Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,206,485 | C→A | 16.6% | Q9K (CAG→AAG) | ttdA → | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,206,485 | 0 | C | A | 16.6% | 229.5 / 9.3 | 115 | Q9K (CAG→AAG) | ttdA | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (26/66); new base A (14/6); total (40/75) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.01e-04 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
TTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCC > NC_000913/3206247‑3206723 | ttCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AAc < 2:1068312/239‑1 (MQ=255) ttCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AAc < 2:367731/239‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAgg < 2:275370/236‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCACGTGTGATAAGCGAAGTGTATTTCGCAAAACATAGCCATTCCCTGTTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGAGTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACAGTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGc < 1:990895/237‑1 (MQ=255) cGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTTC‑AGACAAAC‑ACAAAAAAGTGAGATGGCATGATT‑A‑GGGAAAGGAAAAAAA‑AAAAGGcggca > 2:530927/1‑235 (MQ=255) aTTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATaa < 2:1012099/239‑1 (MQ=255) aTTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATaa < 2:466571/239‑1 (MQ=255) tCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAg < 2:778721/236‑1 (MQ=255) cGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTTC‑AGAAAAAT‑AAAAAAACATGAGGTGCCATTATGAA‑GCG‑AAGAAATAAAC‑CAAAGGCAATGAAAAAATTGaa > 2:877394/1‑238 (MQ=255) ttGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGGA‑TTTTTTC‑CAACAAATAAAAAAAACTGG‑GTTGTCCTTGTG‑G‑GGGGAAGTAATAAGC‑AACAAGCCGGGAAAAAATTGGCAggga > 2:513028/1‑239 (MQ=255) aGCGCAGTTTATTTCGCAAAACATTGCAATTCACTGCTCTGTCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTTATTCACGAACTGTTAATTACATATTCCCGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGTTAAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCt < 1:530927/239‑1 (MQ=255) aGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGGA‑TTTTTTC‑TTACCAAA‑AAAAAAAATGGAGGTGCCCTTGTG‑G‑GCGAAAAAAATAAAC‑AACAAGGAGAGAAAAAGTTGACAGAGAGTGTTGCt > 2:803893/1‑239 (MQ=255) aGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCt < 2:763793/239‑1 (MQ=255) aGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCt < 1:1055200/239‑1 (MQ=255) aGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCt < 1:364770/239‑1 (MQ=255) tgtATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGGA‑TTTTTTC‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGGAGTTGGCATGATG‑A‑GCGAAAGAAATAAAC‑AACAGGCAGAGAAAAAATTGACAGAGAATGTCGCTAAAtttt > 2:944415/1‑238 (MQ=255) ttCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCC‑GAAAAAAA‑AAAAAAATTGGAGTTG‑CATGATG‑AGGCGAAA‑TAATAAAC‑AAAAAGAAAGGGATAAAGTGAAAGAAAATGTCGATAACTTT‑aacac > 1:475308/1‑234 (MQ=255) ttCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTTC‑AGACAAAA‑AAAAAAACAGGAGTTTCCATGTTG‑G‑GCGAAAGTAATAAAC‑AACACGCAGGGAATAAAATGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑Acatcc > 2:1158443/1‑235 (MQ=255) cGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTTC‑CGACAAAT‑ACAAAAAATGGGGTTGGCATTGTT‑G‑GGGAAAGGAATAAAA‑AACAAGCAGGGGATAAGTTTTCAGAGAATTTCGCCAAATTT‑TCccccca > 2:834286/1‑237 (MQ=255) cGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGGGAA‑TTTTTTC‑AGAAAAAA‑AAAAAAAACGGGGTTTCCCATATG‑G‑GCGAAAGAAAAAAACAAAAAGACAG‑GAATAAAGTGTAAAAGATTGTTGCTAACTTT‑Tcccacat > 2:1223418/1‑234 (MQ=255) aaaaCATTGCGCTCCCCTTCTGGTGCAAAAAATTTATTCTTATTTTCGCGTGGATTCACAAACTTTAAATGAAATATTCACGGGGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTGGGGGTGTGTGGGGGCGGGAAA‑TTTTTCC‑AAAAAAAT‑AAAAAAACGGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCAAAAGTAAAAAGC‑AACAGGAGGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAAATTC‑ACCGCCATGAt < 1:785710/239‑1 (MQ=255) aaaaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTTC‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGGGGTTGCCATGATG‑A‑GGGAAAGTAATAAGA‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGAt > 2:618666/1‑239 (MQ=255) aaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTTC‑AGAAAAAA‑AAAAAAAAAGGGGGTGCCATGATG‑A‑GGGAAAGAAATAAAA‑AAAAAGGAGTGAATAAGTTGACAGAGATTTTTGCTAAATTT‑ACCGCCATGAttt > 2:190459/1‑239 (MQ=255) aaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTTC‑AAACAAAA‑AAAAAAAATGGAGTTTCCCTTATT‑A‑GGGGAAGTAATAAAC‑AAAAAGCAGGGAATAAATTGTAAAAGAATTGCGCTAAAttttaccccctagttt > 2:647802/1‑226 (MQ=255) cATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTTC‑AGACAAAA‑AAAAAAAATTGAGTTGCCATGATG‑A‑GGGAAAGTAATAAAC‑AACAGGGAGTGAATAAATTGACAGAGATTGTTGCTAACTTT‑ACCGCCCTTAttttt > 2:847286/1‑237 (MQ=255) cATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGGATTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGa < 2:441689/239‑1 (MQ=255) cATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTACGCTTTGATTCACAAACTGTTAATTACATATTCACGGGGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTAAA‑TTTTTCC‑AGAAAAAT‑ACAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAATAAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGa < 1:422381/239‑1 (MQ=255) aTTCCCTGCTCTGGCGCAATATTAATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACAAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGGAGTGGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGTCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGTTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGaa < 1:707159/239‑1 (MQ=255) tCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGAGAA‑ATTTTTC‑AAAAACAA‑ACAAAAAATGGAGTTTCGAAGAAG‑A‑GCGAAAATAATAAAC‑AACAAGCAGTGAATAAATTTACAGAGATTTTCACTAAATTT‑ACAACCATGATTTCtcacacaat > 1:1136401/1‑230 (MQ=255) ttttaatttTTATTATCGGTTTGATTCACAAACTGTTAATTACATATTCGTGGGGGAAAAAAAAAAAAAACCACATTTTTGGGTGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTCCC‑AGAAAAAT‑AAAAAAACGGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCAAAAGTAAAAAGC‑AACAGGCAGTAAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 1:1037681/234‑1 (MQ=255) tatttattTTTATTGTAGGTTTGATTCACGAATTGTTAATTAAATTTTCAGGGTGGAAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGGGGGAAA‑TTTTTCA‑AAAAAAAT‑AAAAAAACGGGGTTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGTTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 1:647802/239‑1 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTTCGCTTTAATTCACGAACTTTTAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTATTTTGTGGCGGTAAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGAAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAATTAATAAGC‑AACAGGCAGTAAATAAGTTAACAGAGATTGTCGCTACCTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 2:1098660/239‑1 (MQ=255) aattcattcTTATTTTCGTGTTGATTCACAACGTGTTAATTAAATATTCCCGGGGGAAAAAAAAATAAAACCACATTTTAAGTGGAAGTTTGTGGGGGTGAA‑TTTTCCA‑AGACAAAA‑AAAAAAACTGGAGTGGCCAGGAGG‑A‑GCAAAAGTAAAAAGC‑AAAAGCAGGTAAATAATTTAAAAGAGATTGTCGTTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 1:1225991/238‑1 (MQ=255) cTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATGCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AAACAAAT‑AAAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaa < 2:877032/239‑1 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACGAACTTTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTCCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCAAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 2:724782/239‑1 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑ATTTTTA‑AAACAAAT‑ACAAAAAATGGAGGTTGCATGGTG‑G‑GAGAAAGTAAATAGC‑AACAAGAAGAGAATAAGATGACAGAGATTGTAGCTCAATTT‑AACGCAACGGATTTTAAACGAATGCCTGATATAGCGGTGAGGAAACTaaaa > 1:686417/1‑239 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGCGAA‑TATTTTT‑CGAAAAAA‑AAAAAAAAAGTAGGTGTCATGATG‑A‑GCGGAAATAATAAAA‑AACAAACAGGGAAAAAAAAGACAGAGAATGTCGCTAAATTT‑TACGACATAATTTTTACCCCAATGCCTGAGTACGAGGGGGGGAAACTaaaa > 1:697045/1‑239 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACAAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTATTTGGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑AAAAAAACGGGAGTTGCAAGGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGAGAATAAGTTGAAAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 2:980562/239‑1 (MQ=255) gcgTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTTC‑ATACAAAA‑AAAAAAACTTGAGTTGCCCTGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAAC‑AACAAGCAGTGAATAAATTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTTTAACCCAATGCCTGATTACGTGGGGGGTAAACTACAACAACTaa > 2:459662/1‑239 (MQ=255) ttGATTCACGAACTGTTAATTACATTTCCACGGTGGCAAAAAATAAAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGAATTTGCCATGATG‑A‑GCAAAATTAATAAGC‑AACAGGCAGTAAATAAGTTAACAGAATTTGTCGTTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAg‑g < 2:770039/239‑1 (MQ=255) gaattaccgactttttaattaaATTTTCCTGGTGGAAAAAAAAAAAAAACACCTTTTTAAGGGGTAGTTGTGGGCGGGAAG‑TTTTTCA‑AAACAAAA‑ACAAAAAAGGGTGTGGCAATTATG‑A‑GTGAATGAAATAAAC‑AACGGGCATTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAg‑g < 1:851108/224‑1 (MQ=255) ttAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTATTTTGTGGCGGTAAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑AAAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAAcgtcgt < 2:1046637/239‑1 (MQ=255) ttAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑AAAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGAt < 2:420869/174‑1 (MQ=255) ttACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGAt < 2:972372/239‑1 (MQ=255) ttAAATATTCACGGTGAAAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGGGGTAGTTTGGGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGAAAAAA‑ACAAAAACTGGAGTTGCCAGGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGAt < 1:994363/239‑1 (MQ=255) ttttaagggTGGAAAAAAATAAAAAACCAAATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGAGGTGAA‑TTTTTCA‑AGAAAAAA‑AAAAAAACGGGAGTTGCAATGATG‑A‑GCAAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAGGTTGACAGAGATTGTGGTTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:618666/232‑1 (MQ=255) tatTCCCGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTAAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCAAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 2:593341/239‑1 (MQ=255) tatTCAGGGTGGAAAAAAATAAAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGAAAAAT‑ACAAAACCTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCAAAAGAAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGTTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 2:559706/239‑1 (MQ=255) tatTCACGGTGGAAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGAAAAAT‑AAAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGAAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 2:1193615/239‑1 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGGA‑TTTTTTC‑AAACAAAT‑ACAAAAAATTGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGGAAGTAATAAGC‑AACAAGCAGGGAATAAATTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑TCCCCCACGATTTTTACCCGAATGCCTGATGAAGTGGGGGGTAAAAATAAACAACTAAAGAGAGGCCCAAAccaggcgggtgggga > 2:834004/1‑225 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTTC‑CGACAAAA‑ACAAAAACTGGAGTTGTCAAGATG‑G‑GCGGAAGGAATAAAA‑AAAAAGCAGAGAATAAATTGACAGAGATTTTTGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTTTACCCGAATGCCTGATGACGGGGGGGGTAAACTAAAAAAGCTAAAA‑GATGCCCaaaaagcggcgcaggggga > 2:414315/1‑223 (MQ=255) tCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGGA‑TTTTTTC‑AGACAAAT‑ACAAAAAAAGGAGTTGGCATTATT‑G‑GCGAAAGAAAAAAGC‑AACAAGCAGTGAATAAATTTACAGAAAATGTCGCTAACTTT‑ACCCCCACGATTTTTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGGTAAACTAAAACAACCAAAA‑GATGCCGAAACACCGTCGCTGGGGgaaa > 2:1128967/1‑239 (MQ=255) tCACGGGGAAAAAAAATAAAAAACCAAATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑TGAAAAAA‑AAAAAAACGGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTCGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGaaaa < 1:803893/239‑1 (MQ=255) aCGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑ATTTTTC‑AAAAAAAA‑AAAAAAAAAGGGGGTGGCATGAGG‑A‑GCGGAAGAAAAAAAA‑AAAAGAAAGAGAAAAAAATGAAAGAGATTGTTGCTAACTTT‑ACAGCCAGGATTTCTTCCAGAATGACGGGTGAGGGGGGGGGTAAAATAAAAAAACTAAAA‑GATGCCGAAAAACGGTCGGTGGGGgaaaat > 1:947587/1‑237 (MQ=255) gtgaaaaaaaaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGCGGTAAA‑TTTTCCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACGGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGGCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAAtt < 2:697045/231‑1 (MQ=255) gTGGCAAAAAATATAAAACCCCATTTTTAGTGTTATTTTGGGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGCAAAAT‑AAAAAAACGGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCAAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 2:352262/238‑1 (MQ=255) gTGGAAAAAAAAATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTGGTGGCGGTGAA‑TTTTTCA‑AAAAAAAT‑ACAAAAACGGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGTAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 1:1210753/238‑1 (MQ=255) gTGGAAAAAAAAAAAAACCCACATTTTAGGTGGGAGTTGGTGGGGGAAAA‑TTTTCAC‑AGACAAAT‑AAAAAAAGTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCAAAATAAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTAACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 1:355353/238‑1 (MQ=255) gaaaaaaaaaaaaaACCCCATTTTTAGGGGGGGTTTGTGGGGGTGAA‑ATTTTCC‑AAAAAAAT‑ACAAAAACTGGAGTTCCCATGAAG‑G‑GCAAAAGTAAAAAGA‑AACCGGCGGTGAATAAGTTAACAGAGATTGCCGCAAATTTA‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTa < 1:944415/236‑1 (MQ=255) gaaaaaaaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTCCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 2:462259/182‑1 (MQ=255) aaaaTTTAAACCCACATTTTTTGT‑GTTGTTTGTTGGGGGGAA‑TTTTTCCAAAAAAAAT‑AAAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑G‑TCGAAAGATATAAGC‑AACAGCCGTTGAAAAAGTAGACAGGTATTGTAGTTAATTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATa < 1:965279/239‑1 (MQ=255) aaTATAAAACCAGAGTAATAGTGTTGTTTTTGGGCGATGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACGGAAGTAGCAATGATG‑A‑CGAAAAGTAATAGGA‑AACGGGCAGTCAATAATTTGACGGAGTTTGTGTAAAATTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 2:48150/239‑1 (MQ=255) aaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTAAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCAAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 2:162693/239‑1 (MQ=255) aaTATAAAACCACAGTTTTGTTGGTAGTTTGTGG‑GGTGAA‑ATTTTCCAAGACAAAT‑AAAAAACCTGGGGTTGCTATGATG‑A‑GCGAAAGAAATACGC‑AACAGGGGGTAAATAAGTTGACAGGGATTGTCTATAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 1:1158443/239‑1 (MQ=255) aaTAAAAACCCAAATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGCGGTGAA‑TTTTTCA‑AAACAAAA‑ACAAAAACTGGAGTTGCAATGATG‑A‑GCGAAAGAAAAAAGA‑AACAGGCAGTAAATAAGTTAACAGAGTTTGTCGCTAATTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 1:1223418/239‑1 (MQ=255) atttgttgGGGGTGAA‑TTGTTCC‑AGACAATT‑ACAAAAACAGGAGTTGCCATAATG‑A‑GGTAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGGAAATAAGTTGACAGGTATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 2:452729/233‑1 (MQ=255) aGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAAAAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 2:660806/239‑1 (MQ=255) gTTTGTGGGGGTGAA‑TTTCACG‑AAACAAAT‑ACAAAAACTGGAGTTGCCAAGATG‑A‑GCAAAAGAAATAAAC‑AAGGGGCGTTGAAAAAGTGAACAGATATTGTCGATACTTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 1:14921/238‑1 (MQ=255) gTTTGTGGCTGTAAA‑TTTTTCA‑AAAAAAAA‑AAAAAACCTGGAGTGGCCATGAGA‑T‑GCAAAAGAAAAAAGC‑AACAGGCAGTAAATAAGTTGACAGAGTTTGTCGTTAATTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 1:1089593/238‑1 (MQ=255) gtgGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTAAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGAc < 2:1037511/239‑1 (MQ=255) tgGCGTTAAA‑TTTTTCA‑AAAAAAAT‑ACAAAAACTGGAGTTGCCAAGATG‑A‑GAGAAAGAAATAAGC‑AACGGGCAGTGAATAAGTGGAAGGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGAc < 1:459662/238‑1 (MQ=255) tgGCGGAAAA‑TTTTGAC‑AGAAAAAT‑ACAAAAACTGAAGGGGCAATGATG‑A‑GCGAAAAAAATAAGC‑AAAAGGCGTTGAATAAGTGGAAAGAAAGTGTCGAAACCTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGGCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGAc < 1:712962/238‑1 (MQ=255) ggggggtaattttttCC‑AACAAAAA‑ACAAAAACGGGAGTGGCCATGATG‑G‑GCGAAAGAAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGAc < 2:389799/228‑1 (MQ=255) tttttCC‑AGAAAAAA‑AAAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAAAAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGAAAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcc < 2:376748/239‑1 (MQ=255) attttacaaaaaaaaT‑AAAAAAACGGGAGTGGCCATGATG‑A‑ACGAAAGTAAAAACC‑AACAGGAGGGAAAAAAGTTGACAGAAATGGCCCATAACTTT‑CCCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTc < 1:1128967/227‑1 (MQ=255) ttccc‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGGAGTGGCCATGATG‑A‑GCAAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAAATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctg < 2:1136401/236‑1 (MQ=255) ttacaaaaaaaa‑acaaaaacGGGGTTTGCCATGGAA‑G‑GCAAAAGAAAAAAAC‑AAAAGGCAGTGAATAAGTTGAAAGAGATTGGCGCTAATTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctgc < 1:847286/231‑1 (MQ=255) tCC‑AGAAAAAT‑AAAAAAACTGGATTTCCAATGATG‑A‑GCGAAAGTAAAAAGC‑AACAGGCAGTAAATAAGTTGACAGAGATTGTCGATAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctgcc < 2:244049/239‑1 (MQ=255) aGAAAAAA‑ACAAAAATTGGAGTTGCCAAGATG‑A‑GCGAAAGTAAAAAGC‑AACAGGAAGTGAAAAAGTTGACAGAGATTTGCGCTAATTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTTCCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGt < 2:817651/239‑1 (MQ=255) aCAAAAACGGGAGTGGCCATTATG‑A‑GCGAAAGTAAAAAGC‑ACGAGTGAGTGAATAATTTGACAGATATTGTCGCTAATTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGacac < 1:1000215/239‑1 (MQ=255) aaaaaGTGGAGTTTCCATGAGG‑A‑GAGAAAGTAAAAACC‑AAAAGTGAGTAAATAAGTTGACAAAGGTTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCg < 1:1150314/239‑1 (MQ=255) aaaaCTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgg < 2:9497/239‑1 (MQ=255) aaaCTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCggg > 2:850849/1‑239 (MQ=255) actgggAGTTGCCAGGAAG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AAAAGGGAGTAAATAAGTGGACAGAGATTGCCCTTATCTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgggg < 1:553213/235‑1 (MQ=255) accgggattggaaatgatg‑A‑GCAAAAGTAAAAAGC‑AACGGGCAGGAAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTA‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgggg < 2:838825/226‑1 (MQ=255) aaCTGGGGTGGCAATGATG‑A‑GCAAAAGAAAAAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAATTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgggg < 1:513028/239‑1 (MQ=255) aaCTGGATTTGCCATAATG‑A‑GCAAAAGCAAAAAGC‑AACAGCATTTCAATAAGTTAAAAGAGATTGTCGTTAGTTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTTATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGTAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTCCCAGCCGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgggg < 2:732324/239‑1 (MQ=255) aGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTa > 1:992747/1‑239 (MQ=255) gCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTATCTTT‑ACCGCCATGACTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGTAAAATTATCTAACATACGATGTTCTACAACATGCAAAAAGCGATTGAACTGACTCGTCATGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGtt > 1:1054914/1‑239 (MQ=255) gatg‑a‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCg > 1:354023/1‑239 (MQ=255) cGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAg > 1:777400/1‑239 (MQ=255) aaaGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGTTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGt < 2:411796/238‑1 (MQ=255) aaaGTAATAACC‑AAAAGCAAGGAAGTAGGTTG‑CAGGGATTGTTGGTAAATTTCGCCGCCCTGATTTCTACCCGAAGGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTCCCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGCCCTGAATCGTCCTGCCTTTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAg < 1:903565/237‑1 (MQ=255) aaGTAATAAGC‑AACAGGAAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTACCTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGt < 1:789931/237‑1 (MQ=255) aGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTccc > 1:212044/1‑237 (MQ=255) cAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTccc > 2:778183/1‑239 (MQ=255) cAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTccc > 2:740291/1‑239 (MQ=255) cAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTcc > 1:1214963/1‑238 (MQ=255) cAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTcc > 2:1122123/1‑238 (MQ=255) cAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTACTCGTTAAAGTCGGCTCCCGCTTcc > 1:642957/1‑238 (MQ=255) | TTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACTGGAGTTGCCATGATG‑A‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCC > NC_000913/3206247‑3206723 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |