Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 3,206,504 | C→A | 11.0% | T15K (ACA→AAA) | ttdA → | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,206,504 | 0 | C | A | 11.0% | 303.0 / 2.6 | 123 | T15K (ACA→AAA) | ttdA | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (42/65); new base A (8/8); total (50/73) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.27e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
TTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGAA‑TTTTTCC‑AGACAAAT‑ACAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGA‑GCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAGATTGTCGCTAACTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAG‑GATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCCACTGCTTGGCGAGCTGC > NC_000913/3206271‑3206740 | ttGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGGA‑TTTTTTC‑CAACAAATAAAAAAAACT‑GG‑GTTGTCCTTGTGG‑GGGGAAGTAATAAGC‑AACAAGCCGGGAAAAAATTGGCAggga > 2:513028/1‑239 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |