242623/238‑1 (MQ=255) aGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGCA‑TTTTTTC‑AAACAAAT‑ACAAAAACT‑TGAGCTGTCATGATG‑A‑GGGGAAGaaaaaa > 2:712962/1‑239 (MQ=255) cTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTTT‑AGACAAAT‑ACAAAAAAT‑TGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGgaataaaa > 2:355353/1‑237 (MQ=255) aTTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCaa < 2:62281/239‑1 (MQ=255) aTTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCaa < 2:975910/239‑1 (MQ=255) ttCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAAc < 2:367731/239‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAACAgg < 2:275370/236‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGc < 2:218379/237‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCACGTGTGATAAGCGAAGTGTATTT‑CGCAAAACATAGCCATTCCCTGTTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGAGTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACAGTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGc < 1:990895/237‑1 (MQ=255) tCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGGA‑TTTTTTC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑TGAGTTTCCACGATG‑A‑GCGGAAGAAATAAAAAACAGGCAGt > 2:1000215/1‑239 (MQ=255) cGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTTC‑AGACAAAC‑ACAAAAAAG‑TGAGATGGCATGATT‑A‑GGGAAAGGAAAAAAAAAAAGGcggca > 2:530927/1‑235 (MQ=255) aTTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATaa < 2:1012099/239‑1 (MQ=255) aTTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATaa < 2:466571/239‑1 (MQ=255) tCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAg < 2:778721/236‑1 (MQ=255) cGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTTC‑AGAAAAAT‑AAAAAAACA‑TGAGGTGCCATTATGAA‑GCG‑AAGAAATAAACCAAAGGCAATGAAAAAATTGaa > 2:877394/1‑238 (MQ=255) ttGTGATAAGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGGA‑TTTTTTC‑CAACAAATAAAAAAAACT‑GG‑GTTGTCCTTGTG‑G‑GGGGAAGTAATAAGCAACAAGCCGGGAAAAAATTGGCAggga > 2:513028/1‑239 (MQ=255) aGCGCAGTTTATTT‑CGCAAAACATTGCAATTCACTGCTCTGTCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTTATTCACGAACTGTTAATTACATATTCCCGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGTTAAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCt < 1:530927/239‑1 (MQ=255) aGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGGA‑TTTTTTC‑TTACCAAA‑AAAAAAAAT‑GGAGGTGCCCTTGTG‑G‑GCGAAAAAAATAAACAACAAGGAGAGAAAAAGTTGACAGAGAGTGTTGCt > 2:803893/1‑239 (MQ=255) aGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCt < 1:1055200/239‑1 (MQ=255) aGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCt < 1:364770/239‑1 (MQ=255) aGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCt < 2:763793/239‑1 (MQ=255) tgtATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGGA‑TTTTTTC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGGCATGATG‑A‑GCGAAAGAAATAAACAACAGGCAGAGAAAAAATTGACAGAGAATGTCGCTAAAtttt > 2:944415/1‑238 (MQ=255) tgtATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGGGAA‑ATTTTTA‑AAACAAAA‑AAAAAAAAT‑GGAGTTTGCATTGAG‑G‑GAGGAATGAATAAGCAAAAAAAAGGGAAAAAGATGACAGCAAATGTCACTAACtttt > 1:660806/1‑238 (MQ=255) tATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGa < 2:279907/184‑1 (MQ=255) tt‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCC‑GAAAAAAA‑AAAAAAATT‑GGAGTTG‑CATGATG‑AGGCGAAA‑TAATAAACAAAAAGAAAGGGATAAAGTGAAAGAAAATGTCGATAACTTTaacac > 1:475308/1‑234 (MQ=255) tt‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTTC‑AGACAAAA‑AAAAAAACA‑GGAGTTTCCATGTTG‑G‑GCGAAAGTAATAAACAACACGCAGGGAATAAAATGACAGAGATTGTCGCTAACTTTAcatcc > 2:1158443/1‑235 (MQ=255) cGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTTC‑CGACAAAT‑ACAAAAAAT‑GGGGTTGGCATTGTT‑G‑GGGAAAGGAATAAAAAACAAGCAGGGGATAAGTTTTCAGAGAATTTCGCCAAATTTTCccccca > 2:834286/1‑237 (MQ=255) aaaaCATTGCGCTCCCCTTCTGGTGCAAAAAATTTATTCTTATTTTCGCGTGGATTCACAAACTTTAAATGAAATATTCACGGGGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTGGGGGTGTGTGGGGGCGGGAAA‑TTTTTCC‑AAAAAAAT‑AAAAAAACG‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCAAAAGTAAAAAGCAACAGGAGGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAAATTCACCGCCATGAt < 1:785710/239‑1 (MQ=255) aaaaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTTC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGGGTTGCCATGATG‑A‑GGGAAAGTAATAAGAAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGAt > 2:618666/1‑239 (MQ=255) aaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTTC‑AGAAAAAA‑AAAAAAAAA‑GGGGGTGCCATGATG‑A‑GGGAAAGAAATAAAAAAAAAGGAGTGAATAAGTTGACAGAGATTTTTGCTAAATTTACCGCCATGAttt > 2:190459/1‑239 (MQ=255) aaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTTC‑AAACAAAA‑AAAAAAAAT‑GGAGTTTCCCTTATT‑A‑GGGGAAGTAATAAACAAAAAGCAGGGAATAAATTGTAAAAGAATTGCGCTAAAttttaccccctagttt > 2:647802/1‑226 (MQ=255) cATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTTC‑AGACAAAA‑AAAAAAAAT‑TGAGTTGCCATGATG‑A‑GGGAAAGTAATAAACAACAGGGAGTGAATAAATTGACAGAGATTGTTGCTAACTTTACCGCCCTTAttttt > 2:847286/1‑237 (MQ=255) cATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGATTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGa < 2:441689/239‑1 (MQ=255) cATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTACGCTTTGATTCACAAACTGTTAATTACATATTCACGGGGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTAAA‑TTTTTCC‑AGAAAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAATAAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGa < 1:422381/239‑1 (MQ=255) aTTCCCTGCTCTGGCGCAATATTAATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACAAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTGGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGTCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGTTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGaa < 1:707159/239‑1 (MQ=255) ttCCCTGCTCTGGCGCAATATTCTTTTTTATTTTCGTGTAGATTCACGAACTTTTAATTAAATATCCGCGGTGGAAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTATTTTGTGGCGGTAAT‑TTTTTCA‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTGGCCAGGATG‑A‑GCAAAAGTAATAAGAAACAGGCAGTAAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAt < 1:834286/239‑1 (MQ=255) cccTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTTC‑AGAAAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGGTGTCATGATG‑G‑GAGAAAGGAATAAACAAAAAGCAGTGAATAAAGTGAAAGAGATTGTTGCTAAATTTTACGCCATGATTTTTTCCCCAATg > 2:422381/1‑238 (MQ=255) ctctGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGGA‑TTTTTTC‑AGACAAAA‑ACAAAAACT‑TGAGTTGCCATGATG‑A‑GGGAAAGGAATAAGAAACAGACAGTGAATAAGTTGACACAGATTGTCGCTAAATTTTCCCCCCAGATTTCTACCCCAATGCCtgat > 2:1089593/1‑239 (MQ=255) ttttaatttTTATTATCGGTTTGATTCACAAACTGTTAATTACATATTCGTGGGGGAAAAAAAAAAAAAACCACATTTTTGGGTGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTCCC‑AGAAAAAT‑AAAAAAACG‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCAAAAGTAAAAAGCAACAGGCAGTAAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 1:1037681/234‑1 (MQ=255) tatttattTTTATTGTAGGTTTGATTCACGAATTGTTAATTAAATTTTCAGGGTGGAAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGGGGGAAA‑TTTTTCA‑AAAAAAAT‑AAAAAAACG‑GGGTTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGTTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 1:647802/239‑1 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTTCGCTTTAATTCACGAACTTTTAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTATTTTGTGGCGGTAAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GAAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAATTAATAAGCAACAGGCAGTAAATAAGTTAACAGAGATTGTCGCTACCTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 2:1098660/239‑1 (MQ=255) aattcattcTTATTTTCGTGTTGATTCACAACGTGTTAATTAAATATTCCCGGGGGAAAAAAAAATAAAACCACATTTTAAGTGGAAGTTTGTGGGGGTGAA‑TTTTCCA‑AGACAAAA‑AAAAAAACT‑GGAGTGGCCAGGAGG‑A‑GCAAAAGTAAAAAGCAAAAGCAGGTAAATAATTTAAAAGAGATTGTCGTTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 1:1225991/238‑1 (MQ=255) cTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATGCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AAACAAAT‑AAAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaa < 2:877032/239‑1 (MQ=255) tATTTTCGGGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGCGGTAAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACG‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 2:1166046/239‑1 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACGAACTTTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTCCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 2:724782/239‑1 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGCGAA‑TATTTTT‑CGAAAAAA‑AAAAAAAAA‑GTAGGTGTCATGATG‑A‑GCGGAAATAATAAAAAACAAACAGGGAAAAAAAAGACAGAGAATGTCGCTAAATTTTACGACATAATTTTTACCCCAATGCCTGAGTACGAGGGGGGGAAACTaaaa > 1:697045/1‑239 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACAAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTATTTGGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑AAAAAAACG‑GGAGTTGCAAGGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGAGAATAAGTTGAAAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 2:980562/239‑1 (MQ=255) tATTTTCGCGTTAATTCACGAATTTTTAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑AAAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GTGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGGGATTTTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 2:901204/239‑1 (MQ=255) gcgTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTTC‑ATACAAAA‑AAAAAAACT‑TGAGTTGCCCTGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAACAACAAGCAGTGAATAAATTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTTTAACCCAATGCCTGATTACGTGGGGGGTAAACTACAACAACTaa > 2:459662/1‑239 (MQ=255) ttGATTCACGAACTGTTAATTACATTTCCACGGTGGCAAAAAATAAAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GAATTTGCCATGATG‑A‑GCAAAATTAATAAGCAACAGGCAGTAAATAAGTTAACAGAATTTGTCGTTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAg‑g < 2:770039/239‑1 (MQ=255) gaattaccgactttttaattaaATTTTCCTGGTGGAAAAAAAAAAAAAACACCTTTTTAAGGGGTAGTTGTGGGCGGGAAG‑TTTTTCA‑AAACAAAA‑ACAAAAAAG‑GGTGTGGCAATTATG‑A‑GTGAATGAAATAAACAACGGGCATTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAg‑g < 1:851108/224‑1 (MQ=255) tGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGtaat < 2:858098/120‑1 (MQ=255) ttAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTATTTTGTGGCGGTAAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑AAAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAAcgtcgt < 2:1046637/239‑1 (MQ=255) ttACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGAt < 2:972372/239‑1 (MQ=255) atatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑ATTTTTT‑AAACAAAA‑ACAAAAAAT‑TGAGTTTCCCTGATT‑A‑GCGAAAGTAATAAACAACAAGCAATGAATAAAATGAAAGAGAATGTTGCCAACTTTACCCCCCACATTTTTTACCCCATGCCTGATGACGTGGTGGGTAAACTAAAAAAAACAAAA‑GATGCCCGAACGCCGTCGGTgggg > 1:9497/1‑239 (MQ=255) ttttaagggTGGAAAAAAATAAAAAACCAAATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGAGGTGAA‑TTTTTCA‑AGAAAAAA‑AAAAAAACG‑GGAGTTGCAATGATG‑A‑GCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAGGTTGACAGAGATTGTGGTTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:618666/232‑1 (MQ=255) tatTCCCGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTAAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 2:593341/239‑1 (MQ=255) tatTCAGGGTGGAAAAAAATAAAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGAAAAAT‑ACAAAACCT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCAAAAGAAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGTTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 2:559706/239‑1 (MQ=255) tatTCACGGTGGAAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGAAAAAT‑AAAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGAAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 2:1193615/239‑1 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGGA‑TTTTTTC‑AAACAAAT‑ACAAAAAAT‑TGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGGAAGTAATAAGCAACAAGCAGGGAATAAATTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTTCCCCCACGATTTTTACCCGAATGCCTGATGAAGTGGGGGGTAAAAATAAACAACTAAAGAGAGGCCCAAAccaggcgggtgggga > 2:834004/1‑225 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTTC‑CGACAAAA‑ACAAAAACT‑GGAGTTGTCAAGATG‑G‑GCGGAAGGAATAAAAAAAAAGCAGAGAATAAATTGACAGAGATTTTTGCTAACTTTACCGCCATGATTTTTACCCGAATGCCTGATGACGGGGGGGGTAAACTAAAAAAGCTAAAA‑GATGCCCaaaaagcggcgcaggggga > 2:414315/1‑223 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTTC‑AGACAAAT‑ACAAAAAATGGGAGTTG‑CATGGTG‑G‑GCGGAAGGAATAAGCAAAAAGCAGTGAAAAAATTGACAAAGATTGTCGCTAAATTTTACGCCCTGAATTCTAACCCAATGCCTTATGACGTGGGGGGTAAAATAAAACAACTAAAA‑GAAGCCCAAAAGTACTCGATggggga > 2:789931/1‑237 (MQ=255) tCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGGA‑TTTTTTC‑AGACAAAT‑ACAAAAAAA‑GGAGTTGGCATTATT‑G‑GCGAAAGAAAAAAGCAACAAGCAGTGAATAAATTTACAGAAAATGTCGCTAACTTTACCCCCACGATTTTTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGGTAAACTAAAACAACCAAAA‑GATGCCGAAACACCGTCGCTGGGGgaaa > 2:1128967/1‑239 (MQ=255) tCACGGGGAAAAAAAATAAAAAACCAAATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑TGAAAAAA‑AAAAAAACG‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTCGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGaaaa < 1:803893/239‑1 (MQ=255) aCGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑ATTTTTC‑AGACAAAA‑AAAAAAACT‑TGAGGTGTCCTGGTG‑G‑GCGAAAGTAAAAAGAAACAGACAGAGAATAAGTTGACAGAGAGTGTCGGTAAATTTACCGCCCTGATTTCTACCCGAATACCTGATTAAGTGGTGGTTAAACTAAAACAACTAAAG‑AATGACGAAACGTCGTCGGGGGGGgaaaat > 1:162693/1‑237 (MQ=255) aCGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑ATTTTTC‑AAAAAAAA‑AAAAAAAAA‑GGGGGTGGCATGAGG‑A‑GCGGAAGAAAAAAAAAAAAGAAAGAGAAAAAAATGAAAGAGATTGTTGCTAACTTTACAGCCAGGATTTCTTCCAGAATGACGGGTGAGGGGGGGGGTAAAATAAAAAAACTAAAA‑GATGCCGAAAAACGGTCGGTGGGGgaaaat > 1:947587/1‑237 (MQ=255) gtgaaaaaaaaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGCGGTAAA‑TTTTCCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACG‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGGCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAAtt < 2:697045/231‑1 (MQ=255) gTGGCAAAAAATATAAAACCCCATTTTTAGTGTTATTTTGGGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGCAAAAT‑AAAAAAACG‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 2:352262/238‑1 (MQ=255) gTGGAAAAAAAAATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTGGTGGCGGTGAA‑TTTTTCA‑AAAAAAAT‑ACAAAAACG‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGTAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 1:1210753/238‑1 (MQ=255) gTGGAAAAAAAAAAAAACCCACATTTTAGGTGGGAGTTGGTGGGGGAAAA‑TTTTCAC‑AGACAAAT‑AAAAAAAGT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCAAAATAAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTAACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 1:355353/238‑1 (MQ=255) gaaaaaaaaaaaaaACCCCATTTTTAGGGGGGGTTTGTGGGGGTGAA‑ATTTTCC‑AAAAAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTCCCATGAAG‑G‑GCAAAAGTAAAAAGAAACCGGCGGTGAATAAGTTAACAGAGATTGCCGCAAATTTAACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTa < 1:944415/236‑1 (MQ=255) gaaaaaaaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTCCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 2:462259/182‑1 (MQ=255) aaaaTTTAAACCCACATTTTTTGT‑GTTGTTTGTTGGGGGGAA‑TTTTTCCAAAAAAAAT‑AAAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑G‑TCGAAAGATATAAGCAACAGCCGTTGAAAAAGTAGACAGGTATTGTAGTTAATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATa < 1:965279/239‑1 (MQ=255) aaTATAAAACCAGAGTAATAGTGTTGTTTTTGGGCGATGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACG‑GAAGTAGCAATGATG‑A‑CGAAAAGTAATAGGAAACGGGCAGTCAATAATTTGACGGAGTTTGTGTAAAATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 2:48150/239‑1 (MQ=255) aaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTAAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 2:162693/239‑1 (MQ=255) aaTATAAAACCACAGTTTTGTTGGTAGTTTGTGG‑GGTGAA‑ATTTTCCAAGACAAAT‑AAAAAACCT‑GGGGTTGCTATGATG‑A‑GCGAAAGAAATACGCAACAGGGGGTAAATAAGTTGACAGGGATTGTCTATAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 1:1158443/239‑1 (MQ=255) aaTAAAAACCCAAATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGCGGTGAA‑TTTTTCA‑AAACAAAA‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCAATGATG‑A‑GCGAAAGAAAAAAGAAACAGGCAGTAAATAAGTTAACAGAGTTTGTCGCTAATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 1:1223418/239‑1 (MQ=255) ccACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTCCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACG‑GGAGTTGCCATGAGG‑A‑GCAAAAATAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGATAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGac < 2:7546/239‑1 (MQ=255) atttgttgGGGGTGAA‑TTGTTCC‑AGACAATT‑ACAAAAACA‑GGAGTTGCCATAATG‑A‑GGTAAAGTAATAAGCAACAGGCAGGAAATAAGTTGACAGGTATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 2:452729/233‑1 (MQ=255) gTTTGTGGCTGTAAA‑TTTTTCA‑AAAAAAAA‑AAAAAACCT‑GGAGTGGCCATGAGA‑T‑GCAAAAGAAAAAAGCAACAGGCAGTAAATAAGTTGACAGAGTTTGTCGTTAATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 1:1089593/238‑1 (MQ=255) gtgGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTAAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGAc < 2:1037511/239‑1 (MQ=255) tgGCGTTAAA‑TTTTTCA‑AAAAAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCAAGATG‑A‑GAGAAAGAAATAAGCAACGGGCAGTGAATAAGTGGAAGGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGAc < 1:459662/238‑1 (MQ=255) tgGCGGAAAA‑TTTTGAC‑AGAAAAAT‑ACAAAAACT‑GAAGGGGCAATGATG‑A‑GCGAAAAAAATAAGCAAAAGGCGTTGAATAAGTGGAAAGAAAGTGTCGAAACCTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGGCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGAc < 1:712962/238‑1 (MQ=255) ggggggtaattttttCC‑AACAAAAA‑ACAAAAACG‑GGAGTGGCCATGATG‑G‑GCGAAAGAAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGAc < 2:389799/228‑1 (MQ=255) tttttCC‑AGAAAAAA‑AAAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAAAAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGAAAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcc < 2:376748/239‑1 (MQ=255) ttccc‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTGGCCATGATG‑A‑GCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAAATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctg < 2:1136401/236‑1 (MQ=255) aGAAAAAA‑ACAAAAATT‑GGAGTTGCCAAGATG‑A‑GCGAAAGTAAAAAGCAACAGGAAGTGAAAAAGTTGACAGAGATTTGCGCTAATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTTCCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGt < 2:817651/239‑1 (MQ=255) | AACGATTTCTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTT‑CGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGT > NC_000913/3206201‑3206673 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |