| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1396634 | NA (NA) | 4 (0.070) | 4/270 | 8.7 | 6.5% | coding (559/1017 nt) | insH1 | IS5 transposase and trans‑activator |
| ? | NC_000913 | 1428170 = | 61 (0.960) | coding (557/981 nt) | insH1 | IS5 transposase and trans‑activator | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCC > NC_000913/1428030‑1428312 | ccAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTCCCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCCGGCTGAGGGGCCGGCCACTCGTg > 2:70101/1‑143 (MQ=11)ccAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCTGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTg < 1:214635/143‑1 (MQ=21) tcctcGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATc > 2:138598/1‑143 (MQ=35) gcgttggggtgtgGCGCTCCTTGGTGGCCGGCTTTGGCTGAGAGACGTTGTTTCTGTCTTTGTAGCAGGTTATCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGGTGTGGTGGTACCCACGCTGTGTGTCAGGCCACTCTTGGCATc < 2:543107/134‑1 (MQ=2) cctcGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCg > 1:828431/1‑143 (MQ=35) cctcGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCg > 1:756591/1‑143 (MQ=35) tcGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGACTACCCAGCTGATTGAGGTCACGGCCGTTGGCCCCGGTGGTGACCCGGCTGTGGGTCCGGCCCCTCGTGCCATCgcc > 2:97520/1‑141 (MQ=11) gcgcgcCTTGGGAGCGGGCATCGGCTGAGACAAAGGGGTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGGTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTgg < 1:790641/143‑1 (MQ=11) gcgcTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTgg < 1:365479/143‑1 (MQ=34) gcgcTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCGTAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATGGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTgg < 1:275964/143‑1 (MQ=255) gcTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGGGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGc > 2:837709/1‑143 (MQ=21) tgggcgCCGGCATCGGCTGAGACGAATTGCTCCTCTCCAGGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCAt < 2:1004213/138‑1 (MQ=12) tcagccgatgccGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGCCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGc > 1:772959/12‑143 (MQ=255) gTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCGCTGTTGTCATCGACACAAAT‑GTGGGAGTTCACGc > 2:308846/1‑143 (MQ=11) gTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGACCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGCACTTCATGc > 2:195300/1‑143 (MQ=12) tAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCCTGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACGCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGcc > 1:792852/1‑143 (MQ=17) gCATCGGCGGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTg < 1:786270/143‑1 (MQ=17) cGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCAc < 1:735504/143‑1 (MQ=32) gCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCGACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCATCATGCCAAAGTGCCACTg > 2:534020/1‑143 (MQ=17) gagaCAAATTGCGCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCGGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGAtt < 1:773470/143‑1 (MQ=17) gtaCAAATTGCTCCTCGCCATGAGGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTTGCCGCGTTTTTGACCAGGCTGTGGCTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTg < 2:127128/141‑1 (MQ=11) agaCAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGATCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTg < 2:386830/143‑1 (MQ=17) gaCAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGCTTGc > 2:578500/1‑143 (MQ=17) aCAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCCGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGCCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCCTGCCAAAGTGCCACTGCTTGcc > 2:980141/1‑143 (MQ=255) aCAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGcc > 1:661258/1‑143 (MQ=32) aaaTTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCCTCATGCCAAAGTGCCGCTGATTGCCtt > 1:990684/1‑143 (MQ=17) aaTTGCTCCTCTCCATGAAGCAGAGTACCGAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTCGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCttt < 1:559892/143‑1 (MQ=12) tggCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATGGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCt < 2:979990/141‑1 (MQ=17) gcccctcTCCATGAAGCAGATTACCCAGCGGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTg < 1:457060/140‑1 (MQ=17) tcctcTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGCGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTGATGGCAAAGTGCCACTGATTCCTTTTcgcggc > 2:69437/1‑138 (MQ=11) gcctcTCCATGACGCAGATTACCCAGCTGAGTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTCGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGt < 2:216855/142‑1 (MQ=12) cctcTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCACTCTTGGTc > 2:411385/1‑143 (MQ=17) ccgccccATGAGGCCGATTACAGAGCTGCTGGAGGTCGAGCGCGTAGGCCGCGGTGGGGACCTGGCTGTGGGGAAGGCTTCTCATGGCATCGACACGTTT‑GTGAGCCACCTTGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTc < 2:392588/138‑1 (MQ=2) ctcCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGa > 1:836323/1‑143 (MQ=32) gccATGAAGCAGATCACCCAGCTGAGTGAGGTCATGCTCGGTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCGCTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGAt < 2:333591/142‑1 (MQ=11) tgcggcggATTACCCGGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCAt < 2:767233/136‑1 (MQ=0) aaGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCAtct > 1:677219/1‑143 (MQ=11) gTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTATCTTCTGGGTag > 1:687357/1‑143 (MQ=9) gCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTATGTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTCCTTGGTAGCGCt > 2:665491/1‑143 (MQ=255) gCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTCCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATAGCGTTGCTGCTCTTTTTTCGTGGTAGAGCt > 2:482930/1‑143 (MQ=255) gCCGCGGTGGTGACCAGGCTGCGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCACAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCt < 1:13339/143‑1 (MQ=17) cgctGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTgg < 2:692798/143‑1 (MQ=17) cgGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGt > 2:40641/1‑143 (MQ=32) ggtgACCAGGGTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCt < 2:275974/143‑1 (MQ=17) gACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGGATCGCCGGATCGCGGTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCag > 1:327798/1‑142 (MQ=12) aCCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCagt > 1:198823/1‑141 (MQ=17) aCCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAat > 2:986455/1‑143 (MQ=32) cAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGCGTGCCTCAatga > 2:86176/1‑143 (MQ=17) aGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAatgat > 1:1087616/1‑143 (MQ=32) ggCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAatgatg < 1:776955/143‑1 (MQ=32) gCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGGTGGGTGCCTCAATGAggg > 1:660140/1‑143 (MQ=17) cTGGGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCG‑CAACAATCGTTTGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGAtggt < 1:561770/143‑1 (MQ=11) ggtgGGGCAGGCCCCTCGTGGCATCGACGCCAAT‑GCGGGCCGGCATGCCGAAGTGCCTCTGGTTGCCTTTCTTGGTCTGGTGCATCGCCGGGTCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGAtggtg < 2:689827/142‑1 (MQ=11) tgGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGc > 1:422883/1‑143 (MQ=32) gTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATc > 1:799181/1‑143 (MQ=32) gTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATc > 1:283352/1‑143 (MQ=32) gTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTGGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGGCTCACCGATGGTGGCagc > 2:1092243/1‑141 (MQ=255) tCAGGCCACTCTTGGCATCGCCACGAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGGTGCGGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGGTGAGTGCCGCCATGAtggcggggtcc > 2:638242/1‑138 (MQ=11) ctctTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGCTCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGt < 1:917469/143‑1 (MQ=38) tctTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGGGCCTCAATGCTGGTGGCATCCAGCaaggcg > 2:256703/1‑139 (MQ=255) tctTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTCCTCTTTGTTCCTGGTAGGGCTGGGTGCCTCAATGATGCTGGCATCCACCACAGTg > 1:904487/1‑143 (MQ=11) ttGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAGTGACGGACGCCTCCACACAAGTGcc > 2:493998/1‑143 (MQ=11) ttGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATAGACTTTCTTGGTGTGCTGCATCTCCGGATCGCGTGTCTGCACCACGTTCTGGGTAGCGCTGGGTGCATCAGTGTAGGAGGCATcgcccagggggca > 2:637322/1‑131 (MQ=2) | CCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAAT‑GTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTAGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATCCACCAAAGTGCC > NC_000913/1428030‑1428312 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |